Hispanopedia WikiLa Conferencia de Código Abierto en Bioinformática ( BOSC ) es una conferencia académica sobre programación de código abierto y otras prácticas de ciencia abierta en bioinformática , organizada por la Open Bioinformatics Foundation . La conferencia se celebra anualmente desde el año 2000 y tiene lugar durante dos días, ya sea dentro de la conferencia Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) o como una conferencia conjunta con la comunidad Galaxy .
Programa
La conferencia se desarrolla en una única pista que consta de presentaciones, sesiones de pósteres y dos ponencias magistrales a cargo de personas influyentes en bioinformática de código abierto. [ 1 ]
Desde 2010, se ha celebrado un evento informal de dos días llamado "CollaborationFest" (anteriormente Codefest ) justo antes de la conferencia. [ 3 ] [ 4 ]
Historia
Philip Bourne, director asociado de ciencia de datos de los Institutos Nacionales de Salud, y C. Titus Brown pronunciaron discursos de apertura en BOSC 2014. [ 5 ]
BOSC 2016 se organizó en Orlando, Florida, del 8 al 9 de julio, antes de la conferencia principal de ISMB. [ 6 ]
En 2018 y 2020, BOSC se asoció con Galaxy para organizar dos conferencias conjuntas llamadas GCCBOSC y Bioinformatics Community Conference (BCC), respectivamente. [ 7 ] El evento de 2018 se celebró en Portland, Oregón . [ 8 ] La BCC de 2020 tuvo lugar en línea con dos horarios para las zonas horarias del este y del oeste. [ 9 ]
Desde 2021, BOSC se ha celebrado nuevamente dentro de las conferencias de la ISMB. En 2023, BOSC tuvo lugar en Lyon , Francia, entre el 24 y el 28 de julio, como parte de la conferencia ISMB/ ECCB .
BOSC 2024
La conferencia BOSC 2024 formó parte de la Conferencia de Sistemas Inteligentes para la Biología Molecular de 2024. El evento de 2024 también marcó el 25.º aniversario de la conferencia, que tuvo lugar en Montreal, Canadá . [ 10 ]
La conferencia se celebró en formato híbrido, con unos 200 asistentes presenciales y el resto siguiéndola en directo. La conferencia abarcó una amplia variedad de temas, centrándose principalmente en los enfoques para el uso de la inteligencia artificial (IA) y el aprendizaje automático (AA) en bioinformática . [ 11 ]
Oradores principales
La conferencia contó con dos oradores principales.
Una de ellas, la Dra. Mélanie Courtot, presentó una ponencia titulada "Los datos demuestran que necesitamos mejores datos" el primer día de la conferencia. Durante su intervención, presentó los principios TRUE para la preparación de datos para herramientas de IA.
El siguiente orador principal en presentar en el segundo día fue Andrew Su , quien ofreció una presentación titulada "Datos abiertos, grafos de conocimiento y modelos de lenguaje a gran escala" . Esta presentación abordó cómo verificar la precisión de las respuestas producidas por los modelos de lenguaje a gran escala (LLM) . Una solución que presentó fue la Generación Aumentada por Recuperación (RAG) . [ 11 ]
Otras presentaciones
Además de los oradores principales, se seleccionaron un total de 36 charlas y 23 pósteres para ser presentados en la conferencia a lo largo de varias sesiones. Una de las sesiones fue Análisis de Datos . Estas presentaciones trataron sobre enfoques para analizar datos biomédicos , diferentes tipos de datos que están disponibles gratuitamente para su uso y algunas de las investigaciones que se han realizado utilizando estas herramientas y datos de código abierto . Otra sesión se tituló Sesión de Datos Abiertos , que incluyó presentaciones sobre algunas de las bases de datos , portales de datos abiertos y plataformas disponibles gratuitamente que están siendo utilizadas por investigadores de todo el mundo. La sesión Visualización incluyó presentaciones sobre nuevas adiciones a bases de datos biológicas antiguas . La siguiente sesión se tituló “Estándares y Marcos para la Ciencia Abierta” . Esta sesión se centró en cómo crear software de código abierto consistente, reciclable y duradero. La sesión final se llamó “Enfoques Abiertos para IA/ML” , que trató sobre cómo utilizar el aprendizaje automático para resolver problemas biológicos. [ 11 ]
Mesa redonda abierta
Los eventos del segundo día concluyeron con una mesa redonda abierta titulada «IA/ML de código abierto: ¿Un punto de inflexión para la bioinformática?». Los investigadores que participaron en la mesa redonda fueron Lawrence Hunter, Thomas Hervé Mboa Nkoudou, Mélanie Courtot y Andrew Su. La moderadora fue Monica Munoz-Torres. En esta discusión se exploraron los beneficios y las desventajas del uso de la inteligencia artificial y el aprendizaje automático en la investigación bioinformática. [ 11 ]
Enlaces externos
- Página de la conferencia BOSC 2024
- Grabación completa del panel de discusión abierto de BOSC 2024
- Otras presentaciones de BOSC 2024
- Discurso de apertura de la Dra. Mélanie Courtot BOSC 2024
- Discurso de apertura de Andrew Su en BOSC 2024
- Página de la conferencia ISMB 2024
Referencias
- 1 2 Harris, NL; Cock, P.; Chapman, B.; Goecks, J.; Hotz, H.-R.; Lapp, H. (14 de julio de 2014). " The Bioinformatics Open Source Conference (BOSC) 2013" . Bioinformatics . 31 (2): 299–300 . doi : 10.1093/bioinformatics/btu413 . PMC 4287938. PMID 25024288 .
- ↑ "BOSC 2021 – Open Bioinformatics Foundation" . Consultado el 22 de noviembre de 2022 .
- ↑ "Codefest - Fundación de Bioinformática Abierta" . www.open-bio.org . Consultado el 20 de julio de 2014 .
- ↑ Möller, Steffen; Afganistán, Enis; Banco, Michael; Gallo, Peter JA; Kalas, Matus; Kajan, Laszlo; Prins, Pjotr; Quinn, Jaqueline; Sallou, Olivier; Strozzi, Francesco; Seemann, Torsten; Tille, Andreas; Valls Guimerà, Román; Katayama, Toshiaki; Chapman, Brad (14 de octubre de 2013). "Sprints, Hackathons y Codefests como gluones comunitarios en biología computacional" . Revista EMBnet . 19 (B): 40. doi : 10.14806/ej.19.B.726 .
- ↑ "Programa de BOSC 2014 - Fundamentos de Bioinformática Abierta" . www.open-bio.org . Consultado el 20 de julio de 2014 .
- ↑ "BOSC 2016 – Fundación de Bioinformática Abierta" . Open Bio.
- ↑ "Acerca de BOSC - Open Bioinformatics Foundation" . Consultado el 22 de noviembre de 2022 .
- ↑ "GCCBOSC 2018 - Open Bioinformatics Foundation" . Consultado el 22 de noviembre de 2022 .
- ↑ "Conferencia de la Comunidad de Bioinformática" . Consultado el 22 de noviembre de 2022 .
- ↑ "NCBI en ISMB 2024 y BOSC" . NCBI Insights . 21 de junio de 2024. Consultado el 24 de abril de 2025 .
- 1 2 3 4 Harris, Nomi L.; Hokamp, Karsten; Maia, Jessica; Ménager, Hervé; Munoz-Torres, Monica C.; Sawant, Swapnil; Unni, Deepak; Williams, Jason (2024). "25 años de BOSC, la Conferencia de Código Abierto de Bioinformática" . F1000Research . 13. doi : 10.12688/f1000research.156426.1 (inactivo el 1 de julio de 2025) . Recuperado el 23 de abril de 2025 .
{{cite journal}}: CS1 maint: DOI inactivo desde julio de 2025 ( enlace )
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