Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

ADAR

La familia de enzimas adenosina desaminasas específicas del ARN bicatenario está codificada por los genes de la familia ADAR . [5] ADAR significa adenosina desaminasa que actúa ...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

La familia de enzimas adenosina desaminasas específicas del ARN bicatenario está codificada por los genes de la familia ADAR . [5] ADAR significa adenosina desaminasa que actúa sobre el ARN . [6] [7] Este artículo se centra en las proteínas ADAR; este artículo detalla la historia evolutiva, la estructura, la función, los mecanismos y la importancia de todas las proteínas dentro de esta familia. [5]

Las enzimas ADAR se unen al ARN bicatenario (dsRNA) y convierten la adenosina en inosina ( hipoxantina ) por desaminación . [8] Las proteínas ADAR actúan postranscripcionalmente, cambiando el contenido de nucleótidos del ARN. [9] La conversión de adenosina a inosina (A a I) en el ARN interrumpe el apareamiento normal A:U, desestabilizando el ARN. La inosina es estructuralmente similar a la guanina (G) que conduce a la unión de inosina a citosina (I:C). [10] La inosina generalmente imita a la guanosina durante la traducción, pero también puede unirse al uracilo, la citosina y la adenosina, aunque no es la favorita.

Los cambios de codones pueden surgir de la edición de ARN que conduce a cambios en las secuencias codificantes de las proteínas y sus funciones. [11] La mayoría de los sitios de edición se encuentran en regiones no codificantes del ARN, como las regiones no traducidas (UTR), los elementos Alu y los elementos nucleares intercalados largos (LINE). [12] Los cambios de codones pueden dar lugar a variantes de empalme transcripcional alternativas. ADAR afecta al transcriptoma de formas independientes de la edición, probablemente al interferir con otras proteínas de unión al ARN. [9]

Las mutaciones de este gen están asociadas con varias enfermedades, entre ellas el VIH, el sarampión y el melanoma. Investigaciones recientes respaldan la existencia de un vínculo entre la edición de ARN y trastornos del sistema nervioso como la esclerosis lateral amiotrófica (ELA). La edición atípica de ARN vinculada a ADAR también puede estar relacionada con trastornos mentales como la esquizofrenia, la epilepsia y la depresión suicida. [13]

Descubrimiento

La enzima ADAR y su gen asociado fueron descubiertos accidentalmente en 1987 como resultado de la investigación de Brenda Bass y Harold Weintraub . [14] Estos investigadores estaban usando la inhibición del ARN antisentido para determinar qué genes juegan un papel clave en el desarrollo de embriones de Xenopus laevis . La investigación previa sobre ovocitos de Xenopus fue exitosa. Sin embargo, cuando Bass y Weintraub aplicaron protocolos idénticos a embriones de Xenopus , no pudieron determinar los genes de desarrollo del embrión. Para entender por qué el método no tuvo éxito, comenzaron a comparar el ARN dúplex tanto en ovocitos como en embriones. Esto los llevó a descubrir una actividad regulada por el desarrollo que desnaturaliza los híbridos ARN:ARN en embriones.

En 1988, Richard Wagner et al. estudiaron más a fondo la actividad que se produce en los embriones de Xenopus . [15] Determinaron que una proteína era responsable del desenrollado del ARN debido a la ausencia de actividad después del tratamiento con proteinasa . Esta proteína es específica para el ARNbc y no requiere ATP . Se hizo evidente que la actividad de esta proteína en el ARNbc lo modifica más allá de un punto de rehibridación, pero no lo desnaturaliza por completo. Finalmente, los investigadores determinaron que este desenrollado se debe a la desaminación de los residuos de adenosina a inosina . Esta modificación da como resultado un apareamiento de bases no coincidente entre la inosina y la uridina , lo que lleva a la desestabilización y el desenrollado del ARNbc.

Evolución y función

Los ADAR son una de las formas más comunes de edición de ARN y tienen actividad tanto selectiva como no selectiva. [16] Los ADAR pueden modificar y regular la salida del producto génico, ya que la inosina es interpretada por la célula como guanosina . Los ADAR pueden cambiar la funcionalidad de pequeñas moléculas de ARN. Recientemente, también se ha descubierto que los ADAR son un regulador del empalme y la biogénesis de circARN con su capacidad de edición o función de unión al ARN. [17] [18] [19] Se cree que los ADAR evolucionó a partir de ADAT (adenosina desaminasa que actúa sobre el ARNt), una proteína crítica presente en todos los eucariotas , temprano en el período metazoario mediante la adición de un dominio de unión de dsARN . Esto probablemente ocurrió en el linaje que conduce a los metazoos de la corona. Cuando un gen ADAT duplicado se acopló a otro gen que codificaba al menos una unión de ARN bicatenario. La familia de genes ADAR se ha conservado en gran medida a lo largo de la historia de su existencia. Esto, junto con su presencia en la mayoría de los filos modernos , indica que la edición de ARN es esencial para regular los genes de los organismos metazoarios. No se ha descubierto ADAR en una variedad de eucariotas no metazoarios, como plantas , hongos y coanoflagelados .

Se ha sugerido que los ADAR tienen dos funciones: aumentar la diversidad del proteoma induciendo la creación de proteínas inocuas no codificadas genómicamente y proteger sitios de traducción cruciales. La creencia convencional es que su función principal es aumentar la diversidad de las transcripciones y expandir la variación de las proteínas, promoviendo la evolución de las proteínas. [5]

Formas de enzimas ADAR

En los mamíferos, existen tres tipos de enzimas ADAR: ADAR (ADAR1), ADARB1 (ADAR2) y ADARB2 (ADAR3). [5]

ADAR (ADAR1) y ADAR2 (ADARB1)

Tanto ADAR uno como dos se encuentran en varios tejidos del cuerpo. También se ha descubierto que estas dos formas de ADAR son catalíticamente activas, lo que significa que pueden utilizarse como catalizador en una reacción. Ambas formas también tienen estructuras de patrones de expresión de proteínas similares y requieren estructuras de ARN bicatenario de sustrato. [11]  Sin embargo, difieren en su actividad de edición en que tanto ADAR uno como dos pueden editar el pre-ARNm de GluR-B en el sitio R/G y solo ADAR2 puede alterar el sitio Q/R. [20] Se ha descubierto que ADAR1 tiene dos isoformas, ADAR1p150 y ADARp110. ADAR1p110 se encuentra típicamente en el núcleo, mientras que ADAR1p150 se desplaza entre el núcleo y el citoplasma, estando presente principalmente en el citoplasma.

ADAR3 (ADARB2)

El ADAR 3 se diferencia de las otras dos formas de ADAR en que solo se encuentra en el tejido cerebral. También se considera que es inactivo en lo que respecta a la actividad catalítica. [11] Se ha descubierto que el ADAR3 está vinculado a la memoria y el aprendizaje en ratones, lo que demuestra que desempeña un papel crucial en el sistema nervioso. Los estudios in vitro también han demostrado que el ADAR3 podría desempeñar un papel en la regulación del ADAR uno y dos. [21]

Actividad catalítica

Reacción bioquímica

Los ADAR catalizan la reacción de desaminación hidrolítica de adenosina a inosina. [8] Una molécula de agua activada reaccionará con adenosina en una reacción de sustitución nucleofílica con el grupo amino del carbono 6. Un intermediario hidratado existirá durante un corto período de tiempo, luego el grupo amino se irá como un ion amoniaco.

  • Conversión de adenosina a inosina mediante ADAR
    Conversión de adenosina a inosina mediante ADAR

Sitio activo

En los seres humanos, las enzimas ADAR tienen de dos a tres dominios de unión de dsRNA amino-terminal (dsRBDs), y un dominio de desaminasa catalítica carboxiterminal. [22] En el dsRBD hay una configuración α-β-β-β-α conservada. [11] ADAR1 contiene dos áreas para la unión de Z-ADN conocidas como Zα y Zβ. [23] [24] ADAR2 y ADAR3 tienen un dominio de unión de ARN monocatenario (ssRNA) rico en arginina. Se ha resuelto una estructura cristalina de ADAR2. [22] En el sitio activo de la enzima, hay un residuo de ácido glutámico (E396) que se une mediante enlaces de hidrógeno a un agua. Una histidina (H394) y dos residuos de cisteína (C451 y C516) se coordinan con un ion de zinc . El zinc activa la molécula de agua para la desaminación hidrolítica nucleofílica. Dentro del núcleo catalítico hay un hexakisfosfato de inositol (IP6), que estabiliza los residuos de arginina y lisina .

Sitio activo ADAR1

Dimerización

En los mamíferos, la conversión de A a I requiere la homodimerización de ADAR1 y ADAR2, pero no de ADAR3. [11] Los estudios in vivo no han sido concluyentes sobre si la unión del ARN es necesaria para la dimerización. Un estudio con mutantes de la familia ADAR mostró que los mutantes no podían unirse al ARN de doble cadena, pero aún podían dimerizarse , lo que sugiere que pueden unirse en función de las interacciones proteína-proteína. [11] [25]

Papel en la enfermedad

Síndrome de Aicardi-Goutières y necrosis/distonía estriatal bilateral

ADAR1 es uno de los múltiples genes que a menudo contribuyen al síndrome de Aicardi-Goutières cuando muta. [26] El síndrome de Aicardi-Goutières es una enfermedad inflamatoria genética que afecta principalmente a la piel y al cerebro y se caracteriza por altos niveles de IFN-α en el líquido cefalorraquídeo. [27] La ​​inflamación es causada por la activación incorrecta de los genes inducibles por interferón, como los que se activan para combatir las infecciones virales. La mutación y la pérdida de función de ADAR1 previenen la desestabilización del ARN bicatenario (dsRNA). [28] Esta acumulación de dsRNA estimula la producción de IFN sin una infección viral, lo que causa una reacción inflamatoria y una respuesta autoinmune. [29] El fenotipo en los ratones knock-out es rescatado por la forma p150 de ADAR1 que contiene el dominio Zα que se une específicamente a la conformación bicatenaria zurda que se encuentra en el Z-ADN y el Z-ARN, pero no por la isoforma p110 que carece de este dominio. [30] En los seres humanos, la mutación P193A en el dominio Zα es causal del síndrome de Aicardi-Goutières [26] y del fenotipo más grave encontrado en la distonía/necrosis estriatal bilateral. [31] Los hallazgos establecen un papel biológico para la conformación zurda del ADN-Z. [32]

Esclerosis lateral amiotrófica (ELA)

En las neuronas motoras, el marcador más fiable de la esclerosis lateral amiotrófica (ELA) es la proteína de unión al ADN TAR (TDP-43) . Cuando falla la edición del ARN debido a la regulación negativa de TDP-43, las neuronas motoras que carecen de enzimas ADAR2 expresan de forma descontrolada, lo que da lugar a canales de Ca 2+ anormalmente permeables . Los ratones knock out de ADAR2 muestran signos de similitud del fenotipo de la ELA. Los investigadores actuales están desarrollando una terapia de orientación molecular mediante la normalización de la expresión de ADAR2. [33]

Cáncer

La edición de ARN de A a I inducida por ADAR puede provocar mutaciones peligrosas de aminoácidos . La edición de ARNm generalmente imparte mutaciones sin sentido que conducen a alteraciones en las regiones de inicio y terminación de la traducción. Sin embargo, pueden ocurrir cambios cruciales de aminoácidos, lo que resulta en un cambio en la función de varios procesos celulares. Los cambios de aminoácidos pueden resultar en cambios estructurales de proteínas en estructuras secundarias, terciarias y cuaternarias. Los investigadores observaron altos niveles de edición de A a I oncogenética en precursores de ARN circulares, lo que confirma directamente la relación de ADAR con el cáncer. Puede encontrar una lista de sitios de edición de ARN relacionados con tumores aquí. [34]

Carcinoma hepatocelular

Los estudios de pacientes con carcinoma hepatocelular (CHC) han mostrado tendencias de regulación positiva de ADAR1 y regulación negativa de ADAR2. Los resultados sugieren que la regulación irregular es responsable del patrón de edición de A a I alterado observado en el CHC y que ADAR1 actúa como un oncogén en este contexto, mientras que ADAR2 tiene actividades supresoras de tumores. [35] El desequilibrio en la expresión de ADAR podría cambiar la frecuencia de las transiciones de A a I en la región codificante de proteínas de los genes, lo que da como resultado proteínas mutadas que impulsan la enfermedad. La desregulación de ADAR1 y ADAR2 podría usarse como un posible marcador pronóstico.

Melanoma

Los estudios han indicado que la pérdida de ADAR1 contribuye al crecimiento y la metástasis del melanoma. Las enzimas ADAR pueden actuar sobre el microARN y afectar su biogénesis, estabilidad y/o su diana de unión. [36] ADAR1 puede ser regulada a la baja por la proteína de unión al elemento de respuesta al AMPc (CREB), lo que limita su capacidad de actuar sobre el miARN. [37] Un ejemplo de ello es el miR-455-5p, que es editado por ADAR1. Cuando ADAR es regulada a la baja por CREB, el miR-455-5p sin editar regula a la baja una proteína supresora de tumores llamada CPEB1, lo que contribuye a la progresión del melanoma en un modelo in vivo.

Discromatosis simétrica hereditaria (DSH1)

Una mutación Gly1007Arg en ADAR1, así como otras versiones truncadas, se han implicado como causa en algunos casos de DSH1. [38] Esta es una enfermedad caracterizada por hiperpigmentación en las manos y los pies y puede ocurrir en familias japonesas y chinas.

VIH

Se ha demostrado que los niveles de expresión de la proteína ADAR1 están elevados durante la infección por VIH y se ha sugerido que es responsable de las mutaciones A a G en el genoma del VIH, inhibiendo la replicación. [39] La mutación en el genoma del VIH por ADAR1 podría en algunos casos conducir a mutaciones virales beneficiosas que podrían contribuir a la resistencia a los medicamentos.

[37]

Actividad viral

Antivírico

ADAR1 es una proteína inducible por interferón ( IFN ) (liberada por una célula en respuesta a un patógeno o virus), capaz de ayudar en la vía inmunitaria de una célula. La evidencia muestra la eliminación del replicón del VHC , la coriomeningitis linfocítica por LCMV y el poliomavirus . [40] [41]

Proviral

ADAR1 es proviral en otras circunstancias. La edición A a I de ADAR1 se ha encontrado en muchos virus, incluidos el virus del sarampión, [42] [41] [43] el virus de la influenza, [44] el virus de la coriomeningitis linfocítica, [45] el poliomavirus, [46] el virus de la hepatitis delta, [47] y el virus de la hepatitis C. [48] Aunque ADAR1 se ha visto en otros virus, solo se ha estudiado ampliamente en unos pocos. La investigación sobre el virus del sarampión muestra que ADAR1 mejora la replicación viral a través de dos mecanismos diferentes: edición de ARN e inhibición de la proteína quinasa activada por dsRNA ( PKR ). [40] [41] Específicamente, se cree que los virus usan ADAR1 como un factor de replicación positivo al suprimir selectivamente las vías antivirales y dependientes de dsRNA. [49]

Véase también

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000160710 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000027951 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ abcd Savva YA, Rieder LE, Reenan RA (diciembre de 2012). "La familia de proteínas ADAR". Genome Biology . 13 (12): 252. doi : 10.1186/gb-2012-13-12-252 . PMC 3580408 . PMID  23273215. 
  6. ^ "Gen Entrez: ADAR Adenosina Desaminasa actuando sobre el ARN".
  7. ^ Kim U, Wang Y, Sanford T, Zeng Y, Nishikura K (noviembre de 1994). "Clonación molecular de ADNc para la adenosina desaminasa de ARN bicatenario, una enzima candidata para la edición nuclear de ARN". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 91 (24): 11457– 11461. Bibcode :1994PNAS...9111457K. doi : 10.1073/pnas.91.24.11457 . PMC 45250 . PMID  7972084. 
  8. ^ ab Samuel CE (2012). Adenosina desaminasas que actúan sobre el ARN (ADAR) y edición A-I . Heidelberg: Springer. ISBN 978-3-642-22800-1.
  9. ^ ab "ADAR". NCBI . Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
  10. ^ Licht K, Hartl M, Amman F, Anrather D, Janisiw MP, Jantsch MF (enero de 2019). "La inosina induce una recodificación dependiente del contexto y un estancamiento de la traducción". Nucleic Acids Research . 47 (1): 3– 14. doi :10.1093/nar/gky1163. PMC 6326813 . PMID  30462291. 
  11. ^ abcdef Nishikura K (7 de junio de 2010). "Funciones y regulación de la edición de ARN por las desaminasas ADAR". Revisión anual de bioquímica . 79 (1): 321– 349. doi :10.1146/annurev-biochem-060208-105251. PMC 2953425 . PMID  20192758. 
  12. ^ Tajaddod M, Jantsch MF, Licht K (marzo de 2016). "El epitranscriptoma dinámico: la edición de A a I modula la información genética". Chromosoma . 125 (1): 51– 63. doi :10.1007/s00412-015-0526-9. PMC 4761006 . PMID  26148686. 
  13. ^ Savva YA, Rieder LE, Reenan RA (diciembre de 2012). "La familia de proteínas ADAR". Biología del genoma . 13 (12): 252. doi : 10.1186/gb-2012-13-12-252 . PMC 3580408 . PMID  23273215. 
  14. ^ Samuel CE (marzo de 2011). "Las adenosina deaminasas que actúan sobre el ARN (ADAR) son antivirales y provirales". Virology . 411 (2): 180– 193. doi :10.1016/j.virol.2010.12.004. PMC 3057271 . PMID  21211811. 
  15. ^ Wagner RW, Smith JE, Cooperman BS, Nishikura K (abril de 1989). "Una actividad de desenrollado de ARN bicatenario introduce alteraciones estructurales por medio de conversiones de adenosina a inosina en células de mamíferos y huevos de Xenopus". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 86 (8): 2647– 2651. Bibcode :1989PNAS...86.2647W. doi : 10.1073/pnas.86.8.2647 . PMC 286974 . PMID  2704740. 
  16. ^ Grice LF, Degnan BM (enero de 2015). "El origen de la familia de genes ADAR y la edición de ARN animal". BMC Evolutionary Biology . 15 (1): 4. Bibcode :2015BMCEE..15....4G. doi : 10.1186/s12862-015-0279-3 . PMC 4323055 . PMID  25630791. 
  17. ^ Tang SJ, Shen H, An O, Hong H, Li J, Song Y, et al. (febrero de 2020). "Las cis y transregulaciones del empalme de pre-ARNm por enzimas de edición de ARN influyen en el desarrollo del cáncer". Nature Communications . 11 (1): 799. Bibcode :2020NatCo..11..799T. doi :10.1038/s41467-020-14621-5. PMC 7005744 . PMID  32034135. 
  18. ^ Hsiao YE, Bahn JH, Yang Y, Lin X, Tran S, Yang EW, et al. (junio de 2018). "La edición de ARN en ARN naciente afecta el empalme de pre-ARNm". Genome Research . 28 (6): 812– 823. doi :10.1101/gr.231209.117. PMC 5991522 . PMID  29724793. 
  19. ^ Shen H, An O, Ren X, Song Y, Tang SJ, Ke XY, et al. (marzo de 2022). "Los ADAR actúan como potentes reguladores del transcriptoma circular en el cáncer". Nature Communications . 13 (1): 1508. Bibcode :2022NatCo..13.1508S. doi :10.1038/s41467-022-29138-2. PMC 8938519 . PMID  35314703. 
  20. ^ Källman AM, Sahlin M, Ohman M (15 de agosto de 2003). "ADAR2 A-->I editing: site selectivity and editing efficient are separate events" (Edición de ADAR2 A-->I: la selectividad del sitio y la eficiencia de edición son eventos separados). Nucleic Acids Research . 31 (16): 4874– 4881. doi :10.1093/nar/gkg681. ISSN  1362-4962. PMC 169957 . PMID  12907730. 
  21. ^ Wang Y, Chung DH, Monteleone LR, Li J, Chiang Y, Toney MD, Beal PA (18 de noviembre de 2019). "Candidatos de unión a ARN para ADAR3 humano a partir de sustratos de un mutante con ganancia de función expresado en células neuronales". Nucleic Acids Research . 47 (20): 10801– 10814. doi :10.1093/nar/gkz815. ISSN  1362-4962. PMC 6846710 . PMID  31552420. 
  22. ^ ab Savva YA, Rieder LE, Reenan RA (diciembre de 2012). "La familia de proteínas ADAR". Biología del genoma . 13 (12): 252. doi : 10.1186/gb-2012-13-12-252 . PMC 3580408 . PMID  23273215. 
  23. ^ Srinivasan B, Kuś K, Athanasiadis A (agosto de 2022). "Análisis termodinámico de las interacciones del dominio Zα con el ácido nucleico". The Biochemical Journal . 479 (16): 1727– 1741. doi : 10.1042/BCJ20220200 . PMID  35969150.
  24. ^ Gabriel L, Srinivasan B, Kuś K, Mata JF, João Amorim M, Jansen LE, Athanasiadis A (mayo de 2021). "El enriquecimiento de los dominios Zα en los gránulos de estrés citoplasmático se debe a su capacidad innata para unirse a los ácidos nucleicos". Journal of Cell Science . 134 (10): jcs258446. doi : 10.1242/jcs.258446 . PMID  34037233. S2CID  235202242.
  25. ^ Cho DS, Yang W, Lee JT, Shiekhattar R, Murray JM, Nishikura K (mayo de 2003). "Requisito de dimerización para la actividad de edición de ARN de las adenosina deaminasas que actúan sobre el ARN". The Journal of Biological Chemistry . 278 (19): 17093– 17102. doi : 10.1074/jbc.M213127200 . PMID  12618436.
  26. ^ ab Rice GI, Kasher PR, Forte GM, Mannion NM, Greenwood SM, Szynkiewicz M, et al. (noviembre de 2012). "Las mutaciones en ADAR1 causan el síndrome de Aicardi-Goutières asociado con una firma de interferón tipo I". Nature Genetics . 44 (11): 1243– 1248. doi :10.1038/ng.2414. PMC 4154508 . PMID  23001123. 
  27. ^ Yang S, Deng P, Zhu Z, Zhu J, Wang G, Zhang L, et al. (octubre de 2014). "La adenosina desaminasa que actúa sobre el ARN 1 limita la detección del ARN RIG-I y suprime la producción de IFN en respuesta a los ARN virales y endógenos". Journal of Immunology . 193 (7): 3436– 3445. doi :10.4049/jimmunol.1401136. PMC 4169998 . PMID  25172485. 
  28. ^ Gallo A, Vukic D, Michalík D, O'Connell MA, Keegan LP (septiembre de 2017). "Edición de ARN ADAR en enfermedades humanas; más de lo que parece". Genética humana . 136 (9): 1265– 1278. doi :10.1007/s00439-017-1837-0. PMID  28913566. S2CID  3754471.
  29. ^ Liddicoat BJ, Piskol R, Chalk AM, Ramaswami G, Higuchi M, Hartner JC, et al. (septiembre de 2015). "La edición de ARN por ADAR1 impide que MDA5 detecte ARN bicatenario endógeno como no propio". Science . 349 (6252): 1115– 1120. Bibcode :2015Sci...349.1115L. doi :10.1126/science.aac7049. PMC 5444807 . PMID  26275108. 
  30. ^ Ward SV, George CX, Welch MJ, Liou LY, Hahm B, Lewicki H, et al. (enero de 2011). "La enzima de edición de ARN adenosina deaminasa es un factor de restricción para controlar la replicación del virus del sarampión que también es necesario para la embriogénesis". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 108 (1): 331– 336. Bibcode :2011PNAS..108..331W. doi : 10.1073/pnas.1017241108 . PMC 3017198 . PMID  21173229. 
  31. ^ Livingston JH, Lin JP, Dale RC, Gill D, Brogan P, Munnich A, et al. (febrero de 2014). "Una firma de interferón tipo I identifica necrosis estriatal bilateral debido a mutaciones en ADAR1". Journal of Medical Genetics . 51 (2): 76– 82. doi :10.1136/jmedgenet-2013-102038. PMID  24262145. S2CID  8716360.
  32. ^ Herbert A (enero de 2020). "Enfermedad mendeliana causada por variantes que afectan el reconocimiento de Z-ADN y Z-ARN por el dominio Zα de la enzima de edición de ARN bicatenario ADAR". Revista Europea de Genética Humana . 28 (1): 114– 117. doi :10.1038/s41431-019-0458-6. PMC 6906422 . PMID  31320745. 
  33. ^ Yamashita T, Kwak S (julio de 2019). "Cascada de muerte celular y terapia molecular en neuronas motoras deficientes en ADAR2 de ELA". Neuroscience Research . 144 : 4– 13. doi :10.1016/j.neures.2018.06.004. PMID  29944911. S2CID  49433496.
  34. ^ Wang H, Chen S, Wei J, Song G, Zhao Y (2021). "Edición de ARN de A a I en el cáncer: de la evaluación del nivel de edición a la exploración de los efectos de la edición". Frontiers in Oncology . 10 : 632187. doi : 10.3389/fonc.2020.632187 . PMC 7905090 . PMID  33643923. 
  35. ^ Chan TH, Lin CH, Qi L, Fei J, Li Y, Yong KJ, et al. (mayo de 2014). "Un equilibrio alterado de edición de ARN mediado por ADAR (adenosina desaminasas que actúan sobre el ARN) en el carcinoma hepatocelular humano". Gut . 63 (5): 832– 843. doi :10.1136/gutjnl-2012-304037. PMC 3995272 . PMID  23766440. 
  36. ^ Heale BS, Keegan LP, McGurk L, Michlewski G, Brindle J, Stanton CM, et al. (octubre de 2009). "Edición de efectos independientes de los ADAR en las vías de miRNA/siRNA". The EMBO Journal . 28 (20): 3145– 3156. doi :10.1038/emboj.2009.244. PMC 2735678 . PMID  19713932. 
  37. ^ ab Shoshan E, Mobley AK, Braeuer RR, Kamiya T, Huang L, Vasquez ME, et al. (marzo de 2015). "La edición reducida de adenosina a inosina miR-455-5p promueve el crecimiento y la metástasis del melanoma". Nature Cell Biology . 17 (3): 311– 321. doi :10.1038/ncb3110. PMC 4344852 . PMID  25686251. 
  38. ^ Tojo K, Sekijima Y, Suzuki T, Suzuki N, Tomita Y, Yoshida K, et al. (septiembre de 2006). "Distonía, deterioro mental y discromatosis simétrica hereditaria en una familia con mutación ADAR1". Trastornos del movimiento . 21 (9): 1510– 1513. doi :10.1002/mds.21011. PMID  16817193. S2CID  38374943.
  39. ^ Weiden MD, Hoshino S, Levy DN, Li Y, Kumar R, Burke SA, et al. (2014). "La adenosina desaminasa que actúa sobre el ARN-1 (ADAR1) inhibe la replicación del VIH-1 en macrófagos alveolares humanos". PLOS ONE . ​​9 (10): e108476. Bibcode :2014PLoSO...9j8476W. doi : 10.1371/journal.pone.0108476 . PMC 4182706 . PMID  25272020. 
  40. ^ ab Gélinas JF, Clerzius G, Shaw E, Gatignol A (septiembre de 2011). "Mejora de la replicación de virus de ARN por ADAR1 mediante la edición de ARN y la inhibición de la proteína quinasa activada por ARN". Revista de Virología . 85 (17): 8460– 8466. doi :10.1128/JVI.00240-11. PMC 3165853 . PMID  21490091. 
  41. ^ abc Pfaller CK, George CX, Samuel CE (septiembre de 2021). "Adenosina desaminasas que actúan sobre el ARN (ADAR) e infecciones virales". Revisión anual de virología . 8 (1): 239– 264. doi : 10.1146/annurev-virology-091919-065320 . PMID  33882257.
  42. ^ Baczko K, Lampe J, Liebert UG, Brinckmann U, ter Meulen V, Pardowitz I, et al. (noviembre de 1993). "Expansión clonal del virus del sarampión hipermutado en un cerebro SSPE". Virología . 197 (1): 188– 195. doi :10.1006/viro.1993.1579. PMID  8212553.
  43. ^ Cattaneo R, Schmid A, Eschle D, Baczko K, ter Meulen V, Billeter MA (octubre de 1988). "Hipermutación sesgada y otros cambios genéticos en virus defectuosos del sarampión en infecciones cerebrales humanas". Cell . 55 (2): 255– 265. doi :10.1016/0092-8674(88)90048-7. PMC 7126660 . PMID  3167982. 
  44. ^ Tenoever BR, Ng SL, Chua MA, McWhirter SM, García-Sastre A, Maniatis T (marzo de 2007). "Múltiples funciones de la quinasa IKKepsilon relacionada con IKK en la inmunidad antiviral mediada por interferón". Ciencia . 315 (5816): 1274– 1278. doi :10.1126/science.1136567. PMID  17332413. S2CID  86636484.
  45. ^ Zahn RC, Schelp I, Utermöhlen O, von Laer D (enero de 2007). "Hipermutación de A a G en el genoma del virus de la coriomeningitis linfocítica". Revista de Virología . 81 (2): 457– 464. doi :10.1128/jvi.00067-06. PMC 1797460 . PMID  17020943. 
  46. ^ Kumar M, Carmichael GG (abril de 1997). "El ARN antisentido nuclear induce amplias modificaciones de adenosina y retención nuclear de las transcripciones objetivo". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (8): 3542– 3547. Bibcode :1997PNAS...94.3542K. doi : 10.1073/pnas.94.8.3542 . PMC 20475 . PMID  9108012. 
  47. ^ Luo GX, Chao M, Hsieh SY, Sureau C, Nishikura K, Taylor J (marzo de 1990). "Se produce una transición de base específica en el ARN del virus de la hepatitis delta que se replica". Journal of Virology . 64 (3): 1021– 1027. doi :10.1128/JVI.64.3.1021-1027.1990. PMC 249212 . PMID  2304136. 
  48. ^ Taylor DR, Puig M, Darnell ME, Mihalik K, Feinstone SM (mayo de 2005). "Nueva vía antiviral que media la sensibilidad del interferón del replicón del virus de la hepatitis C a través de ADAR1". Journal of Virology . 79 (10): 6291– 6298. doi :10.1128/JVI.79.10.6291-6298.2005. PMC 1091666 . PMID  15858013. 
  49. ^ Toth AM, Li Z, Cattaneo R, Samuel CE (octubre de 2009). "La adenosina deaminasa ADAR1 específica de ARN suprime la apoptosis inducida por el virus del sarampión y la activación de la proteína quinasa PKR". The Journal of Biological Chemistry . 284 (43): 29350– 29356. doi : 10.1074/jbc.M109.045146 . PMC 2785566 . PMID  19710021. 

Lectura adicional

  • Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG, Franco R (1997). "La gp120 de la envoltura del VIH-1 y las partículas virales bloquean la unión de la adenosina deaminasa al CD26 humano". Peptidasas celulares en funciones y enfermedades inmunitarias . Avances en medicina y biología experimental. Vol. 421. págs.  185– 92. doi :10.1007/978-1-4757-9613-1_24. ISBN 978-1-4757-9615-5. Número de identificación personal  9330696.
  • Wathelet MG, Szpirer J, Nols CB, Clauss IM, De Wit L, Islam MQ, et al. (septiembre de 1988). "Clonación y localización cromosómica de genes humanos inducibles por interferón tipo I". Genética molecular y de células somáticas . 14 (5): 415– 426. doi :10.1007/BF01534709. PMID  3175763. S2CID  42406993.
  • Wang Y, Zeng Y, Murray JM, Nishikura K (noviembre de 1995). "Organización genómica y ubicación cromosómica del gen de la adenosina desaminasa del dsRNA humano: la enzima para la edición del ARN del canal iónico activado por glutamato". Journal of Molecular Biology . 254 (2): 184– 195. doi : 10.1006/jmbi.1995.0610 . PMID  7490742.
  • Patterson JB, Samuel CE (octubre de 1995). "Expresión y regulación por interferón de una adenosina desaminasa específica de ARN bicatenario de células humanas: evidencia de dos formas de la desaminasa". Biología molecular y celular . 15 (10): 5376– 5388. doi :10.1128/mcb.15.10.5376. PMC  230787 . PMID  7565688.
  • Patterson JB, Thomis DC, Hans SL, Samuel CE (julio de 1995). "Mecanismo de acción del interferón: la adenosina desaminasa específica del ARN bicatenario de células humanas es inducible por interferones alfa y gamma". Virology . 210 (2): 508– 511. doi : 10.1006/viro.1995.1370 . PMID  7618288.
  • O'Connell MA, Krause S, Higuchi M, Hsuan JJ, Totty NF, Jenny A, Keller W (marzo de 1995). "Clonación de ADNc que codifican adenosina desaminasa específica de ARN bicatenario de mamíferos". Biología molecular y celular . 15 (3): 1389– 1397. doi :10.1128/mcb.15.3.1389. PMC  230363 . PMID  7862132.
  • Weier HU, George CX, Greulich KM, Samuel CE (noviembre de 1995). "El gen de la adenosina desaminasa específica del ARN bicatenario inducible por interferón (DSRAD) se asigna al cromosoma humano 1q21.1-21.2". Genomics . 30 (2): 372– 375. doi :10.1006/geno.1995.0034. PMID  8586444.
  • Liu Y, George CX, Patterson JB, Samuel CE (febrero de 1997). "Dominios de unión a ARN bicatenario funcionalmente distintos asociados con variantes de sitios de empalme alternativos de la adenosina desaminasa específica de ARN bicatenario inducible por interferón". The Journal of Biological Chemistry . 272 ​​(7): 4419– 4428. doi : 10.1074/jbc.272.7.4419 . PMID  9020165.
  • Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG, Franco R (abril de 1997). "La unión de la adenosina desaminasa al CD26 humano es inhibida por la glicoproteína de envoltura gp120 del VIH-1 y las partículas virales". Journal of Immunology . 158 (8): 3721– 3729. doi : 10.4049/jimmunol.158.8.3721 . PMID  9103436. S2CID  22609553.
  • Herbert A, Alfken J, Kim YG, Mian IS, Nishikura K, Rich A (agosto de 1997). "Un dominio de unión a ADN-Z presente en la enzima de edición humana, la adenosina desaminasa de ARN bicatenario". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (16): 8421– 8426. Bibcode :1997PNAS...94.8421H. doi : 10.1073/pnas.94.16.8421 . PMC  22942 . PMID  9237992.
  • Liu Y, Herbert A, Rich A, Samuel CE (julio de 1998). "Adenosina desaminasa específica de ARN de doble cadena: propiedades de unión a ácidos nucleicos". Métodos . 15 (3): 199– 205. doi :10.1006/meth.1998.0624. PMID  9735305.
  • George CX, Samuel CE (abril de 1999). "Las transcripciones de la adenosina deaminasa ADAR1 específica de ARN humano poseen estructuras alternativas en el exón 1 que se inician a partir de diferentes promotores, uno constitutivamente activo y el otro inducible por interferón". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 96 (8): 4621– 4626. Bibcode :1999PNAS...96.4621G. doi : 10.1073/pnas.96.8.4621 . PMC  16382 . PMID  10200312.
  • Schwartz T, Rould MA, Lowenhaupt K, Herbert A, Rich A (junio de 1999). "Estructura cristalina del dominio Zalpha de la enzima de edición humana ADAR1 unida a ADN-Z zurdo". Science . 284 (5421): 1841– 1845. doi :10.1126/science.284.5421.1841. PMID  10364558.
  • Schade M, Turner CJ, Kühne R, Schmieder P, Lowenhaupt K, Herbert A, et al. (octubre de 1999). "La estructura en solución del dominio Zalpha de la enzima de edición de ARN humano ADAR1 revela una superficie de unión preposicionada para el Z-ADN". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 96 (22): 12465– 12470. Bibcode :1999PNAS...9612465S. doi : 10.1073/pnas.96.22.12465 . PMC  22950 . PMID  10535945.
  • Blanco J, Valenzuela A, Herrera C, Lluís C, Hovanessian AG, Franco R (julio de 2000). "La gp120 del VIH-1 inhibe la unión de la adenosina desaminasa a CD26 mediante un mecanismo modulado por la expresión de CD4 y CXCR4". Cartas FEBS . 477 ( 1– 2): 123– 128. doi :10.1016/S0014-5793(00)01751-8. PMID  10899322. S2CID  22229481.
  • Herrera C, Morimoto C, Blanco J, Mallol J, Arenzana F, Lluis C, Franco R (junio de 2001). "Comodulación de CXCR4 y CD26 en linfocitos humanos". The Journal of Biological Chemistry . 276 (22): 19532– 19539. doi : 10.1074/jbc.M004586200 . PMID  11278278.
  • Wong SK, Sato S, Lazinski DW (junio de 2001). "Reconocimiento de sustrato por ADAR1 y ADAR2". ARN . 7 (6): 846– 858. doi :10.1017/S135583820101007X. PMC  1370134 . PMID  11421361.
  • Eckmann CR, Neunteufl A, Pfaffstetter L, Jantsch MF (julio de 2001). "La enzima de edición de ARN ADAR1 de los seres humanos, pero no la de Xenopus, tiene una señal de localización nuclear atípica y muestra las características de una proteína transportadora". Biología molecular de la célula . 12 (7): 1911– 1924. doi :10.1091/mbc.12.7.1911. PMC  55639 . PMID  11451992.
  • Yang S, Deng P, Zhu Z, Zhu J, Wang G, Zhang L, et al. (octubre de 2014). "La adenosina desaminasa que actúa sobre el ARN 1 limita la detección del ARN RIG-I y suprime la producción de IFN en respuesta a los ARN virales y endógenos". Journal of Immunology . 193 (7): 3436– 3445. doi :10.4049/jimmunol.1401136. PMC  4169998 . PMID  25172485.
Obtenido de "https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=ADAR&oldid=1220755948"