Cerebro de mosca virtual

Virtual Fly Brain , o VFB , es una herramienta interactiva basada en la web que permite a los neurobiólogos explorar la neuroanatomía detallada , la expresión de transgenes y los fenotipos asociados del cerebro de Drosophila melanogaster . ^{[ 1 ]} Los usuarios pueden explorar pilas de imágenes 3D pintadas del cerebro de Drosophila , eligiendo cualquier plano de sección que deseen y haciendo clic en las regiones pintadas para encontrar definiciones de nombres, referencias y sinónimos para la región elegida. Para cada región, pueden realizar consultas para encontrar neuronas , expresión de transgenes y fenotipos. Para cada neurona encontrada, los usuarios pueden explorar definiciones, referencias y sinónimos.

Virtual Fly Brain es una aplicación web genérica que permite explorar pilas de imágenes 3D y consultar la base de datos subyacente de anatomía y expresión mantenida por FlyBase. ^{[ 2 ]} El proyecto Virtual Fly Brain es llevado a cabo por investigadores de la Universidad de Cambridge y la Universidad de Edimburgo .

Virtual Fly Brain utiliza un modelo ontológico de la anatomía de Drosophila escrito en OWL2 y basado en la literatura sobre Drosophila . Este modelo contiene información detallada sobre la neuroanatomía macroscópica, las clases de neuronas y las relaciones entre ellas . Cada consulta sobre neuroanatomía se basa en una consulta a esta ontología en OWL-DL .

Las consultas de fenotipo y expresión utilizan el gran volumen de datos de expresión y fenotipo de FlyBase ^{[ 3 ],} anotados con la ontología anatómica de Drosophila . Cada consulta de expresión o fenotipo comienza con una consulta a la ontología anatómica para obtener términos apropiados para la región seleccionada. El resultado de esta consulta se utiliza como entrada para una consulta a la base de datos chado de FlyBase ^{[ 4 ]} para obtener datos de expresión o fenotipo anotados con dichos términos.

Las imágenes en el visor se entregan como una serie de mosaicos que cubren solo el área visible en la ventana del navegador. Los mosaicos se producen a partir de un objeto compuesto 3D Woolz ^{[ 5 ] [ 6 ]} que representa la estructura general y los dominios pintados individualmente.

• cerebro de insecto
• Conectoma de Drosophila
• célula madre ganglionar
• Factor de dispersión del pigmento

• virtualflybrain.org Archivado el 28/07/2011 en Wayback Machine
• FlyBase