La helicasa de ARN del espliceosoma BAT1 es una enzima que en humanos está codificada por el gen BAT1 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
Este gen codifica un miembro de la familia DEAD box de ATPasas dependientes de ARN que median la hidrólisis de ATP durante el empalme del pre-ARNm . La proteína codificada es un factor de empalme esencial requerido para la asociación de la ribonucleoproteína nuclear pequeña U2 con el pre-ARNm , y también desempeña un papel importante en la exportación de ARNm del núcleo al citoplasma . Un grupo de genes, BAT1-BAT5, se localiza cerca de los genes de TNF alfa y TNF beta . Todos estos genes se encuentran dentro de la región de clase III del complejo mayor de histocompatibilidad humano . Las mutaciones en este gen pueden estar asociadas con la artritis reumatoide . Se han descrito variantes de transcripción con empalme alternativo que codifican la misma proteína. [ 7 ]
Referencias
- 1 2 3 ENSG00000225073, ENSG00000237889, ENSG00000229496, ENSG00000215425, ENSG00000235439, ENSG00000225859, ENSG00000230624 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000198563, ENSG00000225073, ENSG00000237889, ENSG00000229496, ENSG00000215425, ENSG00000235439, ENSG00000225859, ENSG00000230624 – Ensembl Mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000019432 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- ↑ Peelman LJ, Chardon P, Nunes M, Renard C, Geffrotin C, Vaiman M, Van Zeveren A, Coppieters W, van de Weghe A, Bouquet Y, et al. (agosto de 1995). "El gen BAT1 en el MHC codifica una presunta helicasa de ARN nuclear conservada evolutivamente de la familia DEAD". Genomics . 26 (2): 210–8 . doi : 10.1016/0888-7543(95)80203-X . PMID 7601445 .
- ↑ Spies T, Bresnahan M, Strominger JL (dic. 1989). "El complejo mayor de histocompatibilidad humano contiene un mínimo de 19 genes entre el grupo del complemento y HLA-B" . Proc Natl Acad Sci USA . 86 (22): 8955–8 . Bibcode : 1989PNAS...86.8955S . doi : 10.1073 / pnas.86.22.8955 . PMC 298409. PMID 2813433 .
- 1 2 "Entrez Gene: BAT1 HLA-B associated transcript 1" .
Enlaces externos
- Localización del gen DDX39B humano en el genoma y página con detalles del gen DDX39B en el navegador genómico de UCSC .
- PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para la helicasa de ARN del espliceosoma humano DDX39B (BAT1).
Lecturas adicionales
- Spies T, Blanck G, Bresnahan M, et al. (1989). "Un nuevo grupo de genes dentro del complejo mayor de histocompatibilidad humano". Science . 243 (4888): 214– 7. Bibcode : 1989Sci...243..214S . doi : 10.1126/science.2911734 . PMID 2911734 .
- Cross SH, Charlton JA, Nan X, Bird AP (1994). "Purificación de islas CpG mediante una columna de unión de ADN metilado". Nat . Genet . 6 (3): 236– 44. doi : 10.1038/ng0394-236 . PMID 8012384. S2CID 12847618 .
- Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de la caperuza de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- Fleckner J, Zhang M, Valcárcel J, Green MR (1997). "U2AF65 recluta una nueva proteína humana de la familia DEAD box necesaria para la interacción entre el snRNP U2 y el punto de ramificación" . Genes Dev . 11 (14): 1864–72 . doi : 10.1101/gad.11.14.1864 . PMID 9242493 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y en el extremo 5'". Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- Allcock RJ, Price P, Gaudieri S, et al. (1999). "Caracterización del gen MHC central humano, BAT1: estructura genómica y expresión". Exp . Clin. Immunogenet . 16 (2): 98– 106. doi : 10.1159/000019100 . PMID 10343160. S2CID 22003689 .
- Ota M, Katsuyama Y, Kimura A, et al. (2001). "Un segundo gen de susceptibilidad para desarrollar artritis reumatoide en el MHC humano se localiza dentro de un intervalo telomérico de 70 kb de los genes TNF en la región HLA de clase III". Genomics . 71 (3): 263–70 . doi : 10.1006/geno.2000.6371 . PMID 11170743 .
- Allcock RJ, Williams JH, Price P (2001). "El gen central del MHC, BAT1, puede codificar una proteína que regula negativamente la producción de citocinas". Genes Cells . 6 (5): 487– 94. doi : 10.1046/j.1365-2443.2001.00435.x . PMID 11380625. S2CID 10605522 .
- Luo ML, Zhou Z, Magni K, et al. (2001). "El empalme del pre-ARNm y la exportación del ARNm están vinculados por interacciones directas entre UAP56 y Aly". Nature . 413 ( 6856): 644– 7. Bibcode : 2001Natur.413..644L . doi : 10.1038/35098106 . PMID 11675789. S2CID 4395388 .
- Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. (2002). "Análisis proteómico dirigido del nucléolo humano" . Curr. Biol . 12 (1): 1– 11. Bibcode : 2002CBio...12....1A . doi : 10.1016/ S0960-9822 (01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033 .
- Strässer K, Masuda S, Mason P, et al. (2002). "TREX es un complejo conservado que acopla la transcripción con la exportación de ARN mensajero". Nature . 417 ( 6886): 304–8 . Bibcode : 2002Natur.417..304S . doi : 10.1038/nature746 . PMID 11979277. S2CID 1112194 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- McCracken S, Longman D, Johnstone IL, et al. (2004). "Un papel conservado evolutivamente para SRm160 en el procesamiento del extremo 3' que funciona independientemente de la formación del complejo de unión de exones" . J. Biol. Chem . 278 (45): 44153–60 . doi : 10.1074/jbc.M306856200 . PMID 12944400 .
- Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q, et al. (2003). "Los ensayos de doble híbrido en levadura implican la participación de proteínas de la anemia de Fanconi en la regulación de la transcripción, la señalización celular, el metabolismo oxidativo y el transporte celular". Exp. Cell Res . 289 (2): 211–21 . doi : 10.1016/S0014-4827(03)00261-1 . PMID 14499622 .
- Li J, Hawkins IC, Harvey CD, et al. (2003). "Regulación del empalme alternativo por SRrp86 y sus proteínas interactuantes" . Mol . Cell. Biol . 23 (21): 7437–47 . doi : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . PMC 207616. PMID 14559993 .
- Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). "La secuencia de ADN y el análisis del cromosoma 6 humano" . Nature . 425 (6960): 805–11 . Bibcode : 2003Natur.425..805M . doi : 10.1038/nature02055 . PMID 14574404 .
- Lehner B, Semple JI, Brown SE, et al. (2004). "Análisis de un sistema de doble híbrido de levadura de alto rendimiento y su uso para predecir la función de las proteínas intracelulares codificadas dentro de la región MHC clase III humana". Genomics . 83 (1): 153– 67. doi : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . PMID 14667819 .
- Price P, Wong AM, Williamson D, et al. (2004). "Los polimorfismos en las posiciones -22 y -348 en el promotor del gen BAT1 afectan la transcripción y la unión de factores nucleares" . Hum. Mol. Genet . 13 (9): 967–74 . doi : 10.1093/hmg/ddh113 . PMID 15028669 .
- Genes en el cromosoma 6 humano
- restos de enzimas