La inestabilidad del transcriptoma es una característica genómica relacionada con el empalme del pre-ARNm en ciertos cánceres . En general, el empalme del pre-ARNm está desregulado en una alta proporción de células cancerosas . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Para ciertos tipos de cáncer, como el colorrectal y el de próstata , se ha demostrado que el número de errores de empalme por cáncer varía mucho entre los distintos cánceres, un fenómeno conocido como inestabilidad del transcriptoma . [ 4 ] [ 5 ] La inestabilidad del transcriptoma se correlaciona significativamente con un nivel reducido de expresión de los genes de los factores de empalme. La mutación de DNMT3A contribuye al desarrollo de neoplasias hematológicas , y las líneas celulares con mutación de DNMT3A exhiben inestabilidad del transcriptoma en comparación con sus contrapartes isogénicas de tipo silvestre. [ 6 ]
Referencias
- ↑ Skotheim, RI; Nees, M (2007). "Empalme alternativo en el cáncer: ¿ruido, funcional o sistemático?". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology . 39 ( 7– 8): 1432– 49. doi : 10.1016/j.biocel.2007.02.016 . PMID 17416541 .
- ↑ Bauer, Joseph Alan; He, Chunjiang; Zhou, Fang; Zuo, Zhixiang; Cheng, Hanhua; Zhou, Rongjia (2009). Bauer, Joseph Alan (ed.). "Una visión global de las variantes de transcripción específicas del cáncer mediante análisis sustractivo del transcriptoma" . PLOS ONE . 4 (3) e4732. Bibcode : 2009PLoSO...4.4732H . doi : 10.1371/journal.pone.0004732 . PMC 2648985. PMID 19266097 .
- ↑ Sveen, A; Kilpinen, S; Ruusulehto, A; Lothe, RA; Skotheim, RI (2015). "Empalme aberrante de ARN en el cáncer; cambios en la expresión y mutaciones impulsoras de genes de factores de empalme" . Oncogene . 35 (19): 2413– 2427. doi : 10.1038/onc.2015.318 . PMID 26300000 .
- ↑ Sveen, A; Ågesen, TH; Nesbakken, A; Rognum, TO; Lothe, RA; Skotheim, RI (2011). " Inestabilidad del transcriptoma en el cáncer colorrectal identificada mediante análisis de microarrays de exones: asociaciones con los niveles de expresión de factores de empalme y la supervivencia del paciente" . Genome Medicine . 15 (1): 672. doi : 10.1186/1471-2164-15-672 . PMC 3219073. PMID 25109687 .
- ↑ Sveen, A; Johannessen, B; Teixeira, MR; Lothe, RA; Skotheim, RI (2014). "Inestabilidad del transcriptoma como una característica molecular pancáncer de los carcinomas" . BMC Genomics . 3 (5): 32. doi : 10.1186/gm248 . PMC 4137096. PMID 21619627 .
- ↑ Banaszak, LG; Giudice, V; Zhao, X; Wu, Z; Gao, S; Hosokawa, K; Keyvanfar, K; Townsley, DM; Gutierrez-Rodrigues, F; Ibanez, MdPF; Kajigaya, S; Young, NS (2018). " Empalme anormal de ARN e inestabilidad genómica después de la inducción de mutaciones de DNMT3A mediante edición genética CRISPR/Cas9" . Blood Cells, Molecules and Diseases . 69 : 10–22 . doi : 10.1016/j.bcmd.2017.12.002 . PMC 6728079. PMID 29324392 .
- expresión génica
- Oncología
- empalme de ARN