El tampón TE es una solución tampón de uso común en biología molecular , especialmente en procedimientos que involucran ADN , ADNc o ARN . El término "TE" deriva de sus componentes: Tris , un tampón de pH común, y EDTA , una molécula que quelata cationes como el Mg²⁺ . La función del tampón TE es solubilizar el ADN o el ARN, protegiéndolos de la degradación.
Receta
Una receta típica para hacer un tampón TE 1X es:
El tampón TE también se conoce como tampón T 10 E 1 , que se puede leer como "T ten E one buffer". Para preparar 100 ml de solución de tampón T 10 E 1 , se mezclan 1 ml de base Tris 1 M (pH 10–11) y 0,2 ml de EDTA (0,5 M), y se completa el volumen con agua bidestilada hasta 100 ml. Se añaden microlitros de HCl de alta molaridad para reducir el pH a 8.
Según estudios sobre nucleasas realizados en la década de 1980, el pH se suele ajustar a 7,5 para el ARN y a 8,0 para el ADN . Se supone que las nucleasas de ADN y ARN, respectivamente, son menos activas a estos valores de pH, pero un pH de 8,0 puede utilizarse de forma segura para el almacenamiento tanto de ADN como de ARN .
El EDTA inactiva aún más la DNasa , al unirse a los cationes metálicos necesarios para esta enzima. [ 1 ]
El ADN genómico y plasmídico puede almacenarse en tampón TE a 4 °C (39,2 °F) para uso a corto plazo, o entre -20 °C (-4 °F) y -80 °C (-112 °F) para almacenamiento a largo plazo. Deben evitarse los ciclos repetidos de congelación y descongelación. [ 2 ]
TE bajo o TE bajo EDTA
El funcionamiento del tampón TE se basa en la quelación de cationes metálicos como el Mg²⁺ . El problema es que la polimerasa de PCR también requiere Mg²⁺ para funcionar, por lo que si la cantidad de EDTA es demasiado alta , puede afectar la PCR. Existe una versión del tampón TE con 10 veces menos cantidad de EDTA que se usa con mucha frecuencia en los kits STR forenses. Debido al uso de kits con amplificación multiplex, es necesario tener una menor cantidad de EDTA en la muestra para no interferir con el Mg²⁺ presente en la reacción. Si se usa el tampón TE regular para diluir la muestra, se observará un desequilibrio en el perfil de ADN, mientras que el tampón Low TE tendrá un mejor equilibrio. El tampón Low TE o tampón TE Low EDTA está compuesto por 10 mM Tris-HCl (pH 8.0) + 0.1 mM EDTA.
Véase también
- Tampón LB , tampón de borato de litio, un tampón similar que contiene iones de litio en lugar de Tris.
- Los tampones TAE y TBE se utilizan con frecuencia en procedimientos que involucran ácidos nucleicos, siendo la electroforesis el más común.
Referencias
Tampón TE pH 7,4 = 100 mM/L Tris (pH 7,4) + 10 mM/L EDTA (pH 8,0) del manual de Clonación Molecular: Un Manual de Laboratorio
- ↑ Yagi N, Satonaka K, Horio M, Shimogaki H, Tokuda Y, Maeda S (1996). "El papel de la DNasa y el EDTA en la degradación del ADN en tejidos fijados con formaldehído". Biotechnic & Histochemistry . 71 (3): 123– 129. doi : 10.3109/10520299609117148 . PMID 8724437 .
- ↑ Ross; Haites, Kelly (1990). "Congelación y descongelación repetidas de sangre periférica y ADN en suspensión: efectos sobre el rendimiento y la integridad del ADN" . Journal of Medical Genetics . 27 (9): 569– 570. doi : 10.1136/jmg.27.9.569 . PMC 1017219. PMID 2231649 .
Enlaces externos
- "OpenWetWare: búfer TE" . Consultado el 2 de julio de 2006 .
- Soluciones tampón