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Articulo de referencia

Lenguaje abierto de biología sintética

El Lenguaje Abierto de Biología Sintética ( SBOL ) [ 1 ] es un estándar de datos propuesto para el intercambio de diseños de biología sintética entre paquetes de software . [ 2 ...

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El Lenguaje Abierto de Biología Sintética ( SBOL ) [ 1 ] es un estándar de datos propuesto para el intercambio de diseños de biología sintética entre paquetes de software . [ 2 ] Ha estado en desarrollo por el Grupo de Desarrolladores de SBOL [ 3 ] desde 2008. Este grupo tiene como objetivo desarrollar el estándar de manera abierta y democrática para incluir la mayor cantidad de intereses posible y evitar el dominio de una sola empresa. El grupo también busca desarrollar y mejorar el estándar de diseño con el tiempo, a medida que el campo de la biología sintética refleje este desarrollo.

También se ha creado un lenguaje de modelado gráfico llamado SBOL Visual para visualizar los diseños SBOL. [ 4 ]

Símbolos visuales estándar del lenguaje abierto de biología sintética (SBOL): promotor , sitio de unión del cebador , cds , sitio de restricción , etc.

Comunicados

Referencias

  1. ↑ "El lenguaje abierto de biología sintética (SBOL)" .
  2. ↑ Galdzicki, Michal; Clancy, Kevin P; Oberortner, Ernst; Pocock, Matthew; Quinn, Jacqueline Y; Rodriguez, Cesar A; Roehner, Nicholas; Wilson, Mandy L; Adam, Laura; Anderson, J Christopher; Bartley, Bryan A; Beal, Jacob; Chandran, Deepak; Chen, Joanna; Densmore, Douglas; Endy, Drew; Grünberg, Raik; Hallinan, Jennifer; Hillson, Nathan J; Johnson, Jeffrey D; Kuchinsky, Allan; Lux, Matthew; Misirli, Goksel; Peccoud, Jean; Plahar, Hector A; Sirin, Evren; Stan, Guy-Bart; Villalobos, Alan; Wipat, Anil; Gennari, John H; Myers, Chris J; Sauro, Herbert M (6 de junio de 2014). "El lenguaje abierto de biología sintética (SBOL) proporciona un estándar comunitario para comunicar diseños en biología sintética" . Nature Biotechnology . 32 (6): 545– 550. doi : 10.1038/nbt.2891 . PMID 24911500 . 
  3. ↑ "Gobernanza | el Lenguaje Abierto de Biología Sintética (SBOL)" . sbolstandard.org . Archivado del original el 1 de diciembre de 2015.
  4. ↑ Quinn, Jacqueline Y.; Cox, Robert Sidney; Adler, Aaron; Beal, Jacob; Bhatia, Swapnil; Cai, Yizhi; Chen, Joanna; Clancy, Kevin; Galdzicki, Michal; Hillson, Nathan J.; Le Novère, Nicolas; Maheshwari, Akshay J.; McLaughlin, James Alastair; Myers, Chris J.; P, Umesh; Pocock, Matthew; Rodriguez, Cesar; Soldatova, Larisa; Stan, Guy-Bart V.; Swainston, Neil; Wipat, Anil; Sauro, Herbert M. (3 de diciembre de 2015). "SBOL Visual: Un lenguaje gráfico para diseños genéticos" . PLOS Biology . 13 (12) e1002310. doi : 10.1371/journal.pbio.1002310 . PMC 4669170 . PMID 26633141 .  
  5. ↑ Beal, Jacob; Cox, Robert Sidney; Grünberg, Raik; McLaughlin, James; Nguyen, Tramy; Bartley, Bryan; Bissell, Michael; Choi, Kiri; Clancy, Kevin; MacKlin, Chris; Madsen, Curtis; Misirli, Goksel; Oberortner, Ernst; Pocock, Matthew; Roehner, Nicholas; Samineni, Meher; Zhang, Michael; Zhang, Zhen; Zundel, Zach; Gennari, John H.; Myers, Chris; Sauro, Herbert; Wipat, Anil (2016). "Synthetic Biology Open Language (SBOL) Version 2.1.0" . Journal of Integrative Bioinformatics . 13 (3): 291. doi : 10.1515/jib-2016-291 . hdl : 1983/5e0058e9-0cfa-40a5-b0b8-6195f61ff524 . PMID 28187407 .