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Syntelog

Sinteólogo : un caso especial de homología genética donde conjuntos de genes se derivan de la misma región genómica ancestral . Esto puede surgir de eventos de especiación o a t...

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Sinteólogo : un caso especial de homología genética donde conjuntos de genes se derivan de la misma región genómica ancestral . Esto puede surgir de eventos de especiación o a través de eventos de duplicación genómica total o parcial (por ejemplo, poliploidía ). Este término se distingue de ortólogo , parálogo , parálogo interno, parálogo externo y xenólogo porque se refiere únicamente a la historia evolutiva de los genes evidenciada por la similitud de secuencia y la posición genómica relativa. [ 1 ]

Ejemplo

Comparación entre dos regiones genómicas de Arabidopsis thaliana derivadas de su evento de duplicación genómica más reciente. Los sinteólogos se indican mediante líneas rojas que conectan regiones de secuencia similares (recuadros rojos):

Análisis de secuencias y visualización de syntelogs realizados por GEvo. [ 2 ] Regenere este análisis en GEvo de CoGe usando este enlace . Las secuencias de GEvo se compararon usando el algoritmo BlastZ .

Véase también

Referencias

  1. ↑ Tang, Haibao; Bomhoff, Matthew D.; Briones, Evan; Zhang, Liangsheng; Schnable, James C.; Lyons, Eric (2015). "SynFind: Compilación de regiones sinténicas en cualquier conjunto de genomas bajo demanda" . Genome Biology and Evolution . 7 (12): 3286– 3298. doi : 10.1093/gbe/evv219 . ISSN 1759-6653 . PMC 4700967. PMID 26560340 .   
  2. ↑ Lyons, Eric; Pedersen, Brent; Kane, Josh; Freeling, Michael (2008). "El valor de los genomas no modelo y un ejemplo del uso de SynMap dentro de CoGe para analizar la hexaploidía que precede a las rosáceas" . Biología de las plantas tropicales . 1 ( 3–4 ): 181–190 . doi : 10.1007/s12042-008-9017-y .