Articulo de referencia

Actividad estelar

La actividad estrella es la relajación o alteración de la especificidad de la escisión del ADN mediada por enzimas de restricción , que puede ocurrir bajo condiciones de reacció...

La actividad estrella es la relajación o alteración de la especificidad de la escisión del ADN mediada por enzimas de restricción , que puede ocurrir bajo condiciones de reacción significativamente diferentes a las óptimas para la enzima. El resultado suele ser la escisión en sitios de reconocimiento no canónicos o, en ocasiones, la pérdida total de especificidad.

Las diferencias que pueden provocar actividad estrella incluyen baja fuerza iónica , pH alto y altas concentraciones de glicerol (> 5% v/v ) . [ 1 ] Esta última condición es de particular interés práctico, ya que las enzimas de restricción comerciales suelen suministrarse en un tampón que contiene una cantidad sustancial de glicerol (50% v/v es lo típico), lo que significa que una dilución insuficiente de la solución enzimática puede causar actividad estrella; este problema suele surgir durante digestiones dobles o múltiples. La actividad estrella puede ocurrir debido a la presencia de Mg 2+ , como se observa en HindIII , por ejemplo. Un tiempo de reacción prolongado también puede dar lugar a actividad estrella.

El término actividad estrella fue introducido por Mayer [ 2 ] quien caracterizó la actividad modificada en EcoRI .

  • Actividad estelar - Biolaboratorios de Nueva Inglaterra
  • Actividad estelar (relajación de la especificidad) Archivado el 27/09/2009 en Wayback Machine - Fermentas
  • Actividad estelar de las enzimas de restricción : una lista detallada de TaKaRa
  • Wei, H; Therrien, C; Blanchard, A; Guan, S; Zhu, Z (2008). "El índice de fidelidad proporciona una cuantificación sistemática de la actividad estrella de las endonucleasas de restricción del ADN" . Nucleic Acids Research . 36 (9): e50. doi : 10.1093/nar/ gkn182 . PMC 2396408. PMID 18413342 .  

Referencias

  1. Robinson, CR; Sliger, SG (1993). "Reconocimiento molecular mediado por agua ligada : un mecanismo para la actividad estrella de la endonucleasa de restricción EcoRI". Journal of Molecular Biology . 234 (2): 302– 306. doi : 10.1006/jmbi.1993.1586 . PMID 8230215 .  
  2. Mayer, Hubert (1978). "Optimización de la actividad EcoRI* de la endonucleasa EcoRI" . FEBS Lett . 90 (2): 341–44 . Bibcode : 1978FEBSL..90..341M . doi : 10.1016/0014-5793(78)80400-1 . PMID 352725 .