Extensión de base única

La extensión de una sola base (SBE, por sus siglas en inglés) es un método para determinar la identidad de una base nucleotídica en una posición específica a lo largo de un ácido nucleico . Este método se utiliza para identificar un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP, por sus siglas en inglés).

En este método, un cebador de oligonucleótido se hibrida con una región complementaria del ácido nucleico para formar un dúplex, con el extremo 3' terminal del cebador directamente adyacente a la base nucleotídica que se desea identificar. Mediante una ADN polimerasa, el cebador de oligonucleótido se extiende enzimáticamente con una sola base en presencia de los cuatro terminadores de nucleótidos; el terminador de nucleótido complementario a la base en la plantilla que se está analizando se incorpora y se identifica. La presencia de los cuatro terminadores suprime la incorporación errónea de nucleótidos no complementarios. Existen diversos métodos para determinar la identidad de un terminador incorporado, como el marcaje por fluorescencia, el marcaje de masas para espectrometría de masas, el marcaje isotópico y el marcaje de la base con un hapteno y su detección cromogénica con un conjugado de anticuerpo-enzima anti-hapteno (por ejemplo, mediante un ensayo ELISA).

El método fue inventado por Philip Goelet, Michael Knapp, Richard Douglas y Stephen Anderson mientras trabajaban en la empresa Molecular Tool. Este enfoque fue diseñado para la genotipificación de SNP de alto rendimiento y originalmente se denominó "Análisis de Bits Genéticos" (GBA). Illumina, Inc. utiliza este método en su tecnología Infinium ( http://www.illumina.com/technology/beadarray-technology/infinium-hd-assay.html ) para medir los niveles de metilación del ADN en el genoma humano .

• Philip Goelet, Michael R. Knapp, Stephen Anderson, (1999), Patente estadounidense n.º 5,888,819. Washington, DC: Oficina de Patentes y Marcas de los Estados Unidos.