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ARN SgrS

SgrS ( ARN pequeño relacionado con el transporte de azúcar , anteriormente llamado ryaA ) [ 1 ] es un ARN pequeño de 227 nucleótidos que es activado por SgrR en Escherichia coli...

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SgrS ( ARN pequeño relacionado con el transporte de azúcar , anteriormente llamado ryaA ) [ 1 ] es un ARN pequeño de 227 nucleótidos que es activado por SgrR en Escherichia coli durante el estrés por glucosa -fosfato. La naturaleza del estrés por glucosa-fosfato no se comprende completamente, pero está correlacionada con la acumulación intracelular de glucosa-6-fosfato . [ 2 ] SgrS ayuda a las células a recuperarse del estrés por glucosa-fosfato mediante el apareamiento de bases con el ARNm de ptsG (que codifica el transportador de glucosa) y causando su degradación de manera dependiente de la RNasa E. [ 3 ] [ 4 ] El apareamiento de bases entre SgrS y el ARNm de ptsG también requiere Hfq , una chaperona de ARN frecuentemente requerida por los ARN pequeños que afectan a sus objetivos a través del apareamiento de bases. [ 5 ] La incapacidad de las células que expresan sgrS para crear nuevos transportadores de glucosa conduce a una menor captación de glucosa y niveles reducidos de glucosa-6-fosfato . SgrS es un ARN pequeño inusual, ya que también codifica un polipéptido funcional de 43 aminoácidos , SgrT, que ayuda a las células a recuperarse del estrés por glucosa-fosfato al prevenir la captación de glucosa. La actividad de SgrT no afecta los niveles de ARNm de ptsG de la proteína PtsG. [ 2 ] Se ha propuesto que SgrT ejerce sus efectos a través de la regulación del transportador de glucosa, PtsG. [ 6 ] [ 7 ]

SgrS se descubrió originalmente en E. coli , pero desde entonces se han identificado homólogos en otras Gammaproteobacterias como Salmonella enterica y miembros del género Citrobacter . [ 8 ] Se ha desarrollado un enfoque de predicción de dianas basado en genómica comparativa que emplea estos homólogos y se utilizó para predecir la diana de SgrS, ptsI (b2416), que posteriormente se verificó experimentalmente. [ 9 ]

Referencias

  1. ↑ Vanderpool CK, Gottesman S (noviembre de 2004). "Participación de un nuevo activador transcripcional y un ARN pequeño en la regulación postranscripcional del sistema de fosfotransferasa de glucosa fosfoenolpiruvato" . Molecular Microbiology . 54 (4): 1076–89 . doi : 10.1111/j.1365-2958.2004.04348.x . PMID 15522088. S2CID 24804508 .  
  2. 1 2 Wadler CS, Vanderpool CK (diciembre de 2007). "Una doble función para un ARN pequeño bacteriano: SgrS realiza una regulación dependiente del apareamiento de bases y codifica un polipéptido funcional" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 (51): 20454– 9. doi : 10.1073/pnas.0708102104 . PMC 2154452. PMID 18042713 .  
  3. ↑ Vanderpool CK, Gottesman S (marzo de 2007). "El nuevo factor de transcripción SgrR coordina la respuesta al estrés por glucosa-fosfato" . Journal of Bacteriology . 189 (6): 2238–48 . doi : 10.1128/JB.01689-06 . PMC 1899371. PMID 17209026 .  
  4. ↑ Rice JB, Vanderpool CK (mayo de 2011). "El ARN pequeño SgrS controla la acumulación de azúcar-fosfato regulando múltiples genes PTS" . Nucleic Acids Research . 39 (9): 3806–19 . doi : 10.1093 / nar/gkq1219 . PMC 3089445. PMID 21245045 .  
  5. ↑ Kawamoto H, Koide Y, Morita T, Aiba H (agosto de 2006). "Requisito de apareamiento de bases para el silenciamiento de ARN por un ARN pequeño bacteriano y aceleración de la formación de dúplex por Hfq" . Molecular Microbiology . 61 (4): 1013–22 . doi : 10.1111/j.1365-2958.2006.05288.x . PMID 16859494. S2CID 35533720 .  
  6. ↑ Maki K, Morita T, Otaka H, ​​Aiba H (mayo de 2010). "Una región mínima de apareamiento de bases de un ARN pequeño bacteriano SgrS necesaria para la represión traslacional del ARNm de ptsG". Molecular Microbiology . 76 (3): 782–92 . doi : 10.1111 / j.1365-2958.2010.07141.x . PMID 20345651. S2CID 39687800 .  
  7. ↑ Kawamoto H, Morita T, Shimizu A, Inada T, Aiba H (febrero de 2005). "Implicación de la localización en membrana del ARNm diana en la acción de un ARN pequeño: mecanismo de regulación postranscripcional del transportador de glucosa en Escherichia coli" . Genes & Development . 19 (3): 328–38 . doi : 10.1101/gad.1270605 . PMC 546511. PMID 15650111 .  
  8. ↑ Horler RS, Vanderpool CK (septiembre de 2009). "Los homólogos del ARN pequeño SgrS están ampliamente distribuidos en bacterias entéricas, pero han divergido en tamaño y secuencia" . Nucleic Acids Research . 37 (16): 5465–76 . doi : 10.1093/nar/gkp501 . PMC 2760817. PMID 19531735 .  
  9. ↑ Wright PR, Richter AS, Papenfort K, Mann M, Vogel J, Hess WR, Backofen R, Georg J (septiembre de 2013). "La genómica comparativa impulsa la predicción de objetivos para los ARN pequeños bacterianos" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 110 (37): E3487-96. Bibcode : 2013PNAS..110E3487W . doi : 10.1073/pnas.1303248110 . PMC 3773804. PMID 23980183 .  

Lecturas adicionales

  • Vanderpool CK (abril de 2007). "Consecuencias fisiológicas de la regulación del estrés glucosa-fosfato mediada por ARN pequeños". Current Opinion in Microbiology . 10 (2): 146– 51. doi : 10.1016/j.mib.2007.03.011 . PMID 17383224 . 
  • Aiba H (abril de 2007). "Mecanismo de silenciamiento de ARN por ARN pequeños que se unen a Hfq". Current Opinion in Microbiology . 10 (2): 134– 9. doi : 10.1016/j.mib.2007.03.010 . PMID 17383928 . 
  • Sun Y, Vanderpool CK (noviembre de 2013). "Consecuencias fisiológicas de la regulación de múltiples objetivos por el ARN pequeño SgrS en Escherichia coli" . Journal of Bacteriology . 195 (21): 4804–15 . doi : 10.1128/JB.00722-13 . PMC 3807494. PMID 23873911 .  
  • Bobrovskyy M, Vanderpool CK (2014). " El ARN pequeño SgrS: funciones en el metabolismo y la patogénesis de las bacterias entéricas" . Frontiers in Cellular and Infection Microbiology . 4 : 61. doi : 10.3389/fcimb.2014.00061 . PMC 4021124. PMID 24847473 .  
  • Papenfort K, Sun Y, Miyakoshi M, Vanderpool CK, Vogel J (abril de 2013). "La activación del ARNm de la fosfatasa de azúcar mediada por ARN pequeño regula la homeostasis de la glucosa" . Cell . 153 ( 2): 426–37 . doi : 10.1016/j.cell.2013.03.003 . PMC 4151517. PMID 23582330 .  
  • Página para el ARN SgrS en Rfam
  • Página de sRNAmap para el ARN SgrS
  • Laboratorio Vanderpool
  • Laboratorio Aiba