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ARN específico del cuerpo de Cajal pequeño

Los ARN pequeños específicos del cuerpo de Cajal ( scaRNA ) son una clase de ARN nucleolares pequeños (snoRNA) que se localizan específicamente en el cuerpo de Cajal , un orgánu...

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Los ARN pequeños específicos del cuerpo de Cajal ( scaRNA ) son una clase de ARN nucleolares pequeños (snoRNA) que se localizan específicamente en el cuerpo de Cajal , un orgánulo nuclear (suborgánulo celular) involucrado en la biogénesis de las ribonucleoproteínas nucleares pequeñas (snRNP o snurp). Los scaRNA guían la modificación ( metilación y pseudouridilación ) de los ARN espliceosomales U1 , U2 , U4 , U5 y U12 transcritos por la ARN polimerasa II .

El primer scaRNA identificado fue U85. [ 1 ] Es diferente de los snoRNA típicos en que es un snoRNA compuesto de caja C/D y caja H/ACA y puede guiar tanto la pseudouridilación como la 2′- O -metilación. No todos los scaRNA son snoRNA compuestos de caja C/D y H/ACA y la mayoría de los scaRNA son estructural y funcionalmente indistinguibles de los snoRNA, dirigiendo la modificación del ARN ribosómico (ARNr) en el nucléolo .

scaRNAs de Drosophila

Varios estudios identificaron scaRNAs en Drosophila . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] Uno de los estudios mostró que varios scaRNAs de Drosophila podían funcionar igualmente bien en el nucleoplasma de moscas mutantes que carecen de cuerpos de Cajal. [ 4 ] Investigaciones posteriores mostraron que el scaRNA pugU6-40 se dirige al snRNA U6, cuya modificación ocurre en el nucléolo y no en el CB, y que pugU1-6 y pugU2-55 guían 2 ARN: snRNA y 28s rRNA. [ 5 ]

ARN 1 específico del cuerpo de Cajal pequeño

En biología molecular , el ARN 1 específico del cuerpo de Cajal pequeño (también conocido como SCARNA1 o ACA35) es un ARN nucleolar pequeño que se encuentra en los cuerpos de Cajal y se cree que está involucrado en la pseudouridilación del ARN espliceosómico U2 en el residuo U89.

El scaRNA1 es un ARN no codificante , que son productos funcionales de genes que no se traducen en proteínas . Estas moléculas de ARN suelen contener importantes motivos de estructura secundaria o de unión a ligandos y participan en muchos procesos biológicos importantes en la célula. [ 6 ]

scaRNA1 pertenece a la clase de snoRNAs con caja H/ACA , ya que tiene la estructura predicha de horquilla-bisagra-cola de horquilla, motivos conservados de caja H/ACA y se encuentra asociado con la proteína GAR1 . [ 7 ]

Referencias

  1. 1 2 Jády BE, Kiss T (febrero de 2001). "Un pequeño ARN guía nucleolar funciona tanto en la 2′- O -ribosa metilación como en la pseudouridilación del ARN espliceosómico U5" . The EMBO Journal . 20 (3): 541– 551. doi : 10.1093/ emboj /20.3.541 . PMC 133463. PMID 11157760 .  
  2. ^ Tortoriello G, Accardo MC, Scialò F, Angrisani A, Turano M, Furia M (mayo de 2009). "Un nuevo scaRNA antisentido de Drosophila con una función de guía prevista". Gen.​ 436 ( 1– 2): 56– 65. doi : 10.1016/j.gene.2009.02.005 . PMID 19230845 . 
  3. ↑ Tycowski KT, Shu MD, Kukoyi A, Steitz JA (abril de 2009). "Una proteína WD40 conservada se une a la señal de localización del cuerpo de Cajal de las partículas scaRNP" . Molecular Cell . 34 (1): 47– 57. doi : 10.1016/j.molcel.2009.02.020 . PMC 2700737. PMID 19285445 .  
  4. 1 2 Deryusheva S, Gall JG (diciembre de 2009). "Los ARN pequeños específicos del cuerpo de Cajal de Drosophila funcionan en ausencia de cuerpos de Cajal" . Biología molecular de la célula . 20 (24): 5250– 5259. doi : 10.1091/mbc.E09-09-0777 . PMC 2793299. PMID 19846657 .  
  5. 1 2 Deryusheva S, Gall JG (diciembre de 2013). "Nuevos ARN pequeños específicos del cuerpo de Cajal identificados en Drosophila: sondeo de la función del ARN guía" . RNA . 19 ( 12): 1802– 1814. doi : 10.1261/rna.042028.113 . PMC 3884663. PMID 24149844 .  
  6. ↑ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (junio de 2002). "ARN nucleares pequeños específicos del cuerpo de Cajal: una nueva clase de ARN guía de 2′-O-metilación y pseudouridilación" . The EMBO Journal . 21 (11): 2746– 2756. doi : 10.1093/ emboj /21.11.2746 . PMC 126017. PMID 12032087 .  
  7. ↑ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (julio de 2004). "Maquinaria de ARN guía de pseudouridilación de la caja H/ACA humana" . Biología molecular y celular . 24 (13): 5797– 5807. doi : 10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004 . PMC 480876. PMID 15199136 .  
  • snoRNAbase: base de datos de snoRNA humanos con cajas H/ACA y C/D
  • Página para el ARN específico del cuerpo de Cajal pequeño en Rfam