En experimentos donde es improbable que factores adicionales interactúen con otros factores, se puede utilizar una matriz saturada. En una matriz saturada , un factor controlable sustituye la interacción de dos o más subproductos. Mediante una matriz saturada, se podría utilizar una matriz de prueba de dos factores para evaluar tres factores. El uso de la matriz saturada permite evaluar tres factores en cuatro pruebas en lugar de ocho, como requeriría una matriz ortogonal estándar .
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