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ResFinder

ResFinder es una base de datos que captura genes de resistencia antimicrobiana a partir de conjuntos de datos de genoma completo . [ 1 ] La base de datos utiliza BLAST para logr...

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ResFinder es una base de datos que captura genes de resistencia antimicrobiana a partir de conjuntos de datos de genoma completo . [ 1 ] La base de datos utiliza BLAST para lograr esto. La base de datos permite la entrada de secuencias completas , secuencias parciales o lecturas de secuencias cortas de otras plataformas de secuenciación. [ 1 ] Además, los usuarios pueden establecer su propio umbral de detección. Por defecto, es del 100 % de ID. ResFinder obtiene información de otras bases de datos como la base de datos Marilyn Roberts, la base de datos Lahey (ahora desaparecida) y ARDB . Otras fuentes incluyen literatura publicada, incluidas revisiones. [ 2 ] [ 3 ]

Véase también

Referencias

  1. 1 2 Zankari, E.; Hasman, H.; Cosentino, S.; Vestergaard, M.; Rasmussen, S.; Lund, O.; Aarestrup, FM; Larsen, MV (2012-11-01). "Identificación de genes de resistencia antimicrobiana adquirida" . Journal of Antimicrobial Chemotherapy . 67 (11): 2640– 2644. doi : 10.1093/ jac /dks261 . ISSN 0305-7453 . PMC 3468078. PMID 22782487 .   
  2. ↑ RATHER, P (1998). "Orígenes de las enzimas modificadoras de aminoglucósidos". Drug Resistance Updates . 1 (5): 285– 291. doi : 10.1016/s1368-7646(98)80044-7 . ISSN 1368-7646 . PMID 17092809 .  
  3. ↑ van Hoek, Angela HAM; Mevius, Dik; Guerra, Beatriz; Mullany, Peter; Roberts, Adam Paul; Aarts, Henk JM (2011). "Genes de resistencia adquirida a antibióticos: una visión general" . Frontiers in Microbiology . 2 : 203. doi : 10.3389/fmicb.2011.00203 . ISSN 1664-302X . PMC 3202223. PMID 22046172 .