RNasa R

La RNasa R , o ribonucleasa R, es una exorribonucleasa 3'→5' que pertenece a la superfamilia de la RNasa II , un grupo de enzimas que hidrolizan el ARN en dirección 3'-5'. Se ha demostrado que la RNasa R participa en la degradación selectiva del ARNm , en particular de los ARNm sin codón de parada en bacterias. ^{[ 1 ] [ 2 ]} La RNasa R tiene homólogos en muchos otros organismos.

Cuando una parte de otra proteína más grande tiene un dominio muy similar a la RNasa R, se le denomina dominio de RNasa R.

La RNasa R garantiza la precisión de la traducción, la correcta maduración del ARNr y la eliminación de los ARNr anormales, y es empleada por el sistema de trans -traducción para degradar los ARNm dañados. ^{[ 3 ]}

En Escherichia coli , la RNasa R es una proteína de 92 kD, con la capacidad característica de degradar sustratos de ARN estructurados sin mostrar especificidad de secuencia. Por lo tanto, la RNasa R actúa sobre una variedad de sustratos, como ARN ribosómico, de transferencia, mensajero y pequeños ARN no codificantes. La RNasa R está asociada con un complejo de ribonucleoproteínas que contiene tmRNA y SmpB, y participa en el desarrollo de tmRNA bajo choque térmico. ^{[ 3 ]}

La RNasa R también se asocia con los ribosomas y participa en los procesos de control de calidad del ARNr o ARN ribosómico. La RNasa R tiene afinidad in vitro por el ARNr. En varias vías de control de calidad del ARNr, la RNasa R actúa como factor principal al potenciar la eliminación de moléculas de ARNr defectuosas. Esta proteína también es fundamental para el procesamiento de los precursores del ARNr y para la observación de la integridad del ribosoma. ^{[ 3 ]}

La RNasa R tiene dos dominios de choque por frío, un dominio catalítico de RNasa, un dominio S1 y un dominio básico. ^{[ 4 ]}

La sobreabundancia de RNasa R en una célula es dañina, ya que la RNasa R es más activa y más eficaz en la degradación de ARN que otras exorribonucleasas bacterianas, como la RNasa II . ^{[ 5 ]} Además de los ARN sustrato que forman ARN de doble cadena con extremos 3' sobresalientes más cortos de siete nucleótidos, la RNasa R puede degradar todos los ARN lineales. ^{[ 6 ]} Para la digestión metódica de ARN lineales eucariotas, la RNasa R es una buena exorribonucleasa de 3' a 5', pero existen casos poco frecuentes de resistencia a la RNasa R. Dado que los ARNm no están protegidos químicamente en sus extremos 3', a diferencia de la protección que proporciona la estructura de la caperuza en sus extremos 5', la RNasa R degrada con éxito los ARNm lineales desde sus extremos 3' desprotegidos. ^{[ 4 ]}