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RNPS1

La proteína de unión al ARN con dominio rico en serina 1 es una proteína que en los humanos está codificada por el gen RNPS1 . [5] [6] [7] Función Este gen codifica una proteína...

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La proteína de unión al ARN con dominio rico en serina 1 es una proteína que en los humanos está codificada por el gen RNPS1 . [5] [6] [7]

Función

Este gen codifica una proteína que forma parte de un complejo multiproteico posterior al empalme, el complejo de unión exónica , que participa tanto en la exportación nuclear del ARNm como en la vigilancia del ARNm. La vigilancia del ARNm detecta los ARNm exportados con marcos de lectura abiertos truncados e inicia la desintegración del ARNm mediada por sinsentidos (NMD). Cuando la traducción termina aguas arriba de la última unión exón-exón, esto desencadena la NMD para degradar los ARNm que contienen codones de terminación prematuros. Esta proteína se une al ARNm y permanece unida después de la exportación nuclear, actuando como una proteína de transporte nucleocitoplasmático. Esta proteína contiene muchos residuos de serina. Se han encontrado dos variantes de empalme para este gen; ambas variantes codifican la misma proteína. [7]

Interacciones

Se ha demostrado que RNPS1 interactúa con SART3 [8] y Pinin . [9] [10]

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000205937 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000034681 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ Loyer P, Trembley JH, Lahti JM, Kidd VJ (junio de 1998). "La proteína RNP, RNPS1, se asocia con isoformas específicas de la proteína quinasa PITSLRE relacionada con p34cdc2 in vivo". Journal of Cell Science . 111 (Pt 11) (11): 1495–506. doi :10.1242/jcs.111.11.1495. PMID  9580558.
  6. ^ Badolato J, Gardiner E, Morrison N, Eisman J (diciembre de 1995). "Identificación y caracterización de una nueva proteína de unión al ARN humano". Gene . 166 (2): 323–7. doi :10.1016/0378-1119(95)00571-4. PMID  8543184.
  7. ^ ab "Gen Entrez: proteína de unión a ARN RNPS1 S1, dominio rico en serina".
  8. ^ Harada K, Yamada A, Yang D, Itoh K, Shichijo S (septiembre de 2001). "Unión de un antígeno de rechazo tumoral SART3 a un factor de empalme de pre-ARNm RNPS1: una posible regulación del empalme mediante la formación de un complejo". Revista internacional del cáncer . 93 (5): 623–8. doi : 10.1002/ijc.1391 . PMID  11477570. S2CID  24724555.
  9. ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Mapeo a gran escala de interacciones proteína-proteína humanas mediante espectrometría de masas". Biología de sistemas moleculares . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948 . Número de modelo:  PMID17353931. 
  10. ^ Li C, Lin RI, Lai MC, Ouyang P, Tarn WY (octubre de 2003). "La proteína nuclear Pnn/DRS se une a los mRNP empalmados y participa en el procesamiento y la exportación del ARNm a través de la interacción con RNPS1". Biología molecular y celular . 23 (20): 7363–76. doi :10.1128/MCB.23.20.7363-7376.2003. PMC 230327 . PMID  14517304. 

Lectura adicional

  • Burn TC, Connors TD, Van Raay TJ, Dackowski WR, Millholland JM, Klinger KW, Landes GM (junio de 1996). "Generación de un mapa transcripcional para una región de 700 kb que rodea los genes de la enfermedad renal poliquística tipo 1 (PKD1) y la esclerosis tuberosa tipo 2 (TSC2) en el cromosoma humano 16p3.3". Genome Research . 6 (6): 525–37. doi : 10.1101/gr.6.6.525 . PMID  8828041.
  • Wilson KF, Fortes P, Singh US, Ohno M, Mattaj IW, Cerione RA (febrero de 1999). "El complejo de unión a la tapa nuclear es un nuevo objetivo de la transducción de señales acoplada al receptor del factor de crecimiento". The Journal of Biological Chemistry . 274 (7): 4166–73. doi : 10.1074/jbc.274.7.4166 . PMID  9933612.
  • Mayeda A, Badolato J, Kobayashi R, Zhang MQ, Gardiner EM, Krainer AR (agosto de 1999). "Purificación y caracterización de RNPS1 humana: un activador general del empalme de pre-ARNm". The EMBO Journal . 18 (16): 4560–70. doi :10.1093/emboj/18.16.4560. PMC  1171530 . PMID  10449421.
  • Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (diciembre de 2000). "El espliceosoma deposita múltiples proteínas 20-24 nucleótidos aguas arriba de las uniones exón-exón del ARNm". The EMBO Journal . 19 (24): 6860–9. doi :10.1093/emboj/19.24.6860. PMC  305905 . PMID  11118221.
  • Harada K, Yamada A, Yang D, Itoh K, Shichijo S (septiembre de 2001). "Unión de un antígeno de rechazo tumoral SART3 a un factor de empalme de pre-ARNm RNPS1: una posible regulación del empalme mediante la formación de un complejo". Revista internacional del cáncer . 93 (5): 623–8. doi : 10.1002/ijc.1391 . PMID  11477570. S2CID  24724555.
  • Kim VN, Kataoka N, Dreyfuss G (septiembre de 2001). "Función del factor de desintegración mediado por sinsentido hUpf3 en el complejo de unión exón-exón dependiente del empalme". Science . 293 (5536): 1832–6. Bibcode :2001Sci...293.1832K. doi :10.1126/science.1062829. PMID  11546873. S2CID  12018200.
  • Lykke-Andersen J, Shu MD, Steitz JA (septiembre de 2001). "Comunicación de la posición de las uniones exón-exón a la maquinaria de vigilancia del ARNm por la proteína RNPS1". Science . 293 (5536): 1836–9. Bibcode :2001Sci...293.1836L. doi :10.1126/science.1062786. PMID  11546874. S2CID  389385.
  • Lejeune F, Ishigaki Y, Li X, Maquat LE (julio de 2002). "El complejo de unión de exones se detecta en el ARNm unido a CBP80 pero no en el ARNm unido a eIF4E en células de mamíferos: dinámica de la remodelación del ARNm". The EMBO Journal . 21 (13): 3536–45. doi :10.1093/emboj/cdf345. PMC  126094 . PMID  12093754.
  • McCracken S, Longman D, Johnstone IL, Cáceres JF, Blencowe BJ (noviembre de 2003). "Un papel conservado evolutivamente para SRm160 en el procesamiento del extremo 3' que funciona independientemente de la formación del complejo de unión de exones". The Journal of Biological Chemistry . 278 (45): 44153–60. doi : 10.1074/jbc.M306856200 . PMID  12944400.
  • Li C, Lin RI, Lai MC, Ouyang P, Tarn WY (octubre de 2003). "La proteína nuclear Pnn/DRS se une a los ARNm empalmados y participa en el procesamiento y la exportación del ARNm a través de la interacción con RNPS1". Biología molecular y celular . 23 (20): 7363–76. doi :10.1128/MCB.23.20.7363-7376.2003. PMC  230327 . PMID  14517304.
  • Kataoka N, Dreyfuss G (febrero de 2004). "Un sistema simple de lisado de células enteras para el empalme in vitro revela un ensamblaje por pasos del complejo de unión exón-exón". The Journal of Biological Chemistry . 279 (8): 7009–13. doi : 10.1074/jbc.M307692200 . PMID  14625303.
  • Sakashita E, Tatsumi S, Werner D, Endo H, Mayeda A (febrero de 2004). "RNPS1 humano y sus factores asociados: un regulador versátil alternativo del empalme del pre-ARNm in vivo". Biología molecular y celular . 24 (3): 1174–87. doi :10.1128/MCB.24.3.1174-1187.2004. PMC  321435 . PMID  14729963.
  • Nott A, Le Hir H, Moore MJ (enero de 2004). "El empalme mejora la traducción en células de mamíferos: una función adicional del complejo de unión de exones". Genes & Development . 18 (2): 210–22. doi :10.1101/gad.1163204. PMC  324426 . PMID  14752011.
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (agosto de 2004). "Caracterización a gran escala de las fosfoproteínas nucleares de células HeLa". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (33): 12130–5. Bibcode :2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446 . PMID  15302935.
  • Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (agosto de 2004). "Análisis proteómico, funcional y basado en dominios de proteínas de unión 14-3-3 in vivo implicadas en la regulación del citoesqueleto y la organización celular". Current Biology . 14 (16): 1436–50. Bibcode :2004CBio...14.1436J. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID  15324660. S2CID  2371325.
  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : Q15287 (proteína de unión a ARN con dominio rico en serina 1) en PDBe-KB .
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