Hispanopedia WikiEn biología estructural , un protómero es la unidad estructural de una proteína oligomérica . Es la unidad más pequeña compuesta por al menos una cadena proteica. Los protómeros se asocian para formar un oligómero mayor , compuesto por dos o más copias de esta unidad. Los protómeros suelen organizarse con simetría cíclica para formar simetrías de grupo puntual cerradas .
El término fue introducido por Chetverin [ 1 ] para unificar la nomenclatura de la enzima Na/K-ATPasa . Esta enzima está compuesta por dos subunidades: una subunidad α catalítica grande y una subunidad β de glicoproteína más pequeña (además de un proteolípido , llamado subunidad γ). En aquel entonces, no estaba claro cuántas de cada una funcionaban juntas. Además, cuando se hablaba de un dímero , no quedaba claro si se referían a αβ o a (αβ) ₂ . Chetverin sugirió llamar a αβ protómero y a (αβ) ₂ diprotómero. Así, en el trabajo de Chetverin, el término protómero se aplicó únicamente a un hetero-oligómero y, posteriormente, se utilizó principalmente en el contexto de hetero-oligómeros. Siguiendo este uso, un protómero consta de al menos dos cadenas proteicas diferentes. En la literatura actual de biología estructural, el término también se aplica comúnmente a la unidad más pequeña de los homo-oligómeros , evitando el término " monómero ".
En química , un protómero es una molécula que presenta tautomería debido a la posición de un protón. [ 2 ] [ 3 ]
Ejemplos
La hemoglobina es un heterotetrámero compuesto por cuatro subunidades (dos α y dos β). Sin embargo, estructural y funcionalmente, la hemoglobina se describe mejor como (αβ) ₂ , por lo que la denominamos dímero de dos protómeros αβ, es decir, un diprotómero. [ 4 ]
La aspartato carbamoiltransferasa tiene una composición de subunidades α 6 β 6. Los seis protómeros αβ están dispuestos con simetría D 3 .
Las cápsides virales suelen estar compuestas por protómeros.
La proteasa del VIH-1 forma un homodímero compuesto por dos protómeros.
En química, algunos ejemplos son la tirosina y el ácido 4-aminobenzoico . La primera puede desprotonarse para formar los aniones carboxilato y fenoxido, [ 5 ] y el segundo puede protonarse en los grupos amino o carboxilo. [ 6 ]
Referencias
- ↑ Chetverin, AB (1986). "Evidencia de una estructura diprotomérica de la Na, K-ATPasa: determinación precisa de la concentración de proteínas y análisis cuantitativo de grupos terminales" . FEBS Lett . 196 (1): 121– 125. Bibcode : 1986FEBSL.196..121C . doi : 10.1016/0014-5793(86)80225-3 . PMID 3002859 .
- ^ PM Lalli, BA Iglesias, HE Toma, GF de Sa, RJ Daroda, JC Silva Filho, JE Szulejko, K. Araki y MN Eberlin, J. Mass Spectrom., 2012, 47, 712–719.
- ↑ C. Lapthorn, TJ Dines, BZ Chowdhry, GL Perkins y FS Pullen, Rapid Commun. Mass Spectrom., 2013, 27, 2399–2410.
- ↑ Buxbaum, E. (2007). Fundamentos de la estructura y función de las proteínas . Nueva York: Springer. págs. 105–120 . ISBN 978-0-387-26352-6.
- ↑ J. Am. Chem. Soc., 2009, 131 (3), págs. 1174–1181
- ↑ J. Phys. Chem. A, 2011, 115 (26), págs. 7625–7632
Enlaces externos
- Biología estructural
- Química de polímeros
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