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Predictores de agregación de proteínas

Métodos computacionales que utilizan la secuencia y/o la estructura de proteínas para predecir la agregación de proteínas . La siguiente tabla muestra las principales caracterís...

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Métodos computacionales que utilizan la secuencia y/o la estructura de proteínas para predecir la agregación de proteínas . La siguiente tabla muestra las principales características del software para la predicción de la agregación de proteínas.

Mesa

Véase también

Caja de herramientas PhasAGE

Amiloide

Agregación de proteínas

Referencias

  1. ↑ Paz, Manuela López de la; Serrano, Luis (2004-01-06). "Determinantes de secuencia de la formación de fibrillas amiloides" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 101 (1): 87– 92. Bibcode : 2004PNAS..101...87L . doi : 10.1073/pnas.2634884100 . ISSN 0027-8424 . PMC 314143. PMID 14691246 .   
  2. ↑ Rousseau, F; Schymkowitz, J; Serrano, L (febrero de 2006). "Agregación de proteínas y amiloidosis: ¿confusión de tipos?" . Current Opinion in Structural Biology . 16 (1): 118– 126. doi : 10.1016/j.sbi.2006.01.011 . PMID 16434184 . 
  3. ↑ Fernandez-Escamilla, Ana-Maria; Rousseau, Frederic; Schymkowitz, Joost; Serrano, Luis (octubre de 2004). "Predicción de efectos dependientes de la secuencia y mutacionales en la agregación de péptidos y proteínas" . Nature Biotechnology . 22 (10): 1302– 1306. Bibcode : 2004NatBi..22.1302F . doi : 10.1038/nbt1012 . ISSN 1087-0156 . PMID 15361882. S2CID 41481025 .   
  4. ↑ Linding, Rune; Schymkowitz, Joost; Rousseau, Frederic; Diella, Francesca; Serrano, Luis (septiembre de 2004). "Un estudio comparativo de la relación entre la estructura de las proteínas y la β-agregación en proteínas globulares e intrínsecamente desordenadas" . Journal of Molecular Biology . 342 (1): 345– 353. doi : 10.1016/j.jmb.2004.06.088 . PMID 15313629 . 
  5. ↑ Galzitskaya, Oxana V.; Garbuzynskiy, Sergiy O.; Lobanov, Michail Yurievich (2006-12-29). "Predicción de regiones amiloidogénicas y desordenadas en cadenas proteicas" . PLOS Computational Biology . 2 (12) e177. Bibcode : 2006PLSCB...2..177G . doi : 10.1371/journal.pcbi.0020177 . ISSN 1553-7358 . PMC 1761655. PMID 17196033 .   
  6. ↑ Zibaee, Shahin; Makin, O. Sumner; Goedert, Michel; Serpell, Louise C. (mayo de 2007). "Un algoritmo simple localiza las hebras β en el núcleo de la fibrilla amiloide de la α-sinucleína, Aβ y tau utilizando únicamente la secuencia de aminoácidos" . Protein Science . 16 (5): 906–918 . doi : 10.1110/ps.062624507 . PMC 2206631. PMID 17456743 .  
  7. ↑ Zhang, Zhuqing; Chen, Hao; Lai, Luhua (2007-09-01). "Identificación de segmentos formadores de fibrillas amiloides basada en la estructura y el potencial estadístico basado en residuos" . Bioinformatics . 23 (17): 2218– 2225. doi : 10.1093/bioinformatics/btm325 . ISSN 1367-4803 . PMID 17599928 .  
  8. ↑ Conchillo-Solé, Óscar; de Groot, Natalia S.; Avilés, Francesc X.; Vendrell, Josep; Daura, Xavier; Ventura, Salvador (27 de febrero de 2007). "AGGRESCAN: un servidor para la predicción y evaluación de "puntos calientes" de agregación en polipéptidos" . Bioinformática BMC . 8 (1): 65. Código Bib : 2007BMCBi...8...65C . doi : 10.1186/1471-2105-8-65 . ISSN 1471-2105 . PMC 1828741 . PMID 17324296 .   
  9. ↑ Zibaee, Shahin; Makin, O. Sumner; Goedert, Michel; Serpell, Louise C. (2007). "Un algoritmo simple localiza las hebras β en el núcleo de la fibrilla amiloide de la α-sinucleína, Aβ y tau utilizando únicamente la secuencia de aminoácidos" . Protein Science . 16 (5): 906– 918. doi : 10.1110/ps.062624507 . ISSN 1469-896X . PMC 2206631. PMID 17456743 .   
  10. ↑ Pawlicki, Sandrine; Le Béchec, Antony; Delamarche, Christian (10 de junio de 2008). "AMYPdb: Una base de datos dedicada a las proteínas precursoras de amiloide" . BMC Bioinformatics . 9 (1): 273. doi : 10.1186/1471-2105-9-273 . ISSN 1471-2105 . PMC 2442844. PMID 18544157 .   
  11. ↑ Tian, ​​Jian; Wu, Ningfeng; Guo, Jun; Fan, Yunliu (30 de enero de 2009). "Predicción de segmentos formadores de fibrillas amiloides basada en una máquina de vectores de soporte" . BMC Bioinformatics . 10 (1): S45. doi : 10.1186/1471-2105-10-S1-S45 . ISSN 1471-2105 . PMC 2648769. PMID 19208147 .   
  12. ↑ Kim, C.; Choi, J.; Lee, SJ; Welsh, WJ; Yoon, S. (2009-07-01). "NetCSSP: aplicación web para predecir secuencias camaleónicas y formación de fibrillas amiloides" . Nucleic Acids Research . 37 (Servidor web): W469– W473. doi : 10.1093/nar/gkp351 . ISSN 0305-1048 . PMC 2703942. PMID 19468045 .   
  13. ↑ Yoon, Sukjoon; Welsh, William J.; Jung, Heeyoung; Yoo, Young Do (octubre de 2007). "CSSP2: Un método mejorado para predecir la propensión a la estructura secundaria dependiente del contacto" . Computational Biology and Chemistry . 31 ( 5–6 ): 373–377 . doi : 10.1016/j.compbiolchem.2007.06.002 . PMID 17644485 . 
  14. ↑ Yoon, Sukjoon; Welsh, William J. (2005-04-22). "Evaluación rápida de la propensión a la estructura secundaria dependiente del contacto: relevancia para las secuencias amiloidogénicas" . Proteins : Structure, Function, and Bioinformatics . 60 (1): 110– 117. doi : 10.1002/prot.20477 . PMID 15849755. S2CID 44309651 .  
  15. ↑ Yoon, Sukjoon; Welsh, William J. (agosto de 2004). "Detección de la propensión de secuencia oculta para la formación de fibrillas amiloides" . Protein Science . 13 (8): 2149– 2160. doi : 10.1110/ps.04790604 . ISSN 0961-8368 . PMC 2279810. PMID 15273309 .   
  16. ↑ Bryan, Allen W. Jr.; Menke, Matthew; Cowen, Lenore J.; Lindquist, Susan L.; Berger, Bonnie (2009-03-27). " BETASCAN: Probables β-amiloides identificados mediante análisis probabilístico por pares" . PLOS Computational Biology . 5 (3) e1000333. Bibcode : 2009PLSCB...5E0333B . doi : 10.1371/journal.pcbi.1000333 . ISSN 1553-7358 . PMC 2653728. PMID 19325876 .   
  17. ↑ Garbuzynskiy, SO; Lobanov, M. Yu.; Galzitskaya, OV (2010-02-01). "FoldAmyloid: un método de predicción de regiones amiloidogénicas a partir de la secuencia de proteínas" . Bioinformatics . 26 (3): 326– 332. doi : 10.1093/bioinformatics/btp691 . ISSN 1367-4803 . PMID 20019059 .  
  18. ↑ Oliveberg, Mikael (marzo de 2010). "Waltz, un nuevo y emocionante paso en la predicción de amiloide" . Nature Methods . 7 (3): 187–188 . doi : 10.1038/nmeth0310-187 . ISSN 1548-7091 . PMID 20195250. S2CID 205417298 .   
  19. ↑ Maurer-Stroh, Sebastian; Debulpaep, Maja; Kuemmerer, Nico; de la Paz, Manuela Lopez; Martins, Ivo Cristiano; Reumers, Joke; Morris, Kyle L.; Copland, Alastair; Serpell, Louise; Serrano, Luis; Schymkowitz, Joost WH (marzo de 2010). " Explorando los determinantes de secuencia de la estructura amiloide usando matrices de puntuación específicas de posición" . Nature Methods . 7 (3): 237– 242. doi : 10.1038/nmeth.1432 . ISSN 1548-7105 . PMID 20154676. S2CID 52874481 .   
  20. ↑ Thompson, Michael J.; Sievers, Stuart A.; Karanicolas, John; Ivanova, Magdalena I.; Baker, David; Eisenberg, David (2006-03-14). "El método de perfil 3D para identificar segmentos formadores de fibrillas de proteínas" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 103 ( 11): 4074– 4078. Bibcode : 2006PNAS..103.4074T . doi : 10.1073/pnas.0511295103 . ISSN 0027-8424 . PMC 1449648. PMID 16537487 .   
  21. ↑ Nelson, Rebecca; Sawaya, Michael R.; Balbirnie, Melinda; Madsen, Anders Ø; Riekel, Christian; Grothe, Robert; Eisenberg, David (junio de 2005). "Estructura de la espina β cruzada de las fibrillas similares al amiloide" . Nature . 435 ( 7043): 773–778 . Bibcode : 2005Natur.435..773N . doi : 10.1038/nature03680 . ISSN 1476-4687 . PMC 1479801. PMID 15944695 .   
  22. ↑ Kuhlman, Brian; Baker, David (12 de septiembre de 2000). "Las secuencias de proteínas nativas son casi óptimas para sus estructuras" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 97 (19): 10383– 10388. Bibcode : 2000PNAS...9710383K . doi : 10.1073 / pnas.97.19.10383 . ISSN 0027-8424 . PMC 27033. PMID 10984534 .   
  23. ↑ Sawaya, Michael R.; Sambashivan, Shilpa; Nelson, Rebecca; Ivanova, Magdalena I.; Sievers, Stuart A.; Apostol, Marcin I.; Thompson, Michael J.; Balbirnie, Melinda; Wiltzius, Jed JW; McFarlane, Heather T.; Madsen, Anders Ø. (mayo de 2007). "Estructuras atómicas de espinas β cruzadas amiloides revelan cremalleras estéricas variadas" . Nature . 447 (7143): 453– 457. Bibcode : 2007Natur.447..453S . doi : 10.1038 / nature05695 . ISSN 0028-0836 . PMID 17468747. S2CID 4400866 .   
  24. ↑ Bryan, Allen W.; O'Donnell, Charles W.; Menke, Matthew; Cowen, Lenore J.; Lindquist, Susan; Berger, Bonnie (febrero de 2012). "STITCHER: ensamblaje dinámico de probables estructuras β de amiloide y prión a partir de predicciones de estructura secundaria" . Proteins : Structure, Function, and Bioinformatics . 80 (2): 410– 420. doi : 10.1002/prot.23203 . ISSN 0887-3585 . PMC 3298606. PMID 22095906 .   
  25. ↑ Tian, ​​Jian; Wu, Ningfeng; Guo, Jun; Fan, Yunliu (enero de 2009). "Predicción de segmentos formadores de fibrillas amiloides basada en una máquina de vectores de soporte" . BMC Bioinformatics . 10 (S1): S45. doi : 10.1186/1471-2105-10-S1-S45 . ISSN 1471-2105 . PMC 2648769. PMID 19208147 .   
  26. ↑ Zibaee, Shahin; Makin, O. Sumner; Goedert, Michel; Serpell, Louise C. (mayo de 2007). "Un algoritmo simple localiza las hebras β en el núcleo de la fibrilla amiloide de la α-sinucleína, Aβ y tau utilizando únicamente la secuencia de aminoácidos" . Protein Science . 16 (5): 906–918 . doi : 10.1110/ps.062624507 . PMC 2206631. PMID 17456743 .  
  27. ↑ Maurer-Stroh, Sebastian; Debulpaep, Maja; Kuemmerer, Nico; de la Paz, Manuela Lopez; Martins, Ivo Cristiano; Reumers, Joke; Morris, Kyle L; Copland, Alastair; Serpell, Louise; Serrano, Luis; Schymkowitz, Joost WH (marzo de 2010). " Explorando los determinantes de secuencia de la estructura amiloide usando matrices de puntuación específicas de posición" . Nature Methods . 7 (3): 237– 242. doi : 10.1038/nmeth.1432 . ISSN 1548-7091 . PMID 20154676. S2CID 52874481 .   
  28. ↑ Garbuzynskiy, SO; Lobanov, M. Yu.; Galzitskaya, OV (2010-02-01). "FoldAmyloid: un método de predicción de regiones amiloidogénicas a partir de la secuencia de proteínas" . Bioinformatics . 26 (3): 326– 332. doi : 10.1093/bioinformatics/btp691 . ISSN 1367-4803 . PMID 20019059 .  
  29. ↑ Tsolis, Antonios C.; Papandreou, Nikos C.; Iconomidou, Vassiliki A.; Hamodrakas, Stavros J. (2013-01-10). "Un método de consenso para la predicción de péptidos 'propensos a la agregación' en proteínas globulares" . PLOS ONE . 8 (1) e54175. Bibcode : 2013PLoSO...854175T . doi : 10.1371/journal.pone.0054175 . ISSN 1932-6203 . PMC 3542318. PMID 23326595 .   
  30. ↑ Walsh, Ian; Seno, Flavio; Tosatto, Silvio CE; Trovato, Antonio (2014-05-21). "PASTA 2.0: un servidor mejorado para la predicción de la agregación de proteínas" . Nucleic Acids Research . 42 (W1): W301– W307. doi : 10.1093 / nar/gku399 . ISSN 1362-4962 . PMC 4086119. PMID 24848016 .   
  31. ↑ Gasior, Pawel; Kotulska, Malgorzata (diciembre de 2014). "FISH Amyloid: un nuevo método para encontrar segmentos amiloidogénicos en proteínas basado en la coocurrencia específica de sitios [ sic ] de aminoácidos" . BMC Bioinformatics . 15 (1): 54. doi : 10.1186/1471-2105-15-54 . ISSN 1471-2105 . PMC 3941796. PMID 24564523 .   
  32. ↑ Thangakani, A. Mary; Kumar, Sandeep; Nagarajan, R.; Velmurugan, D.; Gromiha, M. Michael (2014-03-28). "GAP: hacia una predicción de casi el 100 por ciento para péptidos agregantes mediados por hebras β con morfologías distintas" . Bioinformatics . 30 (14): 1983– 1990. doi : 10.1093/bioinformatics/btu167 . ISSN 1460-2059 . PMID 24681906 .  
  33. ↑ Thangakani, Anthony Mary; Kumar, Sandeep; Velmurugan, Devadasan; Gromiha, Maria Siluvay Michael (abril de 2012). "¿Cómo resisten las proteínas termófilas la agregación?" . Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics . 80 (4): 1003– 1015. doi : 10.1002/prot.24002 . PMID 22389104 . S2CID 21496810 .  
  34. ↑ Gromiha, M. Michael; Thangakani, A. Mary; Kumar, Sandeep; Velmurugan, D. (2012), "Análisis de secuencia y discriminación de péptidos amiloides y no amiloides" , en Huang, De-Shuang; Gupta, Phalguni; Zhang, Xiang; Premaratne, Prashan (eds.), Tecnologías y aplicaciones emergentes de computación inteligente , Communications in Computer and Information Science, vol. 304, Berlín, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, pp. 447–452 , doi : 10.1007/978-3-642-31837-5_65 , ISBN   978-3-642-31836-8, consultado el 26 de noviembre de 2021
  35. ↑ Thangakani, A Mary; Kumar, Sandeep; Velmurugan, D; Gromiha, M Michael (mayo de 2013). "Características de secuencia específicas de posición distintivas de hexapéptidos que forman fibrillas amiloides: aplicación para discriminar entre secuencias peptídicas formadoras de fibrillas amiloides y agregados β amorfos" . BMC Bioinformatics . 14 (S8): S6. doi : 10.1186/1471-2105-14-S8-S6 . ISSN 1471-2105 . PMC 3654898. PMID 23815227 .   
  36. ↑ Família, Carlos; Dennison, Sarah R.; Quintas, Alexandre; Phoenix, David A. (2015-08-04). Permyakov, Eugene A. (ed.). "Predicción de la propensión de péptidos y proteínas a la formación de amiloide" . PLOS ONE . 10 (8) e0134679. Bibcode : 2015PLoSO..1034679F . doi : 10.1371/journal.pone.0134679 . ISSN 1932-6203 . PMC 4524629. PMID 26241652 .   
  37. ↑ Ahmed, Abdullah B.; Znassi, Nadia; Château, Marie-Thérèse; Kajava, Andrey V. (junio de 2015). "Un enfoque basado en la estructura para predecir la predisposición a la amiloidosis" . Alzheimer 's & Dementia . 11 (6): 681– 690. doi : 10.1016/j.jalz.2014.06.007 . ISSN 1552-5260 . PMID 25150734. S2CID 3130411 .   
  38. ↑ Wozniak, Pawel P.; Kotulska, Malgorzata (17 de junio de 2015). "AmyLoad: sitio web dedicado a fragmentos de proteínas amiloidogénicas" . Bioinformatics . 31 (20): 3395–3397 . doi : 10.1093/bioinformatics/btv375 . ISSN 1367-4803 . PMID 26088800 .  
  39. ^ Van Durme, Joost; De Baets, saluda; Van der Kant, Rob; Ramakers, Meine; Ganesano, Ashok; Wilkinson, Hannah; Gallardo, Rodrigo; Rousseau, Frédéric; Schymkowitz, Joost (agosto de 2016). "Solubis: un servidor web para reducir la agregación de proteínas mediante mutación" . Diseño y selección de ingeniería de proteínas . 29 (8): 285– 289. doi : 10.1093/protein/gzw019 . ISSN 1741-0126 . PMID 27284085 .  
  40. ↑ De Baets, saluda; Van Durme, Joost; van der Kant, Rob; Schymkowitz, Joost; Rousseau, Frédéric (1 de agosto de 2015). "Solubis: optimiza tus proteínas: Fig. 1" . Bioinformática . 31 (15): 2580–2582 . doi : 10.1093/bioinformatics/btv162 . ISSN 1367-4803 . PMID 25792555 .  
  41. ↑ Sormanni, Pietro; Aprile, Francesco A.; Vendruscolo, Michele (enero de 2015). "El método CamSol de diseño racional de mutantes de proteínas con solubilidad mejorada" . Journal of Molecular Biology . 427 (2): 478– 490. doi : 10.1016/j.jmb.2014.09.026 . PMID 25451785 . 
  42. ↑ Sormanni, Pietro; Amery, Leanne; Ekizoglou, Sofía; Vendruscolo, Michele; Popovic, Bojana (diciembre de 2017). "Detección rápida y precisa de la solubilidad in silico de una biblioteca de anticuerpos monoclonales" . Informes científicos . 7 (1): 8200. Código Bib : 2017NatSR...7.8200S . doi : 10.1038/s41598-017-07800-w . ISSN 2045-2322 . PMC 5558012 . PMID 28811609 .   
  43. ↑ Sormanni, Pietro; Aprile, Francesco A.; Vendruscolo, Michele (enero de 2015). "El método CamSol de diseño racional de mutantes de proteínas con solubilidad mejorada" . Journal of Molecular Biology . 427 (2): 478– 490. doi : 10.1016/j.jmb.2014.09.026 . PMID 25451785 . 
  44. ↑ Sormanni, Pietro; Amery, Leanne; Ekizoglou, Sofía; Vendruscolo, Michele; Popovic, Bojana (diciembre de 2017). "Detección rápida y precisa de la solubilidad in silico de una biblioteca de anticuerpos monoclonales" . Informes científicos . 7 (1): 8200. Código Bib : 2017NatSR...7.8200S . doi : 10.1038/s41598-017-07800-w . ISSN 2045-2322 . PMC 5558012 . PMID 28811609 .   
  45. ↑ Burdukiewicz, Michał; Sobczyk, Piotr; Rodiger, Stefan; Duda-Madej, Anna; Mackiewicz, Pawel; Kotulska, Małgorzata (11 de octubre de 2017). "Motivos amiloidogénicos revelados por análisis de n-gramas" . Informes científicos . 7 (1): 12961. Bibcode : 2017NatSR...712961B . doi : 10.1038/s41598-017-13210-9 . ISSN 2045-2322 . PMC 5636826 . PMID 29021608 .   
  46. ↑ Bondarev, Stanislav A; Bondareva, Olga V; Zhouravleva, Galina A; Kajava, Andrey V (2017-10-04). "BetaSerpentine: una herramienta bioinformática para la reconstrucción de estructuras amiloides" . Bioinformatics . 34 (4): 599– 608. doi : 10.1093/bioinformatics/btx629 . ISSN 1367-4803 . PMID 29444233 .  
  47. ↑ Sankar, Kannan; Krystek, Stanley R.; Carl, Stephen M.; Day, Tyler; Maier, Johannes KX (noviembre de 2018). "AggScore: Predicción de regiones propensas a la agregación en proteínas basada en la distribución de parches de superficie" . Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics . 86 (11): 1147– 1156. doi : 10.1002 / prot.25594 . PMID 30168197. S2CID 52131048 .  
  48. ↑ Rawat, Puneet; Prabakaran, R; Kumar, Sandeep; Gromiha, M Michael (10 de octubre de 2019). "AggreRATE-Pred: un modelo matemático para la predicción del cambio en la tasa de agregación tras una mutación puntual". Bioinformatics . 36 (5): 1439– 1444. doi : 10.1093/bioinformatics/btz764 . ISSN 1367-4803 . PMID 31599925 .  
  49. ↑ Kuriata, Aleksander; Iglesias, Valentin; Pujols, Jordi; Kurcinski, Mateusz; Kmiecik, Sebastian; Ventura, Salvador (2019-05-03). "Aggrescan3D (A3D) 2.0: predicción e ingeniería de la solubilidad de proteínas" . Nucleic Acids Research . 47 (W1): W300– W307. doi : 10.1093 / nar/gkz321 . ISSN 0305-1048 . PMC 6602499. PMID 31049593 .   
  50. ↑ Kuriata, Aleksander; Iglesias, Valentin; Kurcinski, Mateusz; Ventura, Salvador; Kmiecik, Sebastian (2019-03-02). "Paquete independiente Aggrescan3D para la predicción basada en la estructura de las propiedades de agregación de proteínas". Bioinformatics . 35 (19): 3834– 3835. doi : 10.1093/bioinformatics/btz143 . ISSN 1367-4803 . PMID 30825368 .  
  51. ↑ Zambrano, Rafael; Jamroz, Michal; Szczasiuk, Agata; Pujols, Jordi; Kmiecik, Sebastian; Ventura, Salvador (2015-04-16). "AGGRESCAN3D (A3D): servidor para la predicción de propiedades de agregación de estructuras proteicas" . Nucleic Acids Research . 43 (W1): W306– W313. doi : 10.1093/nar/gkv359 . ISSN 0305-1048 . PMC 4489226. PMID 25883144 .   
  52. ↑ Gil-García, Marcos; Bañó-Polo, Manuel; Varejao, Nathalia; Jamroz, Michal; Kuriata, Aleksander; Díaz-Caballero, Marta; Lascorz, Jara; Morel, Bertrand; Navarro, Susana; Reverter, David; Kmiecik, Sebastián (4 de septiembre de 2018). "Combinación de predicciones de estabilidad y propensión a la agregación estructural para rediseñar la solubilidad de las proteínas". Farmacéutica molecular . 15 (9): 3846– 3859. doi : 10.1021/acs.molpharmaceut.8b00341 . ISSN 1543-8384 . PMID 30036481 . S2CID 206688348 .   
  53. ↑ Pujols, Jordi; Iglesias, Valentín; Santos, Jaime; Kuriata, Aleksander; Kmiecik, Sebastián; Ventura, Salvador (2021-04-14). "Actualización de A3D 2.0 para la predicción y optimización de la solubilidad de proteínas". bioRxiv 10.1101/2021.04.13.439600 . 
  54. ↑ Keresztes, László; Szogi, Evelin; Varga, Balint; Farkas, Víktor; Perczel, András; Grolmusz, Vince (abril de 2021). "El predictor de amiloide de Budapest y sus aplicaciones" . Biomoléculas . 11 (4): 500. doi : 10.3390/biom11040500 . PMC 8067080 . PMID 33810341 .  
  55. ↑ Prabakaran, R.; Rawat, Puneet; Kumar, Sandeep; Michael Gromiha, M. (mayo de 2021). "ANuPP: una herramienta versátil para predecir regiones nucleadoras de agregación en péptidos y proteínas" . Journal of Molecular Biology . 433 (11): 166707. doi : 10.1016/j.jmb.2020.11.006 . PMID 33972019. S2CID 228867153 .