Articulo de referencia

Polisoma

Varios ribosomas sintetizan un polipéptido en la misma cadena de ARNm. Un polisoma (o polirribosoma o ergosoma ) es un grupo de ribosomas unidos a una molécula de ARNm como "cue...

Varios ribosomas sintetizan un polipéptido en la misma cadena de ARNm.

Un polisoma (o polirribosoma o ergosoma ) es un grupo de ribosomas unidos a una molécula de ARNm como "cuentas" en un "hilo". [ 1 ] Consiste en un complejo de una molécula de ARNm y dos o más ribosomas que actúan para traducir las instrucciones del ARNm en polipéptidos . Originalmente denominados "ergosomas" en 1963, fueron caracterizados posteriormente por Jonathan Warner, Paul M. Knopf, [ 2 ] y Alex Rich .

Los polisomas se forman durante la fase de elongación , cuando los ribosomas y los factores de elongación sintetizan el polipéptido codificado. Múltiples ribosomas se desplazan a lo largo de la región codificante del ARNm, creando un polisoma. La capacidad de múltiples ribosomas para funcionar en una molécula de ARNm explica la abundancia limitada de ARNm en la célula. [ 3 ] La estructura del polirribosoma difiere entre los polisomas procariotas, los polisomas eucariotas y los polisomas unidos a la membrana. [ 1 ] La actividad del polisoma se puede utilizar para medir el nivel de expresión génica mediante una técnica denominada perfilado polisomal. [ 4 ]

Estructura

Las tecnologías de microscopía electrónica, como la tinción, [ 5 ] el sombreado metálico, [ 6 ] y las secciones celulares ultrafinas, fueron los métodos originales para determinar la estructura de los polisomas. El desarrollo de las técnicas de criomicroscopía electrónica ha permitido una mayor resolución de la imagen, lo que ha dado lugar a un método más preciso para determinar la estructura. Las diferentes configuraciones estructurales de los polirribosomas podrían reflejar una variedad en la traducción de los ARNm. Una investigación de la proporción de la forma de los polirribosomas dilucidó que se encontró un alto número de polisomas circulares y en zigzag después de varias rondas de traducción. Un período más largo de traducción causó la formación de polisomas helicoidales 3D densamente empaquetados. [ 1 ] Las diferentes células producen diferentes estructuras de polisomas.

Procariota

Se ha descubierto que los polisomas bacterianos forman estructuras de doble fila. En esta conformación, los ribosomas se comunican entre sí a través de subunidades más pequeñas. Estas estructuras de doble fila generalmente presentan una trayectoria sinusoidal (en zigzag) o helicoidal tridimensional. En la trayectoria sinusoidal, existen dos tipos de contacto entre las subunidades pequeñas: de arriba hacia arriba o de arriba hacia abajo. En la trayectoria helicoidal tridimensional, solo se observa el contacto de arriba hacia arriba. [ 1 ]

Los polisomas están presentes en las arqueas, pero no se sabe mucho sobre su estructura. [ 7 ]

Eucariota

Los estudios han demostrado que los polisomas eucariotas presentan configuraciones lineales. Se encontraron hélices 3D densamente empaquetadas y polisomas planares de doble fila con empaquetamiento variable, incluyendo contactos "de arriba a arriba" similares a los de los polisomas procariotas. Los polirribosomas 3D eucariotas son similares a los procariotas en que son "hélices levógiras densamente empaquetadas con cuatro ribosomas por vuelta". Este empaquetamiento denso puede determinar su función como reguladores de la traducción, y se han encontrado polirribosomas 3D en células de sarcoma mediante microscopía de fluorescencia. [ 1 ]

In vitro

La microscopía de fuerza atómica utilizada en estudios in vitro ha demostrado que los polisomas eucariotas circulares pueden formarse a partir de ARNm poliadenilado libre en presencia del factor de iniciación eIF4E unido a la caperuza 5' y PABP unido a la cola poli(A) 3'. Sin embargo, esta interacción entre la caperuza y la cola poli(A), mediada por un complejo proteico, no es la única forma de circularizar el ARNm polisomal. Se ha descubierto que los polirribosomas topológicamente circulares pueden formarse con éxito en el sistema de traducción con ARNm sin caperuza ni cola poli(A), así como con un ARNm con caperuza pero sin cola poli(A) 3'. [ 1 ]

Unidos a la membrana

Los polirribosomas unidos a las membranas están restringidos por un espacio bidimensional definido por la superficie de la membrana. La restricción de los contactos interribosómicos provoca una configuración circular que dispone los ribosomas a lo largo del ARNm, de modo que los sitios de entrada y salida forman una vía continua. Cada ribosoma gira con respecto al anterior, asemejándose a una espiral plana. [ 1 ]

Elaboración de perfiles

El perfilado polisomal es una técnica que utiliza cicloheximida para detener la traducción y un gradiente de sacarosa para separar el extracto celular resultante mediante centrifugación. [ 3 ] Los ARNm asociados a ribosomas migran más rápido que los ARNm libres y los ARNm asociados a polisomas migran más rápido que los ARNm asociados a ribosomas. La medición de la proteína total a lo largo del gradiente revela varios picos correspondientes al ARNm. El ARNm correspondiente se asocia con un número creciente de ribosomas como polisomas. La presencia de ARNm a lo largo del gradiente revela la traducción del ARNm. El perfilado polisomal se aplica de forma óptima a células y tejidos cultivados para rastrear el estado de traducción de un ARNm identificado, así como para medir la densidad de ribosomas. [ 4 ] Esta técnica se ha utilizado para comparar el estado de traducción de los ARNm en diferentes tipos de células.

Por ejemplo, el perfilado de polisomas se utilizó en un estudio para investigar el efecto del virus de la estomatitis vesicular (VSV) en células de mamíferos. [ 8 ] Los datos del perfilado de polisomas mostraron que los ARNm del huésped son desplazados por los ARNm virales por los polisomas, lo que disminuye la traducción del ARNm del huésped y aumenta la traducción del ARNm viral. [ 8 ]

Referencias

  1. 1 2 3 4 5 6 7 Afonina ZA, Shirokov VA (enero de 2018). "Organización tridimensional de los polirribosomas: un enfoque moderno". Bioquímica . Biokhimiia . 83 (Supl. 1): S48– S55. doi : 10.1134/S0006297918140055 . PMID 29544430. S2CID 3745602 .  
  2. Cambra K (Primavera de 2017). "Paul M. Knopf, PhD" . Brown Medicine . Universidad de Brown . Consultado el 24 de julio de 2017 .
  3. 1 2 King HA, Gerber AP (enero de 2016). "Perfilado del translatoma: métodos para el análisis a escala del genoma de la traducción del ARNm" . Briefings in Functional Genomics . 15 (1): 22– 31. doi : 10.1093/bfgp/elu045 . PMID 25380596 . 
  4. 1 2 Li S, Le B, Ma X, Li S, You C, Yu Y, et al. (diciembre de 2016). Qi J (ed.). "Biogénesis de siRNAs en fase en polisomas unidos a la membrana en Arabidopsis" . eLife . 5 e22750. doi : 10.7554/eLife.22750 . PMC 5207768. PMID 27938667 .   
  5. "Tinción (Microscopía)" .
  6. "Sombreado metálico" .
  7. French SL, Santangelo TJ, Beyer AL, Reeve JN (abril de 2007). "La transcripción y la traducción están acopladas en las arqueas" . Biología molecular y evolución . 24 (4): 893–5 . doi : 10.1093/molbev/msm007 . PMID 17237472 . 
  8. 1 2 Neidermyer WJ, Whelan SP (junio de 2019). "Análisis global del ARNm asociado a polisomas en células infectadas por el virus de la estomatitis vesicular" . PLOS Pathogens . 15 (6) e1007875. doi : 10.1371/journal.ppat.1007875 . PMC 6608984. PMID 31226162 .  
  • Estructura teórica y experimental del polisoma
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