Nanobdellati ( sin. " DPANN ") es un reino de arqueas propuesto por primera vez en 2013. [ 4 ] Muchos de sus miembros muestran nuevos signos de transferencia horizontal de genes desde otros dominios de la vida . [ 4 ] Se les conoce como nanoarqueas o arqueas ultrapequeñas debido a su tamaño menor (nanométrico) en comparación con otras arqueas.
"DPANN" es un acrónimo formado por las iniciales de los primeros cinco grupos descubiertos: Diapherotrites , Parvarchaeota , Aenigmarchaeota , Nanoarchaeota y Nanohaloarchaeota . Posteriormente, Woesearchaeota y Pacearchaeota fueron descubiertos y propuestos dentro del superfilo "DPANN" . [ 5 ] En 2017, otro filo, Altiarchaeota, fue colocado en el superfilo "DPANN". [ 6 ] La monofilia de Nanobdellati aún no se considera establecida, debido a la alta tasa de mutación de los filos incluidos, lo que puede conducir al artefacto de la atracción de ramas largas (LBA) donde los linajes se agrupan basalmente o artificialmente en la base del árbol filogenético sin estar relacionados. [ 7 ] [ 8 ] Estos análisis sugieren en cambio que Nanobdellati pertenece a Euryarchaeota o es polifilético ocupando varias posiciones dentro de Euryarchaeota. [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
El grupo Nanobdellati reúne distintos filos con una variada distribución ambiental y metabolismo, que abarca desde formas simbióticas y termófilas como Nanoarchaeota , acidófilas como Parvarchaeota y no extremófilas como Aenigmarchaeota y Diapherotrites . Nanobdellati también se detectó en aguas subterráneas ricas en nitratos , en la superficie del agua pero no en las profundidades, lo que indica que estos taxones aún son bastante difíciles de localizar. [ 10 ]
Desde el reconocimiento del rango de reino por el ICNP , el único nombre válidamente publicado para este grupo es reino Nanobdellati . [ 11 ]
Características
Se caracterizan por su pequeño tamaño en comparación con otras arqueas (tamaño nanométrico) y, en consonancia con su pequeño genoma , poseen capacidades catabólicas limitadas pero suficientes para llevar una vida libre, aunque se cree que muchas son episimbiontes que dependen de una asociación simbiótica o parasitaria con otros organismos. Muchas de sus características son similares o análogas a las de las bacterias ultrapequeñas (grupo CPR). [ 5 ]
Las capacidades metabólicas limitadas son producto del genoma pequeño y se reflejan en el hecho de que muchas carecen de vías biosintéticas centrales para nucleótidos , aminoácidos y lípidos ; por lo tanto, la mayoría de las arqueas Nanobdellati, como las arqueas ARMAN , dependen de otros microbios para satisfacer sus necesidades biológicas. Pero aquellas que tienen el potencial de vivir libremente son heterótrofas fermentativas y aerobias . [ 5 ]
Son mayoritariamente anaeróbicos y no se han cultivado. Viven en ambientes extremos como termófilos, hiperacidófilos, hiperhalófilos o resistentes a metales; o también en el ambiente templado de sedimentos marinos y lacustres . Rara vez se encuentran en el suelo o en mar abierto. [ 5 ]
Clasificación
- Diaferotritos . Encontrados mediante análisis filogenético de los genomas recuperados de la filtración de agua subterránea de una mina de oro abandonada en los EE . UU. [ 12 ] [ 13 ]
- Parvarchaeota y Micrarchaeota . Descubiertas en 2006 en el drenaje ácido de una mina de EE. UU. [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] Son de tamaño muy pequeño y provisionalmente llamadas ARMAN (nanoorganismos acidófilos arqueales de la mina Richmond).
- Woesearchaeota y Pacearchaeota . Se han identificado tanto en sedimentos como en aguas superficiales de acuíferos y lagos , abundando especialmente en condiciones salinas. [ 5 ] [ 17 ]
- Aenigmarchaeota . Se encuentra en aguas residuales de minas y en sedimentos de fuentes termales. [ 18 ]
- Nanohalarchaeota . Distribuidos en ambientes con alta salinidad. [ 19 ]
- Nanoarqueota . Fueron descubiertas por primera vez (en 2002) en una fuente hidrotermal cerca de la costa de Islandia . Viven como simbiontes de otras arqueas. [ 20 ] [ 21 ]
Filogenia
Taxonomía
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) [ 25 ] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [ 26 ]
Reino Nanobdellati Rinke et al. 2013
- Filo Microcaldota Sakai et al. 2023
- Clase Microcaldia Sakai et al. 2023
- Orden ?Microcaldales Sakai et al. 2023
- Clase Microcaldia Sakai et al. 2023
- Filo " Undinarchaeota " Dombrowski et al. 2020
- Clase "Undinarchaeia" Dombrowski et al. 2020
- Orden "Undinarchaeales" Dombrowski et al. 2020
- Clase "Undinarchaeia" Dombrowski et al. 2020
- Filo " Huberarchaeota " Probst et al. 2019
- Clase "Huberarchaeia" corrig. Probst et al. 2019
- Orden "Huberarchaeales" Rinke et al. 2020
- Clase "Huberarchaeia" corrig. Probst et al. 2019
- Filo " Aenigmatarchaeota " corrig. Rinke et al. 2013 (DSEG, DUSEL2)
- Clase "Aenigmatarchaeia" corrig. Rinke et al. 2020
- Orden "Aenigmatarchaeales" corrig. Rinke et al. 2020
- Clase "Aenigmatarchaeia" corrig. Rinke et al. 2020
- Filo " Nanohalarchaeota " corrig. Rinke et al. 2013
- Clase "Nanohalobiia" corrig.La Cono et al. 2020
- Orden "Nanohalobiales" La Cono et al. 2020
- Clase " Nanohalarchaeia " corrig. Narasingarao et al. 2012
- Orden "Nanohalarchaeales"
- Orden "Nanohidrotermales" Xie et al. 2022
- Orden "Nucleotidisoterales" Xie et al. 2022
- Clase "Nanohalobiia" corrig.La Cono et al. 2020
- Filo Altarchaeota Probst et al. 2018 (SM1)
- Clase "Altarchaeia" corrig. Probst y cols. 2014
- Orden "Altarchaeales" corrig. Probst y cols. 2014
- Clase "Altarchaeia" corrig. Probst y cols. 2014
- Corrección del filo "Iainarchaeota" . Rinke et al. 2013 [“ Diaferotritos ” Rinke et al. 2013 ] (DUSEL-3)
- Clase "Iainarchaeia" Rinke et al. 2020
- Pedido "Forterreales" Probst & Banfield 2017
- Orden "Iainarchaeales" Rinke et al. 2020
- Clase "Iainarchaeia" Rinke et al. 2020
- Filo " Micrachaeota " Baker & Dick 2013
- Clase "Micrarchaeia" Vázquez-Campos et al. 2021
- Orden "Anstonellales" Vázquez-Campos et al. 2021 (LFWA-IIIc)
- Orden "Burarchaeales" Vázquez-Campos et al. 2021 (LFWA-IIIb)
- Orden "Fermentimicrarchaeales" Kadnikov et al. 2020
- Orden "Gugararchaeales" Vázquez-Campos et al. 2021 (LFWA-IIIa)
- Orden "Micrarchaeales" Vázquez-Campos et al. 2021
- Orden "Norongarragalinales" Vázquez-Campos et al. 2021 (LFWA-II)
- Clase "Micrarchaeia" Vázquez-Campos et al. 2021
- Filo Nanobdellota Huber et al. 2023
- Clase Nanobdellia Kato et al. 2022
- Orden JAPDLS01
- Orden " Jingweiarchaeales " Rao et al. 2023 [DTBS01]
- Orden Nanobdellales Kato et al. 2022
- Orden " Pacearchaeales " (DHVE-5, DUSEL-1)
- Orden " Parvarchaeales " Rinke et al. 2020 (ARMAN 4 y 5)
- Orden " Tiddalikarchaeales " Vazquez-Campos et al. 2021 (LFW-252_1)
- Orden " Woesearchaeales " (DHVE-6)
- Clase Nanobdellia Kato et al. 2022
- Filo ?" Mamarchaeota "
- Orden ?" Wiannamattarchaeales "
Véase también
Referencias
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- Extremófilos
- reinos de arqueas