Articulo de referencia

PER3

El gen PER3 codifica la proteína homóloga 3 del ciclo circadiano Period en humanos. [ 5 ] PER3 es un parálogo de los genes PER1 y PER2 . Es un gen circadiano asociado con el sín...

El gen PER3 codifica la proteína homóloga 3 del ciclo circadiano Period en humanos. [ 5 ] PER3 es un parálogo de los genes PER1 y PER2 . Es un gen circadiano asociado con el síndrome de fase de sueño retrasada en humanos. [ 6 ]

Historia

El gen Per3 fue clonado independientemente por dos grupos de investigación ( Facultad de Medicina de la Universidad de Kobe y Facultad de Medicina de Harvard ), quienes publicaron su descubrimiento en junio de 1998. [ 7 ] [ 8 ] El Per3 de mamíferos fue descubierto mediante la búsqueda de secuencias de ADNc homólogas a Per2. La secuencia de aminoácidos de la proteína PERIOD3 del ratón (mPER3) es entre un 37 y un 56 % similar a las otras dos proteínas PER. [ 8 ] [ 7 ]

Función

Este gen es miembro de la familia de genes Period. Se expresa en un patrón circadiano en el núcleo supraquiasmático (NSQ), el marcapasos circadiano primario en el cerebro de los mamíferos. Los genes de esta familia codifican componentes de los ritmos circadianos de la actividad locomotora , el metabolismo y el comportamiento. La expresión circadiana en el NSQ continúa en oscuridad constante, y un cambio en el ciclo luz/oscuridad provoca un cambio proporcional de la expresión génica en el NSQ. [ 9 ] PER1 y PER2 son necesarios para la regulación del tiempo molecular y la respuesta a la luz en el reloj circadiano maestro en el NSQ, pero se muestran pocos datos sobre la función concreta de PER3. Se encontró que PER3 es importante para la regulación del tiempo endógeno en tejidos específicos y esos cambios específicos de tejido en los períodos endógenos dan como resultado una desalineación interna de los relojes circadianos en ratones doble knockout (-/-) de Per3. [ 10 ] PER3 puede tener un efecto estabilizador sobre PER1 y PER2, y este efecto estabilizador puede verse reducido en el polimorfismo PER3-P415A/H417R. [ 11 ]

Función en la cronobiología

Los niveles de ARNm de mPer3 oscilan con un ritmo circadiano tanto en el SCN como en los ojos, así como en tejidos periféricos, incluyendo el hígado , el músculo esquelético y los testículos . [ 8 ] A diferencia de Per1 y Per2, cuyo ARNm se induce en respuesta a la luz, el ARNm de Per3 en el SCN no responde a la luz. Esto sugiere que Per3 podría estar regulado de manera diferente a Per1 o Per2. [ 8 ]

La proteína mPER3 contiene un dominio PAS , similar a mPER1 y mPER2. Es probable que mPER3 se una a otras proteínas mediante este dominio. [ 8 ] Sin embargo, si bien se ha demostrado que PER1/2 son importantes en el bucle de retroalimentación transcripción-traducción involucrado en el reloj circadiano intracelular , la influencia de PER3 en este bucle aún no se ha dilucidado por completo, dado que mPER3 no parece ser funcionalmente redundante con mPER1 y mPER2. [ 12 ] Es posible que mPer3 no sea un miembro del bucle central del reloj . [ 12 ]

Estudios con animales

Aunque el gen Per3 es un parálogo de los genes PER1 y PER2, los estudios en animales generalmente muestran que no contribuye significativamente a los ritmos circadianos. Los animales Per3-/- funcionales experimentan solo pequeños cambios en el período de libre oscilación , [ 12 ] y no responden de manera significativamente diferente a los pulsos de luz. [ 13 ] Los animales Per1-/- y Per2-/- experimentan un cambio significativo en el período de libre oscilación; sin embargo, la eliminación de Per3 además de Per1 o Per2 tiene poco efecto en los ritmos de libre oscilación. [ 12 ] Además, los ratones Per1-/-Per2-/- son completamente arrítmicos, lo que indica que estos dos genes tienen mucha más importancia para el reloj biológico que Per3. [ 12 ]

Los ratones knockout de Per3 experimentan un período de actividad locomotora ligeramente más corto (en 0,5 h [ 13 ] ) y son menos sensibles a la luz, ya que se sincronizan más lentamente con los cambios en el ciclo luz-oscuridad. PER3 podría estar implicado en la supresión de la actividad conductual en respuesta a la luz, aunque la expresión de mPer3 no es necesaria para los ritmos circadianos. [ 14 ] [ 15 ]

Importancia clínica

El polimorfismo de "longitud" PER3 en la secuencia repetida de 54 pb en el exón 18 (número de acceso de GenBank AB047686) es un polimorfismo estructural debido a una inserción o deleción de 18 aminoácidos en una región que codifica un dominio de fosforilación putativo. El polimorfismo se ha asociado con la preferencia diurna y el síndrome de fase de sueño retrasada . Un polimorfismo de alelo más largo se asocia con la "matutinidad" y el alelo corto con la "vespertinidad". El alelo corto también se asocia con el síndrome de fase de sueño retrasada. [ 6 ] También se ha demostrado que el polimorfismo de longitud inhibe la adipogénesis y se ha demostrado que los ratones knockout de Per3 tienen un aumento del tejido adiposo y una disminución del tejido muscular en comparación con el tipo silvestre. Además, también se ha demostrado que la presencia del polimorfismo de longitud está asociada con pacientes con diabetes mellitus tipo 2 (DM2) en comparación con pacientes de control no diabéticos. [ 16 ] El polimorfismo PER3-P415A/H417R se ha relacionado con el síndrome de fase de sueño avanzada familiar en humanos, así como con el trastorno afectivo estacional , aunque cuando se introduce en ratones, el polimorfismo causa una fase de sueño retrasada. [ 11 ]

Gene

Ortólogos

La siguiente es una lista de algunos ortólogos del gen PER3 en otras especies: [ 17 ]

  • PER3 ( P. troglodytes )
  • PER3 ( M. mulatta )
  • PER3 ( C. lupus )
  • PER3 ( H. sapiens )
  • PER3 ( B. taurus )
  • Per3 ( M. musculus )
  • Per3 ( R. norvegicus )
  • PER3 ( G. gallus )
  • per3 ( X. tropicalis )
  • per3 ( D. rerio )

Parálogos

  • PER1
  • PER2

Ubicación del gen

El gen PER3 humano se encuentra en el cromosoma 1 en la siguiente ubicación: [ 18 ]

  • Inicio: 7.784.320 pb
  • Final: 7.845.181 pb
  • Longitud: 60.862 bases
  • Exones: 25

PER3 tiene 19 transcripciones (variantes de empalme).

Estructura de las proteínas

Se ha identificado que la proteína PER3 tiene las siguientes características: [ 19 ]

  • Tamaño: 1201 aminoácidos
  • Masa molecular: 131888 Da
  • Estructura cuaternaria: homodímero

Modificaciones postraduccionales

Las siguientes son algunas modificaciones postranscripcionales conocidas del gen Per3: [ 19 ]

  • La fosforilación por CSNK1E es débil y parece requerir la asociación con PER1 y la translocación al núcleo.
  • Ubiquitinado.
  • Sitios de modificación en PhosphoSitePlus
  • Sitios de modificación en neXtProt

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000049246 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000028957 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. Shearman LP, Zylka MJ, Weaver DR, Kolakowski LF, Reppert SM (diciembre de 1997). "Dos homólogos del período: expresión circadiana y regulación fótica en los núcleos supraquiasmáticos" . Neuron . 19 (6): 1261–9 . doi : 10.1016 / S0896-6273(00)80417-1 . PMID 9427249. S2CID 10059149 .  
  6. 1 2 Archer SN, Robilliard DL, Skene DJ , Smits M, Williams A, Arendt J, von Schantz M (junio de 2003). "Un polimorfismo de longitud en el gen del reloj circadiano Per3 está vinculado al síndrome de fase de sueño retrasada y a una preferencia diurna extrema" . Sleep . 26 (4): 413– 5. doi : 10.1093/sleep/26.4.413 . PMID 12841365 . 
  7. ^ Takumi T, Taguchi K, Miyake S, Sakakida Y, Takashima N, Matsubara C, Maebayashi Y, Okumura K, Takekida S, Yamamoto S, Yagita K, Yan L, Young MW, Okamura H (agosto de 1998). "Un gen oscilatorio independiente de la luz mPer3 en SCN y OVLT de ratón" . La Revista EMBO . 17 (16): 4753– 9. doi : 10.1093/emboj/17.16.4753 . PMC 1170804 . PMID 9707434 .  
  8. 1 2 3 4 5 Zylka MJ, Shearman LP, Weaver DR, Reppert SM (junio de 1998). "Tres homólogos del período en mamíferos: respuestas de luz diferenciales en el reloj circadiano supraquiasmático y transcripciones oscilantes fuera del cerebro" . Neuron . 20 ( 6): 1103–10 . doi : 10.1016/S0896-6273(00)80492-4 . PMID 9655499. S2CID 14797914 .  
  9. "Gen Entrez: homólogo 3 del período PER3 (humano)" .
  10. Pendergast JS, Niswender KD, Yamazaki S (2012). "Función específica de tejido de Period3 en la ritmicidad circadiana" . PLOS ONE . 7 (1) e30254. Bibcode : 2012PLoSO...730254P . doi : 10.1371/ journal.pone.0030254 . PMC 3256228. PMID 22253927 .  
  11. 1 2 Zhang L, Hirano A, Hsu PK, Jones CR, Sakai N, Okuro M, McMahon T, Yamazaki M, Xu Y, Saigoh N, Saigoh K, Lin ST, Kaasik K, Nishino S, Ptáček LJ, Fu YH (marzo de 2016). "Una variante de PERIOD3 causa un fenotipo circadiano y está asociada con un rasgo de estado de ánimo estacional" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 113 (11): E1536–44. Bibcode : 2016PNAS..113E1536Z . doi : 10.1073/pnas.1600039113 . PMC 4801303. PMID 26903630 .  
  12. 1 2 3 4 5 Bae K, Jin X, Maywood ES, Hastings MH, Reppert SM, Weaver DR (mayo de 2001). " Funciones diferenciales de mPer1, mPer2 y mPer3 en el reloj circadiano del SCN" . Neuron . 30 (2): 525–36 . doi : 10.1016/S0896-6273(01)00302-6 . PMID 11395012. S2CID 219582 .  
  13. 1 2 Shearman LP, Jin X, Lee C, Reppert SM, Weaver DR (septiembre de 2000). "Interrupción dirigida del gen mPer3: efectos sutiles en la función del reloj circadiano" . Biología Molecular y Celular . 20 (17): 6269– 75. doi : 10.1128/MCB.20.17.6269-6275.2000 . PMC 86101. PMID 10938103 .  
  14. van der Veen DR, Archer SN (febrero de 2010). "Fenotipos conductuales dependientes de la luz en ratones deficientes en PER3" ( PDF) . Journal of Biological Rhythms . 25 (1): 3–8 . doi : 10.1177/0748730409356680 . PMID 20075295. S2CID 770136 .  
  15. Pereira DS, van der Veen DR, Gonçalves BS, Tufik S, von Schantz M, Archer SN, Pedrazzoli M (2014). " El efecto de diferentes fotoperíodos en los ritmos circadianos de ratones knockout per3" . BioMed Research International . 2014 170795. doi : 10.1155/2014/170795 . PMC 4042019. PMID 24982860 .  
  16. Karthikeyan R, Marimuthu G, Sooriyakumar M, BaHammam AS, Spence DW, Pandi-Perumal SR, Brown GM, Cardinali DP (junio de 2014). "Polimorfismo de longitud de Per3 en pacientes con diabetes mellitus tipo 2". Hormone Molecular Biology and Clinical Investigation . 18 (3): 145– 9. doi : 10.1515 / hmbci-2013-0049 . hdl : 11336/15739 . PMID 25390010. S2CID 36626446 .  
  17. "PER3" . Homologene . NCBI. 2017. Archivado del original el 20 de abril de 2017. Consultado el 12 de abril de 2017 .
  18. "PER3" . Entrez Gene . NCBI. 2017. Consultado el 12 de abril de 2017 .
  19. 1 2 "Gen Per3" . GeneCards . Instituto Weizmann de Ciencias . Consultado el 12 de abril de 2017 .

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .

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