Hispanopedia WikiOriDB es una base de datos biológica de sitios de origen de replicación de ADN confirmados y predichos en los organismos modelo Saccharomyces cerevisiae y Schizosaccharomyces pombe . [ 1 ] [ 2 ]
La base de datos de orígenes de replicación del ADN (OriDB) proporciona acceso a conjuntos de datos publicados y recopilados que han predicho y/o confirmado la ubicación de los orígenes de replicación. Cada posible sitio de origen de replicación se clasifica como confirmado, probable o dudoso, según el nivel de datos que lo respaldan. Para cada sitio, se dispone de información adicional, que incluye:
- la ubicación genómica del sitio de origen;
- la secuencia de ADN ;
- una representación gráfica del sitio de origen que incluye datos experimentales;
- los estudios publicados que propusieron el origen;
- Enlaces a los estudios originales pertinentes.
Además, existe un visor gráfico que permite a los usuarios seleccionar regiones cromosómicas y visualizar los conjuntos de datos seleccionados. Todos los conjuntos de datos originales presentados en OriDB están disponibles para su descarga.
Véase también
Referencias
- 1 2 Siow, CC; Nieduszynska, SR; Müller, CA; Nieduszynski, CA (enero de 2012). "OriDB, la base de datos de origen de replicación del ADN actualizada y ampliada" . Nucleic Acids Research . 40 (número especial de bases de datos): D682-6. doi : 10.1093 / nar/gkr1091 . PMC 3245157. PMID 22121216 .
- ↑ Nieduszynski, CA; Hiraga, S; Ak, P; Benham, CJ; Donaldson, AD (enero de 2007). " OriDB: una base de datos de orígenes de replicación de ADN" . Nucleic Acids Research . 35 (número especial de bases de datos): D40-6. doi : 10.1093/nar/gkl758 . PMC 1781122. PMID 17065467 .
Enlaces externos
- https://cerevisiae.oridb.org
- https://pombe.oridb.org
- Bases de datos biológicas
- replicación del ADN
- Esbozos de bases de datos biológicas