Árbol de la Vida abierto

El Open Tree of Life es un árbol filogenético de la vida en línea , un esfuerzo colaborativo financiado por la National Science Foundation . ^[²^]^[³^] El primer borrador, que incluye 2,3 millones de especies, se publicó en septiembre de 2015. ^[⁴^] El gráfico interactivo permite al usuario acercarse a las clasificaciones taxonómicas, los árboles filogenéticos y la información sobre un nodo. Al hacer clic en una especie, se mostrará su taxonomía de origen y de referencia.

El árbol de la vida en el nodo Eukaryota

Acercarse

El proyecto utiliza un enfoque de superárbol para generar un único árbol filogenético (disponible en tree.opentreeoflife.org ^{[ 5 ]} ) a partir de una taxonomía completa y un conjunto curado de estimaciones filogenéticas publicadas.

La taxonomía es una combinación de varias clasificaciones extensas producidas por otros proyectos; se crea utilizando una herramienta de software llamada "smasher". ^{[ 6 ]} La taxonomía resultante se denomina Taxonomía de Árbol Abierto (OTT) y se puede consultar en línea. ^{[ 7 ]}

Historia

El proyecto se inició en junio de 2012 con una subvención de tres años de la NSF otorgada a investigadores de diez universidades. En 2015, se concedió una subvención complementaria de dos años a investigadores de tres instituciones.

Véase también

Proyecto web Árbol de la Vida

Referencias

^ "Licencia OpenTreeOfLife" .
^ Hinchliff CE, Smith SA, Allman JF, Burleigh JG, Chaudhary R, Coghill LM, et al. (octubre de 2015). "Síntesis de filogenia y taxonomía en un árbol de la vida integral" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 112 (41): 12764– 9. Bibcode : 2015PNAS..11212764H . doi : 10.1073 / pnas.1423041112 . PMC 4611642. PMID 26385966 .
^ "Ensamblaje, visualización y análisis del árbol de la vida" . Fundación Nacional de Ciencias (NSF). 11 de marzo de 2011. Consultado el 11 de febrero de 2016 .
^ Pennisi E (21 de septiembre de 2015). "El primer árbol de la vida integral muestra cuán relacionado estás con millones de especies" . Revista Science .
^ "opentree" . Desarrolladores del Árbol Abierto de la Vida.
^ Rees JA, Cranston K (2017). "Ensamblaje automatizado de una taxonomía de referencia para la síntesis de datos filogenéticos" . Biodiversity Data Journal . 5 (5) e12581. doi : 10.3897/BDJ.5.e12581 . PMC 5515096. PMID 28765728 .
^ "tree.opentreeoflife.org" .

[1] "Licencia OpenTreeOfLife" .

[2] Hinchliff CE, Smith SA, Allman JF, Burleigh JG, Chaudhary R, Coghill LM, et al. (octubre de 2015). "Síntesis de filogenia y taxonomía en un árbol de la vida integral" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 112 (41): 12764– 9. Bibcode : 2015PNAS..11212764H . doi : 10.1073 / pnas.1423041112 . PMC 4611642. PMID 26385966 .

[3] "Ensamblaje, visualización y análisis del árbol de la vida" . Fundación Nacional de Ciencias (NSF). 11 de marzo de 2011. Consultado el 11 de febrero de 2016 .

[4] Pennisi E (21 de septiembre de 2015). "El primer árbol de la vida integral muestra cuán relacionado estás con millones de especies" . Revista Science .

[5] "opentree" . Desarrolladores del Árbol Abierto de la Vida.

[6] Rees JA, Cranston K (2017). "Ensamblaje automatizado de una taxonomía de referencia para la síntesis de datos filogenéticos" . Biodiversity Data Journal . 5 (5) e12581. doi : 10.3897/BDJ.5.e12581 . PMC 5515096. PMID 28765728 .

[7] "tree.opentreeoflife.org" .

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