En biología , la matriz nuclear es la red de fibras que se encuentra en el interior del núcleo celular tras un método específico de extracción química. Según algunos, es análoga al citoesqueleto celular . Sin embargo, a diferencia del citoesqueleto, se ha propuesto que la matriz nuclear es una estructura dinámica. Junto con la lámina nuclear , se cree que contribuye a organizar la información genética dentro de la célula. [ 1 ]
La función exacta de esta estructura aún se debate, e incluso su existencia se ha puesto en duda. [ 2 ] La evidencia de dicha estructura se reconoció ya en 1948, [ 3 ] y, en consecuencia, se han descubierto muchas proteínas asociadas a la matriz. La presencia de proteínas intracelulares es un hecho indiscutible, y se acepta que proteínas como el andamiaje o las proteínas asociadas a la matriz (SAR o MAR) desempeñan algún papel en la organización de la cromatina en la célula viva. Existe evidencia de que la matriz nuclear participa en la regulación de la expresión génica en Arabidopsis thaliana . [ 4 ]
La existencia de estructuras similares en células vivas sigue siendo objeto de debate. [ 5 ] Según algunas fuentes, la mayoría, si no todas, las proteínas presentes en la matriz nuclear son agregados de proteínas de estructuras que se encuentran en el núcleo de las células vivas. Dichas estructuras son láminas nucleares, que consisten en proteínas denominadas laminas, las cuales también se encuentran en la matriz nuclear. [ 6 ]
Validez de la matriz nuclear
Durante mucho tiempo, la cuestión de si una red polimérica, una "matriz nuclear", un "andamio nuclear" o "NuMat" es un componente esencial de la arquitectura nuclear in vivo ha sido objeto de debate. Si bien existen argumentos que sugieren que la posición relativa de los territorios cromosómicos (TC), el equivalente a los cromosomas metafásicos condensados en interfase , puede mantenerse debido a la interferencia estérica o a las fuerzas de repulsión electrostática entre las superficies de los TC, aparentemente altamente estructuradas, este concepto debe conciliarse con las observaciones según las cuales las células tratadas con los procedimientos clásicos de extracción de la matriz mantienen territorios definidos hasta el punto en que se libera un subconjunto menor de proteínas ácidas de la matriz nuclear, muy probablemente aquellas proteínas que regulaban su asociación con el esqueleto nuclear. [ 7 ] El proteoma de la matriz nuclear consta de proteínas estructurales, chaperonas, proteínas de unión a ADN/ARN, factores de remodelación de la cromatina y factores de transcripción. La complejidad de NuMat es un indicador de la diversa importancia estructural y funcional de sus proteínas. [ 8 ]
Regiones de fijación del andamio/matriz (S/MAR)
Las regiones S/MAR (regiones de unión a la matriz/andamio), regiones de ADN que se sabe que unen el ADN genómico a diversas proteínas nucleares, muestran un espectro cada vez mayor de actividades biológicas ya establecidas. Existe una superposición conocida entre este amplio grupo de secuencias y las secuencias denominadas LAD (dominios de unión a la lámina nuclear).
Los S/MAR se utilizan cada vez más para el diseño racional de vectores , con un uso generalizado en terapia génica y biotecnología . Actualmente, las funciones de los S/MAR pueden modularse, mejorarse y adaptarse a las necesidades específicas de los nuevos sistemas de vectores. [ 9 ]
Matriz nuclear y cáncer
Se ha demostrado que la composición de la matriz nuclear en las células humanas es específica del tipo celular y del tumor. Se ha comprobado claramente que la composición de la matriz nuclear en un tumor difiere de la de sus contrapartes normales. [ 10 ] Este hecho podría ser útil para caracterizar marcadores de cáncer y predecir la enfermedad incluso antes. Estos marcadores se han encontrado en la orina y la sangre y podrían utilizarse potencialmente en la detección temprana y el pronóstico de los cánceres humanos.
Véase también
- Minicírculo : pequeñas unidades circulares de ADN que se replican.
Referencias
- ↑ Berezney, Ronald; Coffey, Donald S. (octubre de 1974). "Identificación de una matriz de proteína nuclear" . Biochemical and Biophysical Research Communications . 60 (4): 1410– 1417. doi : 10.1016/0006-291X(74)90355-6 . PMID 4214419 .
- ↑ Pederson T (marzo de 2000). "Medio siglo de "la matriz nuclear"" . Biología molecular de la célula . 11 (3): 799– 805. doi : 10.1091/mbc.11.3.799 . PMC 14811 . PMID 10712500 .
- ↑ ZBARSKII, IB; DEBOV, SS (1948). "Sobre las proteínas del núcleo celular". Dokl Akad Nauk SSSR . 63 : 795– 798.
- ↑ Tetko IV, Haberer G, Rudd S, Meyers B, Mewes HW, Mayer KF (marzo de 2006). "El control de la expresión espaciotemporal se correlaciona con las regiones de unión a la matriz del andamio intragénico (S/MAR) en Arabidopsis thaliana" . PLOS Computational Biology . 2 (3) e21. Bibcode : 2006PLSCB...2...21T . doi : 10.1371/journal.pcbi.0020021 . PMC 1420657. PMID 16604187 .
- ↑ Hancock, Ronald (2000-07-05). " Una nueva mirada a la matriz nuclear" . Chromosoma . 109 (4): 219– 225. doi : 10.1007/s004120000077 . ISSN 0009-5915 . PMID 10968250. S2CID 8471350 .
- ↑ Razin, SV; Borunova, VV; Iarovaia, OV; Vassetzky, YS (julio de 2014). "Matriz nuclear y compartimentación estructural y funcional del núcleo celular eucariota" . Bioquímica (Moscú) . 79 (7): 608– 618. doi : 10.1134/S0006297914070037 . ISSN 0006-2979 . PMID 25108324. S2CID 1678398 .
- ↑ Hancock, Ronald (2000-07-05). " Una nueva mirada a la matriz nuclear" . Chromosoma . 109 (4): 219– 225. doi : 10.1007/s004120000077 . ISSN 0009-5915 . PMID 10968250. S2CID 8471350 .
- ↑ Kallappagoudar S, Varma P, Pathak RU, Senthilkumar R, Mishra RK (septiembre de 2010). "Análisis del proteoma de la matriz nuclear de Drosophila melanogaster" . Molecular & Cellular Proteomics . 9 (9): 2005–18 . doi : 10.1074/mcp.M110.001362 . PMC 2938118. PMID 20530634 .
- ↑ Bozza M, De Roia A, Correia MP, Berger A, Tuch A, Schmidt A, et al. (abril de 2021). "Una plataforma de nanovectores de ADN no virales y no integradores para la fabricación segura, rápida y persistente de células T recombinantes" . Science Advances . 7 (16) eabf1333. Bibcode : 2021SciA....7.1333B . doi : 10.1126/sciadv.abf1333 . PMC 8046366. PMID 33853779 .
- ↑ Rynearson AL, Sussman CR (junio de 2011). "Estructura nuclear, organización y oncogénesis". Journal of Gastrointestinal Cancer . 42 (2): 112– 7. doi : 10.1007/s12029-011-9253-5 . PMID 21286858. S2CID 45830528 .
Lecturas adicionales
- Nickerson J (febrero de 2001). "Observaciones experimentales de una matriz nuclear" . Journal of Cell Science . 114 (Pt 3): 463–74 . doi : 10.1242/jcs.114.3.463 . PMID 11171316 .
- Tsutsui KM, Sano K, Tsutsui K (agosto de 2005). "Visión dinámica de la matriz nuclear" (PDF) . Acta Medica Okayama . 59 (4): 113–20 . doi : 10.18926/AMO/31953 . PMID 16155636 .
- Miller TE, Beausang LA, Winchell LF, Lidgard GP (enero de 1992). "Detección de proteínas de la matriz nuclear en suero de pacientes con cáncer" . Cancer Research . 52 (2): 422–7 . PMID 1728414 .
- Girod PA, Nguyen DQ, Calabrese D, Puttini S, Grandjean M, Martinet D, et al. (septiembre de 2007). "Predicción a nivel genómico de regiones de unión a la matriz que aumentan la expresión génica en células de mamíferos". Nature Methods . 4 (9): 747– 53. doi : 10.1038/nmeth1076 . PMID 17676049. S2CID 22315251 .
- Matrices (biología)
- subestructuras nucleares
- Genética molecular