Operón Nik

El operón nik es necesario para la captación de iones de níquel por la célula. Está presente en muchas bacterias, pero se ha estudiado exhaustivamente en Helicobacter pylori . El níquel es un nutriente esencial para muchos microorganismos, donde participa en diversos procesos celulares. Sin embargo, niveles excesivos de iones de níquel en la célula pueden ser letales. La concentración de iones de níquel en la célula está regulada por el operón nik .

El operón nik consta de seis genes. Los primeros cinco genes, nikABCDE, codifican componentes de un sistema de transporte ABC típico , y el último gen, nikR, codifica una proteína de unión al ADN que reprime la transcripción de nikABCDE cuando hay suficiente Ni²⁺ ^presente . El gen nikR se encuentra 5 pb corriente abajo del extremo de nikE y se transcribe en la misma dirección que nikABCDE . La siguiente tabla resume la estructura del operón nik :

Utilizando búsquedas en bases de datos de secuencias basadas en perfiles, se demostró que NikR es un miembro de la familia de factores de transcripción de hélice-cinta-hélice (RHH). ^{[ 4 ]} Se ha demostrado que el dominio N-terminal de NikR es responsable de la unión al ADN y que solo se une en presencia de Ni ²⁺ . NikR tiene dos sitios para la unión a iones Ni ²⁺ . La unión de Ni ²⁺ en concentraciones que permiten la ocupación completa solo de los sitios de alta afinidad es suficiente para la unión al operador, pero la afinidad por el operador aumenta 1000 veces y las huellas del operador son mayores cuando ambos sitios de unión al níquel están ocupados. ^{[ 5 ]} Estos resultados, combinados con estimaciones de las concentraciones intracelulares de Ni ²⁺ y NikR, llevan a la conclusión de que NikR es capaz de detectar Ni ²⁺ y regular la expresión del operón nik en un rango de concentraciones intracelulares de Ni ²⁺ desde tan bajas como una hasta tan altas como 10 000 moléculas por célula.

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