Hispanopedia WikiNextstrain es una colaboración entre investigadores de Seattle , Estados Unidos [1] y Basilea , Suiza [2] que proporciona una colección de herramientas de código abierto para visualizar la genética detrás de la propagación de brotes virales . [3]
Su objetivo es apoyar las medidas de salud pública y la vigilancia facilitando la comprensión de la propagación y evolución de los patógenos . La plataforma Nextstrain se inició en 2015. [2] El código desarrollado por Nextstrain se pone a disposición del público, por ejemplo a través de github.com y sus datos están disponibles y se pueden ver en forma accesible a través de las páginas del sitio web. [4]
Aplicaciones
Según su sitio web, el equipo de Nextstrain mantiene un análisis genómico actualizado de cada uno de los siguientes patógenos: [5]
- Gripe aviar
- Dengue
- Enterovirus D68
- Sarampión
- Virus de la viruela del mono
- Paperas
- SARS-CoV-2
- Gripe estacional
- Tuberculosis
- Virus del Nilo Occidental
- Ébola en África occidental 2013-16
- Zika
Pandemia de COVID-19
Nextstrain y sus resultados han sido ampliamente citados durante la pandemia de COVID-19 . [6] [7] [ ¿ fuente poco confiable? ] [8] [9]
Otorgar
En mayo de 2020, Nextstrain y Trevor Bedford (profesor asociado del Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutchinson ) [10] recibieron un premio Webby Special Achievement Award por la herramienta web. [11]
Véase también
Referencias
- ^ Richards, Sarah Elizabeth (26 de marzo de 2020). «Cómo las mutaciones del coronavirus pueden rastrear su propagación y refutar las conspiraciones». www.nationalgeographic.com . Archivado desde el original el 24 de diciembre de 2020 . Consultado el 25 de diciembre de 2020 .
- ^ ab "Propagación de una nueva variante del SARS-CoV-2 en Europa en el verano de 2020". www.unibas.ch . 29 de octubre de 2020. Archivado desde el original el 16 de diciembre de 2020 . Consultado el 25 de diciembre de 2020 .
- ^ Reza, Nosheen (6 de abril de 2020). "Nextstrain RNA, DNA, and COVID-19]". earlycareervoice.professional.heart.org . Archivado desde el original el 25 de enero de 2021 . Consultado el 25 de diciembre de 2020 .
- ^ Hadfield, James; Megill, Colin; Bell, Sidney; Huddleston, John; Potter, Barney; Callender, Charlton; et al. (22 de mayo de 2018). Kelso, Janet (ed.). "Nextstrain: seguimiento en tiempo real de la evolución de patógenos". Bioinformática . 34 (23): 4121–4123. doi :10.1093/bioinformatics/bty407. ISSN 1367-4803. PMC 6247931 . PMID 29790939.
- ^ "Seguimiento en tiempo real de la evolución de patógenos de Nextstrain Sección 'Explorar patógenos'". nextstrain.org . Archivado desde el original el 26 de diciembre de 2020 . Consultado el 26 de diciembre de 2020 .
- ^ Drake, John (19 de diciembre de 2020). "La ciencia detrás del confinamiento navideño por el coronavirus en Londres". www.forbes.com . Archivado desde el original el 22 de diciembre de 2020 . Consultado el 25 de diciembre de 2020 .
- ^ Hodcroft, Emma B .; Zuber, Moira; Nadeau, Sara; Comas, Iñaki; González Candelas, Fernando; Stadler, Tanja; Neher, Richard A. (28 de octubre de 2020). "Aparición y propagación de una variante del SARS-CoV-2 por Europa en el verano de 2020". medRxiv 10.1101/2020.10.25.20219063v1 .
- ^ "Grupo de trabajo científico nacional suizo sobre la COVID-19" . Consultado el 21 de diciembre de 2021 .
- ^ "Nextstrain, secuenciación y la pandemia del SARS-CoV-2" (PDF) . 2020. Consultado el 21 de diciembre de 2021 .
- ^ "40 Under 40 Healthcare". fortune.com . Archivado desde el original el 20 de octubre de 2020. Consultado el 29 de diciembre de 2020 .
- ^ "Logro especial de Webby". winners.webbyawards.com . Archivado desde el original el 10 de octubre de 2021 . Consultado el 29 de diciembre de 2020 .
Enlaces externos
- Sitio web oficial