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NXF1

El factor de exportación de ARN nuclear 1 , también conocido como NXF1 o TAP , es una proteína que en los humanos está codificada por el gen NXF1 . [5] [6] Función Este gen es u...

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El factor de exportación de ARN nuclear 1 , también conocido como NXF1 o TAP , es una proteína que en los humanos está codificada por el gen NXF1 . [5] [6]

Función

Este gen es un miembro de una familia de genes de factor de exportación de ARN nuclear. Las características de dominio comunes de esta familia son un dominio de unión a ARN de tipo RNP no canónico (RBD), 4 repeticiones ricas en leucina (LRR), un dominio similar al factor de transporte nuclear 2 (NTF2) que permite la heterodimerización con la proteína de exportación relacionada con NTF2-1 ( NXT1 ), y un dominio asociado a la ubiquitina que media las interacciones con las nucleoporinas . El empalme alternativo da como resultado variantes de transcripción. Los LRR y los dominios similares a NTF2 son necesarios para la actividad de exportación. La proteína codificada de este gen se desplaza entre el núcleo y el citoplasma y se une in vivo al ARN poli(A)+. Es el homólogo vertebrado de la proteína de levadura Mex67p. [6] [7] La ​​proteína codificada supera el bloqueo de la exportación de ARNm causado por la presencia de cantidades saturantes de ARN CTE (elemento de transporte constitutivo) de retrovirus tipo D. [8] Un alelo variante del gen homólogo Nxf1 en ratones suprime una clase de mutaciones causadas por la integración de un retrovirus endógeno (partícula A intracisternal) en un intrón. [9] [10]

Interacciones

Se ha demostrado que NXF1 interactúa con TNPO2 , [11] MAGOH , [12] factor auxiliar 1 de ARN nuclear pequeño U2 , [13] DHX9 , [14] HuD [15] y NUP214 . [16] [17]

Proteína del grifo

En biología molecular, la proteína NXF1 también recibe el nombre de TAP. En particular, esta entrada se centra en el dominio C-terminal , que también contiene el dominio UBA (protein domain) .

Esta entrada contiene la familia NXF de receptores de transporte para la exportación nuclear de ARNm, que incluyen:

El dominio Tap-C está formado por cuatro hélices alfa empaquetadas una contra la otra. La disposición de las hélices 1, 2 y 3 es similar a la que se observa en un pliegue UBA y está unido al siguiente módulo mediante un enlazador flexible rico en Pro de 12 residuos. [18] [19]

Función

La exportación nuclear de ARNm está mediada por la proteína Tap.

Estructura

Tap puede formar un complejo multimérico consigo mismo y con otros miembros de la familia NXF. Se han caracterizado bien tres dominios funcionales de Tap: el dominio de unión al ARN, el dominio similar al factor de transporte nuclear 2 (NTF2) y el dominio asociado a la ubiquitina (UBA).

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000162231 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000010097 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  5. ^ Yoon DW, Lee H, Seol W, DeMaria M, Rosenzweig M, Jung JU (mayo de 1997). "Tap: una nueva proteína celular que interactúa con la punta del herpesvirus saimiri e induce la agregación de linfocitos". Inmunidad . 6 (5): 571– 82. doi : 10.1016/S1074-7613(00)80345-3 . PMID  9175835.
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  7. ^ Katahira J, Strässer K, Podtelejnikov A, Mann M, Jung JU, Hurt E (mayo de 1999). "La vía de exportación de ARNm nuclear mediada por Mex67p se conserva desde la levadura hasta el ser humano". The EMBO Journal . 18 (9): 2593– 609. doi :10.1093/emboj/18.9.2593. PMC 1171339 . PMID  10228171. 
  8. ^ "Entrez Gene: factor de exportación de ARN nuclear NXF1 1".
  9. ^ Floyd JA, Gold DA, Concepcion D, Poon TH, Wang X, Keithley E, Chen D, Ward EJ, Chinn SB, Friedman RA, Yu HT, Moriwaki K, Shiroishi T, Hamilton BA (noviembre de 2003). "Un alelo natural de Nxf1 suprime las mutaciones insercionales de retrovirus". Nature Genetics . 35 (3): 221– 8. doi :10.1038/ng1247. PMC 2756099 . PMID  14517553. 
  10. ^ Concepcion D, Flores-García L, Hamilton BA (mayo de 2009). "Supresión genética multipotente de mutaciones inducidas por retrotransposón por Nxf1 mediante el ajuste fino del splicing alternativo". PLOS Genetics . 5 (5): e1000484. doi : 10.1371/journal.pgen.1000484 . PMC 2674570 . PMID  19436707. 
  11. ^ Shamsher MK, Ploski J, Radu A (octubre de 2002). "Karyopherin beta 2B participations in mRNA export from the core" (La carioferina beta 2B participa en la exportación de ARNm desde el núcleo). Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 99 (22): 14195– 9. Bibcode :2002PNAS...9914195S. doi : 10.1073/pnas.212518199 . PMC 137860 . PMID  12384575. 
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  18. ^ ab Grant RP, Hurt E, Neuhaus D, Stewart M (abril de 2002). "Estructura del dominio de unión a la nucleoporina FG C-terminal de Tap/NXF1". Nature Structural Biology . 9 (4): 247– 51. doi :10.1038/nsb773. PMID  11875519. S2CID  11338341.
  19. ^ ab Suyama M, Doerks T, Braun IC, Sattler M, Izaurralde E, Bork P (julio de 2000). "La predicción de los dominios estructurales de TAP revela detalles de su interacción con p15 y nucleoporinas". EMBO Reports . 1 (1): 53– 8. doi :10.1093/embo-reports/kvd009. PMC 1083685 . PMID  11256625. 
  • PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información de estructura disponible en el PDB para el factor de exportación de ARN nuclear humano 1 (NXF1)
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