Articulo de referencia

NFYA

La subunidad alfa del factor de transcripción nuclear Y es una proteína que en humanos está codificada por el gen NFYA . [ 5 ] [ 6 ] Función La proteína codificada por este gen ...

La subunidad alfa del factor de transcripción nuclear Y es una proteína que en humanos está codificada por el gen NFYA . [ 5 ] [ 6 ]

Función

La proteína codificada por este gen es una subunidad del complejo trimérico NF-Y, que forma un factor de transcripción altamente conservado que se une a motivos CCAAT en las regiones promotoras de diversos genes. [ 7 ] La subunidad NFYA se asocia con un dímero compacto compuesto por las subunidades NFYB y NFYC, dando como resultado un trímero que se une al ADN con alta especificidad y afinidad. Las interacciones específicas de secuencia del complejo son realizadas por la subunidad NFYA, lo que sugiere su función como subunidad reguladora. Además, existe evidencia de regulación postranscripcional en este producto génico, ya sea por degradación proteica o por control de la traducción. Otra regulación se manifiesta mediante el empalme alternativo en el dominio de activación rico en glutamina, con claras preferencias tisulares específicas para las dos isoformas. [ 8 ]

El complejo NF-Y actúa como factor pionero al promover la accesibilidad de la cromatina para facilitar la colocalización de otros factores de transcripción específicos del tipo celular. [ 9 ]

NF-Y también ha sido implicado como un actor central en la selección del sitio de inicio de la transcripción (TSS) en animales . [ 10 ] Salvaguarda la integridad de la región empobrecida en nucleosomas y la localización del PIC en los promotores de genes codificadores de proteínas .

Interacciones

Se ha demostrado que NFYA interactúa con el factor de respuesta al suero [ 11 ] y ZHX1 . [ 11 ] [ 12 ] NFYA, NFYB y NFYC forman el complejo NFY y se ha demostrado que el complejo NFY actúa como un factor pionero al promover la accesibilidad de la cromatina para facilitar la colocalización de otros factores de transcripción específicos del tipo celular. [ 7 ]

Estructura

La estructura atómica del heterotrímero NFY en complejo con dsDNA se resolvió mediante cristalografía de rayos X ( PDB ID 4awl ). [ 13 ] Utilizando una de las hélices alfa de NFYA como plantilla, se diseñaron péptidos estabilizados inspirados en la estructura para interrumpir la formación del heterotrímero NFY impidiendo que NFYA se uniera al heterodímero NFYB/C . [ 14 ]

Referencias

  1. ^ a b c GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000001167 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abcGRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000023994 – Ensembl, May 2017
  3. ^"Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^"Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^Li XY, Mattei MG, Zaleska-Rutczynska Z, et al. (November 1991). "One subunit of the transcription factor NF-Y maps close to the major histocompatibility complex in murine and human chromosomes". Genomics. 11 (3): 630–634. doi:10.1016/0888-7543(91)90070-U. PMID 1774067.
  6. ^Maity SN, de Crombrugghe B (May 1998). "Role of the CCAAT-binding protein CBF/NF-Y in transcription". Trends in Biochemical Sciences. 23 (5): 174–178. doi:10.1016/S0968-0004(98)01201-8. PMID 9612081.
  7. ^ abOldfield AJ, Yang P, Conway AE, et al. (September 2014). "Histone-fold domain protein NF-Y promotes chromatin accessibility for cell type-specific master transcription factors". Molecular Cell. 55 (5): 708–722. doi:10.1016/j.molcel.2014.07.005. PMC 4157648. PMID 25132174.
  8. ^"Entrez Gene: NFYA nuclear transcription factor Y, alpha".
  9. ^Oldfield AJ, Yang P, Conway AE, et al. (September 2014). "Histone-fold domain protein NF-Y promotes chromatin accessibility for cell type-specific master transcription factors". Molecular Cell. 55 (5): 708–722. doi:10.1016/j.molcel.2014.07.005. PMC 4157648. PMID 25132174.
  10. ^Oldfield AJ, Henriques T, Kumar D, et al. (July 2019). "NF-Y controls fidelity of transcription initiation at gene promoters through maintenance of the nucleosome-depleted region". Nature Communications. 10 (1) 3072. Bibcode:2019NatCo..10.3072O. doi:10.1038/s41467-019-10905-7. PMC 6624317. PMID 31296853.
  11. ^ abYamada K, Osawa H, Granner DK (October 1999). "Identification of proteins that interact with NF-YA". FEBS Letters. 460 (1): 41–45. Bibcode:1999FEBSL.460...41Y. doi:10.1016/S0014-5793(99)01311-3. PMID 10571058. S2CID 28576187.
  12. ^Yamada K, Printz RL, Osawa H, et al. (August 1999). "Human ZHX1: cloning, chromosomal location, and interaction with transcription factor NF-Y". Biochemical and Biophysical Research Communications. 261 (3): 614–621. Bibcode:1999BBRC..261..614Y. doi:10.1006/bbrc.1999.1087. PMID 10441475.
  13. ^Nardini M, Gnesutta N, Donati G, et al. (January 2013). "Sequence-specific transcription factor NF-Y displays histone-like DNA binding and H2B-like ubiquitination". Cell. 152 (1–2): 132–143. doi:10.1016/j.cell.2012.11.047. hdl:2318/1590740. PMID 23332751.
  14. ^Jeganathan S, Wendt M, Kiehstaller S, et al. (November 2019). "Constrained Peptides with Fine-Tuned Flexibility Inhibit NF-Y Transcription Factor Assembly". Angewandte Chemie. 58 (48): 17351–17358. doi:10.1002/anie.201907901. PMC 6900064. PMID 31539186.

Further reading

  • Mantovani R (October 1999). "The molecular biology of the CCAAT-binding factor NF-Y". Gene. 239 (1): 15–27. doi:10.1016/S0378-1119(99)00368-6. PMID 10571030.
  • Li XY, Mantovani R, Hooft van Huijsduijnen R, et al. (March 1992). "Evolutionary variation of the CCAAT-binding transcription factor NF-Y". Nucleic Acids Research. 20 (5): 1087–1091. doi:10.1093/nar/20.5.1087. PMC 312095. PMID 1549471.
  • Li XY, Hooft van Huijsduijnen R, Mantovani R, et al. (May 1992). "Intron-exon organization of the NF-Y genes. Tissue-specific splicing modifies an activation domain". The Journal of Biological Chemistry. 267 (13): 8984–8990. doi:10.1016/S0021-9258(19)50377-5. PMID 1577736.
  • Becker DM, Fikes JD, Guarente L (March 1991). "A cDNA encoding a human CCAAT-binding protein cloned by functional complementation in yeast". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 88 (5): 1968–1972. Bibcode:1991PNAS...88.1968B. doi:10.1073/pnas.88.5.1968. PMC 51147. PMID 2000400.
  • Vuorio T, Maity SN, de Crombrugghe B (December 1990). "Purification and molecular cloning of the "A" chain of a rat heteromeric CCAAT-binding protein. Sequence identity with the yeast HAP3 transcription factor". The Journal of Biological Chemistry. 265 (36): 22480–22486. doi:10.1016/S0021-9258(18)45730-4. PMID 2266139.
  • Mantovani R, Li XY, Pessara U, et al. (August 1994). "Dominant negative analogs of NF-YA". The Journal of Biological Chemistry. 269 (32): 20340–20346. doi:10.1016/S0021-9258(17)31997-X. PMID 8051128.
  • Currie RA (December 1997). "Functional interaction between the DNA binding subunit trimerization domain of NF-Y and the high mobility group protein HMG-I(Y)". The Journal of Biological Chemistry. 272 (49): 30880–30888. doi:10.1074/jbc.272.49.30880. PMID 9388234.
  • Currie RA (julio de 1998). "Caracterización bioquímica del complejo del factor de transcripción NF-Y durante el desarrollo de los linfocitos B" . The Journal of Biological Chemistry . 273 (29): 18220– 18229. doi : 10.1074/jbc.273.29.18220 . PMID  9660784 .
  • Roder K, Wolf SS, Larkin KJ, et al. (junio de 1999). "Interacción entre los dos factores de transcripción NF-Y y Sp1, expresados ​​de forma ubicua". Gene . 234 (1): 61– 69. doi : 10.1016/S0378-1119(99)00180-8 . PMID  10393239 .
  • Yamada K, Printz RL, Osawa H, et al. (agosto de 1999). "ZHX1 humano: clonación, localización cromosómica e interacción con el factor de transcripción NF-Y". Biochemical and Biophysical Research Communications . 261 (3): 614– 621. Bibcode : 1999BBRC..261..614Y . doi : 10.1006/bbrc.1999.1087 . PMID  10441475 .
  • Yamada K, Osawa H, Granner DK (octubre de 1999). "Identificación de proteínas que interactúan con NF-YA" . FEBS Letters . 460 (1): 41– 45. Bibcode : 1999FEBSL.460...41Y . doi : 10.1016/ S0014-5793 (99)01311-3 . PMID  10571058. S2CID  28576187 .
  • Fan W, Jin S, Tong T, et al. (marzo de 2002). "BRCA1 regula GADD45 a través de sus interacciones con los motivos OCT-1 y CAAT" . The Journal of Biological Chemistry . 277 (10): 8061– 8067. doi : 10.1074/jbc.M110225200 . PMID  11777930 .
  • Faniello MC, Chirico G, Quaresima B, et al. (abril de 2002). "Un modelo alternativo de transactivación del promotor de la ferritina H por c-Jun" . The Biochemical Journal . 363 (Pt 1): 53–58 . doi : 10.1042/0264-6021:3630053 . PMC  1222450. PMID  11903046 .
  • Bevilacqua MA, Faniello MC, Iovine B, et al. (noviembre de 2002). "El factor de transcripción NF-Y regula la diferenciación de las células CaCo-2". Archives of Biochemistry and Biophysics . 407 (1): 39– 44. doi : 10.1016/S0003-9861(02)00436-8 . PMID  12392713 .
  • Ge Y, Jensen TL, Matherly LH y col. (Diciembre de 2002). "Regulación sinérgica del promotor de la cistationina-beta-sintasa-1b humana mediante factores de transcripción isoformas NF-YA y Sp1". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Estructura y expresión genética . 1579 ( 2– 3): 73– 80. doi : 10.1016/s0167-4781(02)00509-2 . PMID  12427542 .
  • Salsi V, Caretti G, Wasner M, et al. (febrero de 2003). "Las interacciones entre p300 y múltiples trímeros de NF-Y regulan la función del promotor de la ciclina B2" . The Journal of Biological Chemistry . 278 (9): 6642– 6650. doi : 10.1074/jbc.M210065200 . hdl : 11380/1202119 . PMID  12482752 .
  • Peng Y, Jahroudi N (marzo de 2003). "El factor de transcripción NFY inhibe la activación del promotor del factor de von Willebrand en células no endoteliales mediante el reclutamiento de histonas deacetilasas" . The Journal of Biological Chemistry . 278 (10): 8385– 8394. doi : 10.1074/jbc.M213156200 . PMID  12511565 .

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .

Obtenido de " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=NFYA&oldid=1321961704 "