El software de diseño molecular es un software destacado para el modelado molecular , que proporciona un soporte especial para el desarrollo de modelos moleculares de novo .
A diferencia de los programas de modelado molecular habituales, como los de dinámica molecular y química cuántica , este software admite directamente los aspectos relacionados con la construcción de modelos moleculares, entre los que se incluyen:
- Gráficos moleculares
- Dibujo molecular interactivo y edición conformacional
- construcción de moléculas poliméricas, cristales y sistemas solvatados
- desarrollo de cargos parciales
- optimización geométrica
- apoyo para los diferentes aspectos del desarrollo de campos de fuerza
Comparación de software que abarca los principales aspectos del diseño molecular.
- Gráficos moleculares 3D
- Ratón: dibujo de moléculas con el ratón
- Polipolímero de construcción
- ADN: construcción de ácidos nucleicos
- Péptido – construcción de péptidos
- Cryst – construcción de cristales
- Solv – adición de disolvente
- Q – cargas parciales
- Muelle – atraque
- Optimización mínima
- MM – mecánica molecular
- QM – mecánica cuántica
- FF – apoya el desarrollo de campos de fuerza
- QSAR – QSAR 2D, 3D y de grupo
- FBLD - Diseño de ligandos basado en fragmentos
- FE - Aproximaciones de energía libre
- SN - Navegación espacial
Notas y referencias
Véase también
- editor de moléculas
- Modelado molecular
- Modelado molecular en GPU
- Diseño de proteínas
- Diseño de fármacos
- Campo de fuerza (química)
- Comparación de implementaciones de campos de fuerza
- Comparación de software de simulación de ácidos nucleicos
- Comparación de software para modelado de mecánica molecular
- Lista de sistemas de gráficos moleculares
- Lista de software para modelado molecular de Monte Carlo
- Lista de software para el modelado de nanoestructuras
- Programas informáticos de química cuántica
- Relación cuantitativa estructura-actividad
- XMD , un software de dinámica molecular clásica
Enlaces externos
- Definición del término diseño molecular según la IUPAC .
- Revista de Diseño Molecular Asistido por Computadora
- Recursos para el modelado molecular
- Códigos de modelado de materiales y simulación por ordenador
- Click2Drug.org Directorio de herramientas para el diseño de fármacos mediante simulación computacional (in silico).
- Revista de Información y Modelado Químico
- Revista de Química Computacional
Categorías :
- Software científico
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- Esbozos de software científico