ModBase

ModBase es una base de datos de modelos de estructura de proteínas comparativas anotadas , que contiene modelos para más de 3,8 millones de secuencias de proteínas únicas. ^{[ 1 ]} Los modelos se crean mediante la plataforma de modelado comparativo ModPipe, que se basa en el programa MODELLER .

ModBase se desarrolla en el laboratorio de Andrej Sali en la UCSF . Los modelos de ModBase también son accesibles a través del Portal de Modelos de Proteínas.

Véase también

Modelado por homología

Referencias

1 2 Pieper, Ursula; Webb Benjamin M; Barkan David T; Schneidman-Duhovny Dina; Schlessinger Avner; Braberg Hannes; Yang Zheng; Meng Elaine C; Pettersen Eric F; Huang Conrad C; Datta Ruchira S; Sampathkumar Parthasarathy; Madhusudhan Mallur S; Sjölander Kimmen; Ferrin Thomas E; Burley Stephen K; Sali Andrej (enero de 2011). "ModBase, una base de datos de modelos de estructura de proteínas comparativos anotados y recursos asociados" . Nucleic Acids Res . 39 (número especial de bases de datos). Inglaterra: D465-74. doi : 10.1093/nar/gkq1091 . PMC 3013688. PMID 21097780 .

Enlaces externos

http://salilab.org/modbase

[pmid21097780-1] 1 2 Pieper, Ursula; Webb Benjamin M; Barkan David T; Schneidman-Duhovny Dina; Schlessinger Avner; Braberg Hannes; Yang Zheng; Meng Elaine C; Pettersen Eric F; Huang Conrad C; Datta Ruchira S; Sampathkumar Parthasarathy; Madhusudhan Mallur S; Sjölander Kimmen; Ferrin Thomas E; Burley Stephen K; Sali Andrej (enero de 2011). "ModBase, una base de datos de modelos de estructura de proteínas comparativos anotados y recursos asociados" . Nucleic Acids Res . 39 (número especial de bases de datos). Inglaterra: D465-74. doi : 10.1093/nar/gkq1091 . PMC 3013688. PMID 21097780 .

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