Parcela de Manhattan

Un gráfico de Manhattan es un tipo de gráfico que se utiliza habitualmente para mostrar datos con un gran número de puntos, muchos de ellos con amplitud distinta de cero, y con una distribución de valores de mayor magnitud. Este gráfico se utiliza comúnmente en estudios de asociación de genoma completo (GWAS) para mostrar polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) significativos . ^{[ 1 ]}

Recibe su nombre por la similitud de dicho diseño con el perfil urbano de Manhattan : una hilera de rascacielos que se elevan por encima de los "edificios" de menor altura, que varían en altura.

En los gráficos de Manhattan de GWAS, las coordenadas genómicas se muestran en el eje x , mientras que el logaritmo negativo del valor p de la asociación para cada polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) se muestra en el eje y . Esto significa que cada punto en el gráfico de Manhattan representa un SNP. Dado que las asociaciones más fuertes tienen los valores p más pequeños (por ejemplo, 10⁻¹⁵ ⁾ , sus logaritmos negativos serán los mayores (por ejemplo, 15). Los diferentes colores de cada bloque suelen indicar la extensión de cada cromosoma.