Hispanopedia WikiMacVector es una aplicación comercial de análisis de secuencias para computadoras Apple Macintosh que ejecutan Mac OS X. Está destinada a ser utilizada por biólogos moleculares para ayudar a analizar, diseñar, investigar y documentar sus experimentos en el laboratorio. MacVector 18.1 es un binario universal capaz de ejecutarse en Macs Intel y Apple Silicon.
Características
MacVector es una colección de algoritmos de análisis de secuencias vinculados a varios editores de secuencias, entre los que se incluyen un editor de secuencia única, un editor de alineamiento de secuencias múltiples y un editor de contig. MacVector intenta utilizar un mínimo de ventanas y pasos para acceder a todas las funciones. Las funciones incluyen:
- Alineación de secuencias ( ClustalW , Muscle y T-Coffee ) y edición.
- Búsqueda de subsecuencias y análisis de marcos de lectura abiertos (ORF).
- Construcción de árboles filogenéticos UPGMA , unión de vecinos con bootstrap y árboles de consenso
- Búsqueda en bases de datos en línea: busque en bases de datos públicas del NCBI, como Genbank , PubMed y UniProt .
- Realizar búsquedas BLAST en línea.
- Análisis de proteínas.
- Ensamblaje de contig y edición de cromatogramas
- Alineación del ADNc con las plantillas genómicas
- Creación de diagramas de puntos de ADN a ADN, proteína a proteína y ADN a proteína.
- Análisis de restricción: busca y visualiza sitios de corte de restricción. Utiliza fragmentos digeridos para clonar genes en vectores. Almacena un historial de fragmentos digeridos que permite ligaciones de múltiples fragmentos.
- Diseño de cebadores para PCR : diseño y prueba de cebadores sencillos. También utiliza primer3
- Simulación de gel de agarosa .
- Análisis CRISPR INDEL.
MacVector tiene un complemento de ensamblaje contig llamado Assembler que usa phred , phrap , Bowtie , SPAdes, Velvet y cross match .
A partir de la versión 13.0.1, MacVector utiliza Sparkle para actualizar entre versiones.
Historia
MacVector fue desarrollado originalmente por IBI en 1994. [1] Fue adquirido por Kodak y posteriormente por Oxford Molecular en 1996. [2] [3] Oxford Molecular se fusionó con Accelrys en 2001. [4] Fue adquirido por MacVector, Inc el 1 de enero de 2007. [5]
Referencias
- ^ "MacVector: un programa de análisis de secuencias integrado para Macintosh". Olson SA. Methods Mol Biol . (1994) 25,195-201.
- ^ "Software de secuenciación de ADN - Sección de anuncios especiales". Science . 7 de junio de 1996.
- ^ http://findarticles.com/p/articles/mi_hb197/is_/ai_n5566980# [ enlace roto ]
- ^ "Acerca de Accelrys, incluyendo liderazgo de la empresa, reconocimiento y novedades". Accelrys.com. 4 de mayo de 2009. Archivado desde el original el 9 de enero de 2010. Consultado el 26 de julio de 2012 .
- ^ "Accelrys - Productos adicionales". accelrys.com. Archivado desde el original el 2008-06-07 . Consultado el 2012-07-24 .
Enlaces externos
- Página de inicio de MacVector
