Hispanopedia WikiMOLCAS es un programa de química computacional desarrollado ab initio como un proyecto conjunto de varios institutos internacionales. MOLCAS fue desarrollado por científicos para que lo utilizaran científicos. No es principalmente un producto comercial y no se vende con el fin de producir una fortuna para su propietario (la Universidad de Lund ).
El programa se centra en los métodos para calcular estructuras electrónicas generales tanto en estados fundamentales como excitados. MOLCAS contiene códigos para cálculos de SCF multiconfiguracionales generales y efectivos en el nivel de Espacio Activo Completo (CASSCF), pero también emplea funciones de onda MCSCF más restringidas (RASSCF). También es posible, en este nivel de teoría, optimizar geometrías para estados de equilibrio y transición utilizando técnicas de gradiente y calcular campos de fuerza y energías vibracionales. MOLCAS también contiene códigos de teoría de perturbaciones de segundo orden CASPT2 y RASPT2.
Historia
El código MOLCAS fue creado a finales de los años 80 por el grupo del profesor Björn O. Roos en la Universidad de Lund . El nombre del programa es una combinación de Molecule (código integral de Jan Almlöf) y CAS (programa de espacio activo completo desarrollado por Björn O. Roos).
MOLCAS 2 se lanzó en 1992. Se distribuyó en una cinta para IBM VM/XA . Contiene nuevo código de interacción de configuración (escrito por Jeppe Olsen), nuevo código integral (escrito por Roland Lindh) y código de clúster acoplado (escrito en la Universidad Comenius ). MOLCAS 4 (1999) fue una primera versión, que se ejecuta en cualquier sistema operativo Unix o Linux. En 2001 se lanzó MOLCAS 5, que presenta un modelo distribuido para el desarrollo de código. [1]
En septiembre de 2017, la mayor parte del código MOLCAS se ramificó como código abierto (licencia LGPL 2.1), bajo el nombre OpenMolcas. [2] La versión estable del código MOLCAS es distribuida por la Universidad de Lund .
Características principales
Las principales características de MOLCAS se pueden encontrar en el sitio web de Molcas: manual, [3] colección de tutoriales. [4] Existen varias publicaciones que presentan las capacidades de las diferentes versiones de MOLCAS: [5]
. [6] MOLCAS 7.2 ha sido revisado de forma independiente en JACS computer software reviews. [7]
- Ab initio Hartree–Fock (HF), teoría funcional de la densidad (DFT), teoría de perturbación de segundo orden de Møller–Plesset , MCSCF , MRCI , CC , teoría de perturbación de segundo orden de referencia multiconfiguracional CASPT2 (incluidos MS y XMS) y funciones de onda y energías de RASPT2
- Optimización de la geometría del gradiente analítico basada en las funciones de onda HF, DFT, CASSCF y RASSCF
- Técnicas de descomposición de Cholesky (CD) y resolución de la identidad (RI) para HF, DFT, CASSCF, CC, MBPT2 y CASPT2.
- Gradientes analíticos y vectores de acoplamiento no adiabáticos.
- Técnica de función de base auxiliar sobre la marcha, CD atómico y CD compacto atómico.
- Gradientes CD/RI para funcionales DFT.
- Optimización de la geometría del gradiente numérico basada en funciones de onda CASPT2.
- Energías de estado excitadas para todas las funciones de onda y geometrías optimizadas excitadas a partir de funciones de onda CASSCF promediadas por estado.
- Propiedades de transición en estados excitados calculadas en el nivel CASSCF/RASSCF, utilizando un método único de interacción de estados RASSCF.
- Los efectos de los disolventes se pueden tratar mediante el modelo de cavidad esférica de Onsager o el modelo continuo polarizable (PCM).
- Cálculos combinados de mecánica molecular y QM para sistemas como proteínas y clústeres moleculares.
- El procedimiento NEMO para crear campos de fuerza intermoleculares para simulaciones MC/MD; estos campos de fuerza incluyen términos de electrostática, inducción, dispersión e intercambio-repulsión y se basan en cálculos para moléculas individuales.
- Dinámica molecular del salto de superficie de Tully
- Método para la localización y caracterización de intersecciones y costuras cónicas
- MOLCAS tiene una interfaz con varios códigos computacionales, incluidos los códigos DMRG, [8] [9] CheMPS2), el código MRCI COLUMBUS , el código de dinámica molecular [10]
- Hay varios códigos de interfaz gráfica de usuario para MOLCAS: [11] [12] y MolGUI.
Referencias
- ^ Veryazov, Valera; Widmark, Per-Olof; Serrano-Andrés, Luis; Lindh, Roland; Roos, Björn O. (2004). "2MOLCAS como plataforma de desarrollo de software de química cuántica". Revista Internacional de Química Cuántica . 100 (4): 626– 635. doi :10.1002/qua.20166.
- ^ "Anuncio de OpenMolcas".
- ^ "Manual de Molcas".
- ^ "Colección de tutoriales de Molcas".
- ^ Karlstrom, Gunnar; Lindh, Roland; Malmqvist, Per-Åke; Roos, Björn O.; Ryde, Ulf; Veryazov, Valera; Widmark, Per-Olof; Cossi, Mauricio; Schimmelpfennig, Bernd; Neogrado, Pavel; Seijo, Luis (2003). "MOLCAS: un paquete de programas para química computacional". Ciencia de Materiales Computacionales . 28 : 222-239 .
- ^ Aquilante, Francisco; Autschbach, Jochen; Carlson, Rebecca K.; Chibotaru, Liviu F.; Delcey, Mickaël G.; De Vico, Luca; Fdez. Galván, Ignacio; Ferré, Nicolás; Frutos, Luis Manuel; Gagliardi, Laura; Garavelli, Marco; Giussani, Angelo; Hoyer, Chad E.; Li Manni, Giovanni; Lischka, Hans; Mamá, Dongxia; Malmqvist, Per Åke; Müller, Thomas; Nenov, Artur; Olivucci, Massimo; Pedersen, Thomas Bondo; Peng, Daoling; Plasser, Félix; Pritchard, Ben; Reiher, Markus; Rivalta, Iván; Schapiro, Igor; Segarra-Martí, Javier; Stenrup, Michael; et al. (2016), "Molcas 8: Nuevas capacidades para cálculos químicos cuánticos multiconfiguracionales en toda la tabla periódica" (PDF) , Journal of Computational Chemistry , 37 (5): 506– 541, doi :10.1002/jcc.24221, PMID 26561362
- ^ Duncan, James A. (2009). "MOLCAS 7.2". Revista de la Sociedad Química Americana . 131 (6): 2416. doi :10.1021/ja900300h. PMID 19173643.
- ^ "Página de inicio de QCMaquis".
- ^ "Bloquear página de inicio".
- ^ "Página de inicio de SHARC".
- ^ "Página de inicio de LUSCUS".
- ^ "Visualizador molecular portátil GV".
Enlaces externos
- Página de inicio de MOLCAS
- Página del proyecto OpenMolcas