El mediador de la subunidad 26 de la transcripción de la ARN polimerasa II es una enzima que en humanos está codificada por el gen MED26 . [ 5 ] [ 6 ] Forma parte del complejo Mediador .
La activación de la transcripción génica es un proceso de múltiples pasos que se desencadena por factores que reconocen sitios potenciadores de la transcripción en el ADN. Estos factores trabajan con coactivadores para dirigir la iniciación de la transcripción por el aparato de la ARN polimerasa II. La proteína codificada por este gen es una subunidad del complejo CRSP (cofactor requerido para la activación de SP1), que, junto con TFIID, es necesario para una activación eficiente por SP1. Esta proteína también es un componente de otros complejos multisubunitarios, como las proteínas asociadas al receptor de la hormona tiroidea (TR), que interactúan con TR y facilitan su función en las plantillas de ADN junto con factores de iniciación y cofactores. [ 6 ]
Actividad
MED26 es un factor de elongación de la transcripción que aumenta la tasa de transcripción general de la ARN polimerasa II al reactivar los complejos de elongación de la transcripción que han detenido la transcripción . Lo hace reclutando complejos que contienen ELL/EAF y P-TEFb a los promotores mediante una interacción directa con el dominio N-terminal (NTD). El NTD de MED26 también se une a TFIID, y TFIID y los complejos de elongación interactúan con MED26 a través de sitios de unión superpuestos. [ 7 ] El NTD de MED26 puede funcionar como un interruptor molecular que contribuye a la transición de Pol II a la elongación productiva.
Los tres dominios estructurales de TFIIS se conservan desde la levadura hasta el ser humano . Los aproximadamente 80 residuos N-terminales forman un dominio de interacción proteica que contiene un motivo conservado, denominado motivo LW debido a los residuos invariables de leucina y triptófano que contiene. Si bien el dominio N-terminal no es necesario para la actividad transcripcional , se ha identificado una secuencia similar en otros factores de transcripción y proteínas que se localizan predominantemente en el núcleo . [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] A continuación se enumeran algunos ejemplos específicos:
- MED26 (también conocida como CRSP70 y ARC70), una subunidad del complejo Mediador, que es necesaria para la actividad de la proteína Sp1 de unión al potenciador.
- Elongina A, una subunidad de un factor de elongación de la transcripción conocido anteriormente como SIII. Aumenta la tasa de transcripción al suprimir la pausa transitoria del complejo de elongación .
- PPP1R10, una subunidad reguladora nuclear de la proteína fosfatasa 1 que anteriormente se conocía como p99, FB19 o PNUTS.
- PIBP, una pequeña proteína hipotética que podría ser una proteína de unión a fosfoinosítidos .
- IWS1, que se cree que funciona tanto en la iniciación como en la elongación de la transcripción. [ 11 ]
- TFIIS, que rescata a la ARN polimerasa II de los estados de pausa con retroceso.
El dominio N-terminal de MED26 es un plegamiento proteico conocido como dominio N-terminal TFIIS (o TND). [ 8 ] Es un haz compacto de cinco hélices. Los residuos centrales hidrofóbicos de las hélices 2, 3 y 4 están bien conservados entre los dominios TFIIS, aunque la hélice 1 está menos conservada. [ 10 ]
Interacciones
Se ha demostrado que MED26 interactúa con MED8 , [ 12 ] la quinasa dependiente de ciclina 8 , [ 12 ] POLR2A , [ 12 ] MED12 [ 12 ] y MED28 . [ 12 ] También actúa sinérgicamente para mediar la interacción entre REST (un factor de transcripción de dedo de zinc de tipo Kruppel que se une a un elemento de silenciamiento RE1 de 21 pb presente en más de 900 genes humanos) y Mediator. [ 13 ]
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000105085 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000045248 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- ↑ Ryu S, Zhou S, Ladurner AG, Tjian R (febrero de 1999). "El complejo cofactor transcripcional CRSP es necesario para la actividad de la proteína de unión al potenciador Sp1". Nature . 397 (6718): 446– 450. Bibcode : 1999Natur.397..446R . doi : 10.1038/17141 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0019-A36A-8 . PMID 9989412. S2CID 4405569 .
- 1 2 "Gen Entrez: cofactor CRSP7 necesario para la activación transcripcional de Sp1, subunidad 7, 70 kDa" .
- ↑ Takahashi H, Parmely TJ, Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA, Kong SE, et al. (julio de 2011). " La subunidad MED26 del mediador humano funciona como un sitio de acoplamiento para factores de elongación de la transcripción" . Cell . 146 (1): 92–104 . doi : 10.1016/j.cell.2011.06.005 . PMC 3145325. PMID 21729782 .
- 1 2 Cermakova K, Veverka V, Hodges HC (enero de 2023). "El dominio N-terminal (TND) de TFIIS: un módulo de ensamblaje de transcripción en la interfaz del orden y el desorden" . Biochemical Society Transactions . 51 (1): 125– 135. doi : 10.1042/BST20220342 . PMC 9987994. PMID 36651856. S2CID 255969299 .
- ↑ Booth V, Koth CM, Edwards AM, Arrowsmith CH (octubre de 2000). "Estructura de un dominio conservado común a los factores de transcripción TFIIS, elongina A y CRSP70" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (40): 31266–31268 . doi : 10.1074/jbc.M002595200 . PMID 10811649 .
- 1 2 Ling Y, Smith AJ, Morgan GT (2006). "Un motivo de secuencia conservado en diversas proteínas nucleares identifica un dominio de interacción proteica utilizado para la localización nuclear por TFIIS humano" . Nucleic Acids Research . 34 (8): 2219– 2229. doi : 10.1093 / nar/gkl239 . PMC 1450333. PMID 16648364 .
- ↑ Cermakova K, Demeulemeester J, Lux V, Nedomova M, Goldman SR, Smith EA, et al. (noviembre de 2021). " Un módulo de interacción de proteínas desordenadas y ubicuas orquesta la elongación de la transcripción" . Science . 374 (6571): 1113– 1121. Bibcode : 2021Sci...374.1113C . doi : 10.1126/science.abe2913 . PMC 8943916. PMID 34822292 .
- 1 2 3 4 5 Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ, Florens L, Zybailov B, Swanson SK, et al. (junio de 2004). "Un conjunto de subunidades mediadoras de mamíferos consensuadas identificadas mediante tecnología de identificación de proteínas multidimensional" . Molecular Cell . 14 (5): 685– 691. doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.006 . PMID 15175163 .
- ↑ Ding N, Tomomori-Sato C, Sato S, Conaway RC, Conaway JW, Boyer TG (enero de 2009). "MED19 y MED26 son objetivos funcionales sinérgicos del factor de transcripción silenciador RE1 en el silenciamiento epigenético de la expresión génica neuronal" . The Journal of Biological Chemistry . 284 (5): 2648– 2656. doi : 10.1074/jbc.M806514200 . PMC 2631966. PMID 19049968 .
Lecturas adicionales
- Näär AM, Beaurang PA, Zhou S, Abraham S, Solomon W, Tjian R (abril de 1999). "El coactivador compuesto ARC media la activación transcripcional dirigida por la cromatina". Nature . 398 ( 6730): 828– 832. Bibcode : 1999Natur.398..828N . doi : 10.1038/19789 . PMID 10235267. S2CID 23646963 .
- Booth V, Koth CM, Edwards AM, Arrowsmith CH (octubre de 2000). "Estructura de un dominio conservado común a los factores de transcripción TFIIS, elongina A y CRSP70" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (40): 31266–31268 . doi : 10.1074/jbc.M002595200 . PMID 10811649 .
- Näär AM, Taatjes DJ, Zhai W, Nogales E, Tjian R (junio de 2002). "La CRSP humana interactúa con el CTD de la ARN polimerasa II y adopta una conformación específica unida al CTD" . Genes & Development . 16 (11): 1339– 1344. doi : 10.1101/gad.987602 . PMC 186316. PMID 12050112 .
- Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA, Parmely TJ, Sorokina I, Brower CS, et al. (diciembre de 2003). "Un homólogo de mamíferos del coactivador transcripcional intersex de Drosophila melanogaster es una subunidad del complejo Mediador de mamíferos" . The Journal of Biological Chemistry . 278 (50): 49671– 49674. doi : 10.1074/jbc.C300444200 . PMID 14576168 .
- Tomomori-Sato C, Sato S, Parmely TJ, Banks CA, Sorokina I, Florens L, et al. (febrero de 2004). "Una subunidad mediadora de mamíferos que comparte propiedades con la subunidad mediadora Cse2 de Saccharomyces cerevisiae" . The Journal of Biological Chemistry . 279 (7): 5846– 5851. doi : 10.1074/jbc.M312523200 . PMID 14638676 .
- Mo X, Kowenz-Leutz E, Xu H, Leutz A (enero de 2004). "Ras induce el intercambio del complejo mediador en C/EBP beta" . Molecular Cell . 13 (2): 241–250 . doi : 10.1016/S1097-2765(03)00521-5 . PMID 14759369 .
- Sato S, Tomomori-Sato C, Parmely TJ, Florens L, Zybailov B, Swanson SK, et al. (junio de 2004). "Un conjunto de subunidades mediadoras de mamíferos consensuadas identificadas mediante tecnología de identificación de proteínas multidimensional" . Molecular Cell . 14 (5): 685– 691. doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.006 . PMID 15175163 .
- Zhang X, Krutchinsky A, Fukuda A, Chen W, Yamamura S, Chait BT, Roeder RG (julio de 2005). "MED1/TRAP220 existe predominantemente en una subpoblación TRAP/Mediador enriquecida en ARN polimerasa II y es necesaria para la transcripción mediada por ER" . Molecular Cell . 19 (1): 89–100 . doi : 10.1016/j.molcel.2005.05.015 . PMID 15989967 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (noviembre de 2006). " Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización" . Cell . 127 (3): 635– 648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573 .
- Genes en el cromosoma 19 humano
- dominios de proteínas