En biología molecular, lin-4 es un microARN (miRNA) que se identificó a partir de un estudio sobre la cronología del desarrollo en el nematodo Caenorhabditis elegans . [ 1 ] [ 2 ] Fue el primero en ser descubierto de los miRNAs, una clase de ARN no codificantes involucrados en la regulación génica. [ 3 ] Los miRNAs se transcriben como precursores de ~70 nucleótidos y posteriormente son procesados por la enzima Dicer para dar un producto de 21 nucleótidos. La extensión de los precursores en horquilla no se conoce generalmente y se estima en base a la predicción de horquillas. Se cree que los productos tienen funciones reguladoras a través de la complementariedad completa o parcial con el ARNm. Se ha encontrado que el gen lin-4 se encuentra dentro de un intrón de 4,11 kb de un gen huésped separado lho-1 (véase también).
Transcripción
lin-4 se transcribe a partir de promotores de miRNA autónomos y está regulado durante el desarrollo, produciéndose la acumulación de miRNA lin-4 en la etapa L2 del desarrollo postembrionario. Además, se observa una regulación positiva de los transcritos primarios endógenos de lin-4 tras la aparición de la forma madura de lin-4. [ 4 ] lin-4 se encuentra en el cromosoma II de C. elegans y es complementario a secuencias en la región 3' no traducida (UTR) del ARNm de lin-14. Este transcrito complementario contiene siete sitios de unión junto con el elemento central de 9 nucleótidos CUCAGGGAA. Se observa que el dúplex lin-4: lin-14 adopta una estructura inusualmente curvada, causada por cambios inducidos en la dimensión del surco y el apilamiento de bases debido a los pares de bases no coincidentes. [ 4 ] Este par lin-4:lin-14 se ha relacionado con la vía IGF-1 en C. elegans en lo que respecta a su modificación del desarrollo. [ 5 ]
Influencia del desarrollo
lin-4 actúa para dictar el inicio de las etapas larvarias de los eventos de desarrollo en C. elegans . Las mutaciones de pérdida de función (lf) de lin-4 producen un retraso resultante en los destinos del desarrollo, desde sus etapas larvarias inicialmente tempranas a etapas larvarias tardías. Las consecuencias incluyen patrones de desarrollo heterocrónicos , con pérdida de estructuras como la vulva y la cutícula adulta. [ 1 ] lin-4 actúa como un regulador negativo de lin-14 [ 6 ] [ 7 ] y reprime la acumulación de la proteína LIN-14. [ 8 ] También se dirige a lin-28 y reduce su expresión proteica a través de la inhibición de la traducción. [ 9 ] El apareamiento de bases en el lugar entre lin-4 y el objetivo en cuestión es discontinuo, consistiendo en dos hélices cortas. [ 10 ]
Referencias
- 1 2 Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V (1993). "El gen heterocrónico lin-4 de C. elegans codifica pequeños ARN con complementariedad antisentido a lin-14 " . Cell . 75 (5): 843–854 . doi : 10.1016/0092-8674(93)90529-Y . PMID 8252621 .
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- 1 2 Balasubramanian C, Ojha RP, Maiti S, Desideri A (2010). "Muestreo de la estructura del complejo microARN:ARNm no canónico lin-4:lin-14 mediante simulaciones de dinámica molecular". J Phys Chem B . 114 (49): 16443– 9. doi : 10.1021/jp104193r . PMID 21090710 .
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- ↑ Olsen PH, Ambros V (1999). "El ARN regulador lin-4 controla el momento del desarrollo en Caenorhabditis elegans bloqueando la síntesis de la proteína LIN-14 después del inicio de la traducción" . Dev Biol . 216 (2): 671–80 . doi : 10.1006/dbio.1999.9523 . PMID 10642801 .
- ↑ Bagga S, Bracht J, Hunter S, Massirer K, Holtz J, Eachus R, et al. (2005). "La regulación por los miRNAs let-7 y lin-4 produce degradación del ARNm diana" . Cell . 122 (4): 553– 63. doi : 10.1016/j.cell.2005.07.031 . PMID 16122423 .
- ↑ Ambros V (2001). "microARN: pequeños reguladores con gran potencial" . Cell . 107 (7): 823–6 . doi : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . PMID 11779458 .
Enlaces externos
- Página del precursor de microARN lin-4 en Rfam
- Entrada de MirBase para lin-4
- MicroARN