Bucle de tallo besándose

Los retrovirus son virus que se replican silenciosamente dentro de un huésped, manteniéndolo con vida hasta que la replicación se completa y el huésped ya no es necesario. El ARN genómico de los retrovirus se une de forma no covalente a la estructura de enlace del dímero (DLS), una región no codificante en la región 5' UTR. Para que se produzca la interacción del bucle de apareamiento, existe una interacción triple que involucra una purina flanqueante en 5' y dos bases centrales en la cadena complementaria. Esta interacción se transcribe en el surco mayor del dímero del bucle de apareamiento. ^{[ 7 ]}

El virus de la inmunodeficiencia humana ( VIH ) es un retrovirus que se transmite a través de fluidos corporales. Existen dos tipos de VIH: el virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 ( VIH-1 ) y el virus de la inmunodeficiencia humana tipo 2 ( VIH-2 ). De los dos tipos, el VIH-1 es la cepa más común. El ARN del VIH-1 utiliza la interacción de bucle de tallo-bucle como mecanismo de reconocimiento, siendo este el paso principal de la interacción del sitio de iniciación de la dimerización (DIS) para formar el dúplex. Para estudiar esta interacción, se observó que el complejo del sitio de iniciación de la dimerización (DIS) era esencial para la replicación del VIH tipo 1 en la célula eucariota , y que cualquier alteración en la estructura del bucle de tallo disminuía la interacción de dimerización. Experimentalmente, se ha observado que, in vivo, la mutación del sitio de iniciación de la dimerización (DIS) obstruye la dimerización del complejo DIS. ^{[ 8 ]}

El complejo de apareamiento está compuesto por dos bucles en horquilla que funcionan como reguladores del plásmido CoLE1 en la bacteria E. coli . Esta regulación se produce cuando el ARN antisentido de E. coli y el cebador de ARN responsable de la replicación del ADN se hibridan para formar el complejo de apareamiento. ^{[ 9 ]}