Articulo de referencia

Centro Internacional de Coordinación de Neuroinformática

{{cite web |title=History |website=KI.se |url=https://ki.se/en/neuro/incf-international-neuroinformatics-coordinating-facility |access-date=9 October 2019 }} "},"founder":{"wt":...

La International Neuroinformatics Coordinating Facility ( INCF ) es una organización internacional sin fines de lucro cuya misión [ 3 ] es desarrollar, evaluar y respaldar estándares y mejores prácticas que adopten los principios de neurociencia abierta, FAIR [ 4 ] y citable. INCF también ofrece capacitación sobre cómo los estándares y las mejores prácticas facilitan la reproducibilidad y permiten la publicación de la totalidad de los resultados de la investigación, incluidos los datos y el código. INCF se estableció en 2005 por recomendación del grupo de trabajo del Foro Mundial de la Ciencia de la OCDE . [ 5 ] INCF tiene su sede en el Instituto Karolinska en Estocolmo , Suecia . [ 6 ] La red de INCF comprende instituciones, organizaciones, empresas e individuos activos en neuroinformática, neurociencia, ciencia de datos, tecnología, política científica y publicación. La Red está organizada en órganos rectores y grupos de trabajo que coordinan diversas categorías de actividades globales de neuroinformática que guían y supervisan el desarrollo y la aprobación de estándares y mejores prácticas, además de proporcionar capacitación sobre cómo los estándares y las mejores prácticas facilitan la reproducibilidad y permiten la publicación de la totalidad de los resultados de la investigación, incluidos los datos y el código. [ 7 ] Los directores actuales son Mathew Abrams y Helena Ledmyr, [ 8 ] y la presidenta del Consejo de Administración es Maryann Martone.

La red INCF tiene como objetivo [ 9 ] promover la aplicación de enfoques computacionales para comprender el cerebro y desarrollar la infraestructura necesaria para utilizar métodos computacionales para integrar y analizar datos diversos en diferentes escalas, técnicas y especies para comprender el cerebro e impactar positivamente en la salud y el bienestar de la sociedad.

Fondo

Un elemento clave para comprender con éxito el sistema nervioso es la integración de la neurociencia con las ciencias de la información . El campo que estudia el sistema nervioso, la neurociencia, ha respondido al desafío de comprender cómo funciona nuestro cerebro mediante el uso de las tecnologías más sofisticadas, desde estudios del genoma hasta imágenes cerebrales del comportamiento en humanos y otras especies, en diferentes estados funcionales y en todos los niveles analíticos intermedios. Este esfuerzo ha generado grandes cantidades de datos, que aumentan constantemente a medida que aumenta su complejidad. Los datos producidos son heterogéneos, provenientes de diferentes niveles de estudio y modalidades de análisis. Para afrontar este desafío de integración y garantizar un uso eficiente y máximo de estos datos, ahora es necesario desarrollar y crear estos recursos compartidos:

  1. bases de datos y conocimientos sobre neurociencia;
  2. herramientas analíticas y de modelado; y
  3. modelos computacionales.

Este reto se está afrontando mediante la fusión de las neurociencias con la ciencia de la información: el campo de la neuroinformática.

Historia

Génesis

La recomendación de coordinar los esfuerzos internacionales en el nuevo campo de la neuroinformática se formuló por primera vez en el informe sobre bioinformática elaborado bajo los auspicios del entonces Foro de Megaciencia de la OCDE en 1998. [ 10 ] Tras extensas discusiones en el Grupo de Trabajo de Neuroinformática del Foro Mundial de la Ciencia, presidido por el Dr. Stephen H. Koslow, la propuesta de crear un Consejo Coordinador Internacional de Neuroinformática y un sistema de financiación mediante subvenciones para la investigación en neuroinformática se presentó en 2002. [ 11 ] Este proyecto fue respaldado por los ministros de ciencia de la OCDE en su reunión de enero de 2004. Dieciséis países (Australia, Canadá, China, República Checa, Dinamarca, Finlandia, Francia, Alemania, India, Italia, Japón, Países Bajos, Noruega, Suecia, Suiza, Reino Unido, Estados Unidos y Victoria, Australia), así como la Comisión Europea, elaboraron los documentos de trabajo que constituyen la base jurídica del INCF y del Programa Internacional de Neuroinformática (PIN). [ 12 ]

Establecimiento

Las condiciones establecidas para la creación del INCF [ 13 ] se cumplieron en julio de 2005, cuando siete países (República Checa, Finlandia, Alemania, Noruega, Suecia, Suiza y Estados Unidos) firmaron el documento de entendimiento y se comprometieron a aportar su contribución financiera. Se lanzó una candidatura para albergar la Secretaría del INCF. Se recibieron dos propuestas y, según las instrucciones del Consejo de Administración, el 3 de noviembre, la OCDE [ 14 ] convocó a un panel de expertos para revisar y clasificar las propuestas. El panel otorgó la mejor clasificación a la propuesta sueca, y esta recomendación fue respaldada por el Consejo de Administración del INCF en su reunión en la sede de la OCDE el 28 de noviembre. Tras extensas discusiones internacionales, el INCF se inauguró oficialmente en febrero de 2007, con sede en el Instituto Karolinska de Estocolmo.

INCF promueve la colaboración en neuroinformática y la reproducibilidad en la investigación cerebral mediante

  • proporcionar coordinación de la infraestructura global de neurociencia a través del desarrollo y respaldo de estándares y mejores prácticas en apoyo de la neurociencia abierta y FAIR (localizable, accesible, interoperable y reutilizable) ( datos FAIR ) [ 15 ]
  • capacitar a investigadores, administradores y estudiantes sobre cómo la neuroinformática promueve el rigor y la reproducibilidad, la ciencia abierta y FAIR y la publicación de la totalidad de su producción de investigación: narrativa, datos y código [ 16 ].
  • Fomentar que la neurociencia, como disciplina, avance hacia FORCE (Ecosistema Justo, Abierto, Basado en Objetos de Investigación y Citable).
  • promover el avance y el desarrollo continuo de la neuroinformática como disciplina científica.

Principales resultados esperados del programa

incluir

  • Espacio de Waxholm (WHS), [ 17 ] un espacio de referencia basado en coordenadas del cerebro de roedores
  • Atlas cerebral escalable, [ 18 ] un motor de visualización basado en la web para atlas cerebrales, datos de imágenes y topologías.
  • NineML, [ 19 ] un lenguaje general de descripción de modelos
  • El Coordinador de Multisimulación (MUSIC), [ 20 ] que permite que simuladores neuronales a gran escala y otras aplicaciones se comuniquen durante el tiempo de ejecución.
  • El Modelo de Datos de Informática de Neuroimagen (NI-DM), [ 21 ] un marco para la generación, almacenamiento y consulta de metadatos que incluye información de procedencia
  • KnowledgeSpace, [ 22 ] una enciclopedia basada en la comunidad que vincula conceptos de investigación cerebral con datos, modelos y literatura de todo el mundo.
  • TrainingSpace, [ 23 ] un repositorio en línea que vincula recursos de capacitación en neuroinformática desarrollados tanto por INCF, nuestros socios, como por recursos comunitarios existentes.

Véase también

Referencias

  1. "Historia" . KI.se. Consultado el 9 de octubre de 2019 .
  2. 1 2 "Contacto" . INCF . Consultado el 9 de octubre de 2019 .
  3. "Misión | INCF" . www.incf.org . Consultado el 9 de octubre de 2019 .
  4. Hagstrom, Stephanie (2014-09-03). "Los principios de datos FAIR" . FORCE11 . Recuperado el 2017-12-04 .
  5. "Acerca de" . Consorcio de Revisión por Pares en Neurociencia . Consultado el 19 de septiembre de 2017 .
  6. "Ubicación | INCF" . www.incf.org . Consultado el 09/10/2019 .
  7. "Red INCF | INCF" . www.incf.org . Consultado el 9 de octubre de 2019 .
  8. "Personal clave | INCF" . www.incf.org . Consultado el 8 de octubre de 2019 .
  9. "Qué hacemos | INCF" . www.incf.org . Consultado el 4 de diciembre de 2017 .
  10. Grupo de Trabajo del Foro de Megaciencia sobre Informática Biológica (enero de 1999). Informe final (Informe). Organización para la Cooperación y el Desarrollo Económicos. págs. 3–4 , 49–50 , 70–72 . Recuperado el 19 de septiembre de 2017 a través de INCF ownCloud. 
  11. Grupo de Trabajo de Neuroinformática del Foro Mundial de la Ciencia (junio de 2002). Informe sobre Neuroinformática (Informe). Organización para la Cooperación y el Desarrollo Económicos. págs. 5, 11–15 , 46. Recuperado el 19 de septiembre de 2017 a través de ICNF ownCloud. 
  12. "Lanzamiento del proyecto | INCF" . www.OECD.org . Consultado el 9 de octubre de 2019 .
  13. "Incf | INCF" . www.incf.org . Consultado el 4 de diciembre de 2017 .
  14. "OECD.org - OCDE" . www.oecd.org . Consultado el 4 de diciembre de 2017 .
  15. Wilkinson M, Dumontier M, Aalbersberg I, et al. (marzo de 2016). "Los principios rectores FAIR para la gestión y administración de datos científicos" . Scientific Data . 3 (160018): 160018. Bibcode : 2016NatSD...360018W . doi : 10.1038/sdata.2016.18 . PMC 4792175. PMID 26978244 .   
  16. Breeze JL, Poline JB, Kennedy DN (julio de 2012). " Intercambio y publicación de datos en el campo de la neuroimagen" . GigaScience . 1 (9): 9. doi : 10.1186/2047-217x-1-9 . PMC 3626511. PMID 23587272 .  
  17. Johnson GA, Badea A, Brandenburg J, Cofer G, Fubara B, Liu S, Nissanov J (noviembre de 2010). " Espacio Waxholm: una referencia basada en imágenes para coordinar la investigación del cerebro del ratón" . NeuroImage . 53 (2): 365–372 . doi : 10.1016/j.neuroimage.2010.06.067 . PMC 2930145. PMID 20600960 .  
  18. "Scalable Brain Atlas - Neuroanatomy at your fingertips" . scalablebrainatlas.incf.org . Consultado el 4 de diciembre de 2017 .
  19. "NineML" . Consultado el 4 de diciembre de 2017 .
  20. MUSIC, el Coordinador de Multisimulación , Centro Internacional de Coordinación de Neuroinformática (INCF), 14 de noviembre de 2017 , consultado el 4 de diciembre de 2017.
  21. "- Modelo de datos de neuroimagen" . Consultado el 4 de diciembre de 2017 .
  22. "KnowledgeSpace - Inicio" . knowledge-space.org . Consultado el 4 de diciembre de 2017 .
  23. "TrainingSpace - Inicio" . training.incf.org . Consultado el 24 de abril de 2018 .
  • Sitio web oficial
  • Congreso de Neuroinformática – 2019 (Varsovia, Polonia); 2018 (Montreal, Canadá); 2017 ; 2016 ; 2015 ; 2014 ; 2013 ; 2012 ; 2011 ; 2010 ; 2009 ; 2008
  • Consorcio de Revisión por Pares en Neurociencia
  • Van Essen, David (Primavera de 2007). "Un mensaje del presidente de la SfN, David Van Essen" . Neuroscience Quarterly . Archivado del original el 13 de julio de 2007.
Obtenido de " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=International_Neuroinformatics_Coordinating_Facility&oldid=1361123962 "