Caja de herramientas para el VIH

HIVToolbox es una aplicación de internet que ayuda a los científicos a identificar y desarrollar nuevas hipótesis, así como a facilitar la interpretación de experimentos, con el objetivo de ayudar a los científicos a comprender mejor el VIH , el virus que causa el SIDA , e identificar nuevas dianas farmacológicas potenciales. ^{[ 1 ]}

La información sobre el VIH incluye las diferentes partes de las proteínas del VIH, a menudo denominadas dominios. También están presentes en las proteínas del VIH regiones más pequeñas llamadas minimotivos. Estos minimotivos, también llamados motivos lineales cortos, codifican diferentes funciones moleculares en las proteínas del VIH. ^{[ 2 ]} HIVtoolbox es una aplicación de internet que se ejecuta a partir de una base de datos MySQL diseñada para integrar datos del VIH para secuencias de proteínas derivadas de muchos aislados diferentes, estructuras de proteínas , dominios de proteínas, interacciones proteína-proteína , elementos funcionales en proteínas y minimotivos conocidos y predichos de la base de datos Minimotif Miner . ^{[ 3 ] [ 4 ]} También se incluyen otros aminoácidos involucrados en funciones moleculares como la catálisis, la dimerización, etc. La base de datos del programa también contiene la conservación de aminoácidos calculada para todas las proteínas del VIH. Esto ayuda a identificar regiones del virus que no cambian, por lo que se cree que representan regiones importantes. La segunda versión de HIVToolbox, HIVToolbox2, también contiene información sobre las ubicaciones en las proteínas donde se unen los diferentes fármacos contra el VIH, y su relación espacial con las mutaciones que surgen en el VIH y que hacen que el virus sea resistente al fármaco.