Articulo de referencia

Matriz de glicanos

Las matrices de glicanos , [1] como la que ofrecen el Consorcio para la Glicómica Funcional (CFG), el Centro Nacional para la Glicómica Funcional (NCFG) y Z Biotech, LLC, contie...

Las matrices de glicanos , [1] como la que ofrecen el Consorcio para la Glicómica Funcional (CFG), el Centro Nacional para la Glicómica Funcional (NCFG) y Z Biotech, LLC, contienen compuestos de carbohidratos que se pueden analizar con lectinas, anticuerpos o receptores celulares para definir la especificidad de los carbohidratos e identificar ligandos. La detección de matrices de glicanos funciona de la misma manera que otras micromatrices que se utilizan, por ejemplo, para estudiar la expresión genética, las micromatrices de ADN o la interacción de proteínas, las micromatrices de proteínas .

Las matrices de glicanos están compuestas por varios oligosacáridos y/o polisacáridos inmovilizados en un soporte sólido en una disposición espacialmente definida. [2] Esta tecnología proporciona los medios para estudiar las interacciones entre glicanos y proteínas en un entorno de alto rendimiento. Estos glicanos naturales o sintéticos (ver síntesis de carbohidratos ) se incuban luego con cualquier proteína de unión a glicanos, como lectinas , receptores de la superficie celular o posiblemente un organismo completo, como un virus . La unión se cuantifica utilizando métodos de detección basados ​​en fluorescencia. Ciertos tipos de micromatrices de glicanos pueden incluso reutilizarse para múltiples muestras utilizando un método llamado borrado húmedo asistido por microondas. [3]

Aplicaciones

Las matrices de glicanos se han utilizado para caracterizar interacciones bioquímicas previamente desconocidas. Por ejemplo, las matrices de glicanos fotogeneradas se han utilizado para caracterizar las propiedades inmunogénicas de un tetrasacárido que se encuentra en la superficie de las esporas de ántrax . [4] Por lo tanto, la tecnología de matrices de glicanos se puede utilizar para estudiar la especificidad de las interacciones entre el huésped y el patógeno . [5]

En un principio, se demostró que las matrices de glicanos eran útiles para determinar la especificidad de la unión de la hemaglutinina (influenza) del virus de la influenza A al huésped y para distinguir entre diferentes cepas de gripe (incluida la aviar de la mamífera). Esto se demostró con matrices CFG [6], así como con matrices personalizadas [7] . Los puntos de referencia multiplataforma permitieron destacar el efecto de la presentación y el espaciado de los glicanos en la unión [8] .

Las matrices de glicanos se pueden combinar con otras técnicas como la resonancia de plasmones superficiales (SPR) para refinar la caracterización de la unión de glicanos . Por ejemplo, esta combinación permitió demostrar la unión de la heparina dependiente de calcio de la anexina A1 , que está involucrada en varios procesos biológicos, como la inflamación , la apoptosis y el tráfico de membranas . [9]

Referencias

  1. ^ Carroll GT, Wang D, Turro NJ, Koberstein JT (2006). "Micropatrones fotoquímicos de carbohidratos en una superficie". Langmuir . 22 (6): 2899–2905. doi :10.1021/la0531042. PMID  16519501.
  2. ^ Oyelaran O, Gildersleeve JC (octubre de 2009). "Matrices de glicanos: avances recientes y desafíos futuros". Curr Opin Chem Biol . 13 (4): 406–413. doi :10.1016/j.cbpa.2009.06.021. PMC 2749919. PMID 19625207  . 
  3. ^ Mehta, Akul Y; Tilton, Catherine A; Muerner, Lukas; von Gunten, Stephan; Heimburg-Molinaro, Jamie; Cummings, Richard D (14 de noviembre de 2023). "Microarreglos de glicanos reutilizables mediante un proceso de borrado húmedo asistido por microondas (MAWE)". Glicobiología . 34 (2). doi :10.1093/glycob/cwad091. PMC  10969520. PMID  37962922.
  4. ^ Wang D, Carroll GT, Turro NJ, Koberstein JT, Kováč P, Saksena R, Adamo R, Herzenberg LA, Herzenberg LA, Steinman L (2007). "Las matrices de glicanos fotogenerados identifican fracciones de azúcar inmunogénicas de Bacillus anthracis exosporium". Proteómica . 7 (2): 180–184. doi : 10.1002/pmic.200600478 . PMID  17205603.
  5. ^ Geissner A, Anish C, Seeberger PH (febrero de 2014). "Matrices de glicanos como herramientas para la investigación de enfermedades infecciosas". Curr Opin Chem Biol . 18 : 38–45. doi :10.1016/j.cbpa.2013.11.013. PMID  24534751.
  6. ^ Stevens J, Blixt O, Tumpey TM, Taubenberger JK, Paulson JC, Wilson IA (abril de 2006). "Estructura y especificidad del receptor de la hemaglutinina de un virus de influenza H5N1". Science . 312 (5772): 404–410. Bibcode :2006Sci...312..404S. doi :10.1126/science.1124513. PMID  16543414.
  7. ^ Childs RA, Palma AS, Wharton S, Matrosovich T, Liu Y, Chai W, Campanero-Rhodes MA, Zhang Y, Eickmann M, Kiso M, Hay A, Matrosovich M, Feizi T (septiembre de 2009). "Especificidad de unión al receptor del virus de la influenza pandémica A (H1N1) 2009 determinada por microarreglo de carbohidratos". Nat Biotechnol . 27 (9): 797–799. doi :10.1038/nbt0909-797. PMC 3771066 . PMID  19741625. 
  8. ^ Wang L, Cummings RD, Smith DF, Huflejt M, Campbell CT, Gildersleeve JC, Gerlach JQ, Kilcoyne M, Joshi L, Serna S, Reichardt NC, Parera Pera N, Pieters RJ, Eng W, Mahal LK (junio de 2014). "Comparación entre plataformas de formatos de microarrays de glicanos". Glycobiology . 24 (6): 507–17. doi :10.1093/glycob/cwu019. PMC 4001710 . PMID  24658466. 
  9. ^ Horlacher T, Noti C, de Paz JL, Bindschädler P, Hecht ML, Smith DF, Fukuda MN, Seeberger PH (abril de 2011). "La caracterización de la unión de glicanos de la anexina A1 revela la unión a glicanos altamente sulfatados con preferencia por el heparán sulfato y la heparina altamente sulfatados". Bioquímica . 50 (13): 2650–9. doi :10.1021/bi101121a. PMC 3068229 . PMID  21370880. 
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