Articulo de referencia

Gquímico

{{cite web |title=[ViewVC] Annotation of: ghemical/trunk/CHANGES |url=https://bioinformatics.org/cgi-bin/cvsweb.cgi/ghemical/trunk/CHANGES?view=markup&pathrev=2 |website=bioinfo...

Ghemical es un paquete de software de química computacional escrito en C++ y publicado bajo la Licencia Pública General de GNU . [ 3 ] El programa tiene una interfaz gráfica de usuario basada en GTK+2 y admite modelos de mecánica cuántica y mecánica molecular , con optimización de geometría, dinámica molecular y un amplio conjunto de herramientas de visualización. Ghemical depende de código externo para proporcionar los cálculos de mecánica cuántica  : MOPAC proporciona los métodos semiempíricos MNDO , MINDO , AM1 y PM3 , y los métodos MPQC basados ​​en cálculos de Hartree-Fock .

El sistema experto químico se basa en OpenBabel , que proporciona funcionalidades básicas como la tipificación de átomos, la generación de rotámeros y la importación/exportación de formatos de archivos químicos .

Véase también

Referencias

  1. " [ ViewVC ] Anotación de: ghemical/trunk/CHANGES" . bioinformatics.org .
  2. "gchemical" . bioinformatics.org .
  3. Hassinen, Tommi; Perakyla, Mikael (junio de 2001). "Nuevos términos de energía para modelos de proteínas reducidos implementados en un campo de fuerza fuera de la red". Journal of Computational Chemistry . 22 (12): 1229– 1242. doi : 10.1002/jcc.1080 . S2CID 5073249 . 
  • Página principal de Ghemical
  • Versión química que se conecta con GAMESS (EE. UU.)
  • Complemento Ghemical para Bioclipse
  • Una guía de Ghemical en finlandés (en finés)