Hispanopedia WikiLa captura de genes es un método de alto rendimiento que se utiliza para introducir mutaciones insercionales en el genoma de un organismo.
Método
El atrapamiento se realiza con vectores de captura de genes cuyo elemento principal es un casete de atrapamiento de genes que consiste en un gen reportero sin promotor y/o un marcador genético seleccionable , flanqueado por un sitio de empalme 3' aguas arriba (aceptor de empalme; SA) y una secuencia de terminación transcripcional aguas abajo (secuencia de poliadenilación ; poliA).
Cuando se inserta en un intrón de un gen expresado, el casete de la trampa génica se transcribe a partir del promotor endógeno de ese gen en forma de una transcripción de fusión en la que el o los exones aguas arriba del sitio de inserción se empalman en el marco del gen marcador/reportero seleccionable. Dado que la transcripción se termina prematuramente en el sitio de poliadenilación insertado, la transcripción de fusión procesada codifica una versión truncada y no funcional de la proteína celular y del gen marcador/reportero seleccionable. Por lo tanto, las trampas génicas inactivan y notifican simultáneamente la expresión del gen atrapado en el sitio de inserción, y proporcionan una etiqueta de ADN (etiqueta de secuencia de trampa génica, GTST) para la rápida identificación del gen alterado . [1] [2]
Acceso
El Consorcio Internacional de Trampas Genéticas está centralizando los datos y suministrando líneas celulares modificadas. [3]
Referencias
- ^ Cobellis, G; Nicolaus, G; et al. (2005). "Etiquetado de genes con sitios de intercambio de casetes". Nucleic Acids Res . 33 (4): e44. doi :10.1093/nar/gni045. PMC 552971 . PMID 15741177.
- ^ De-Zolt, S; Schnutgen, F; et al. (2006). "Captura de alto rendimiento de genes de la vía secretora en células madre embrionarias de ratón". Nucleic Acids Res . 34 (3): 25. doi :10.1093/nar/gnj026. PMC 1369290 . PMID 16478711.
- ^ "IGTC, Consorcio Internacional de Trampas Genéticas". www.genetrap.org . Consultado el 11 de febrero de 2018 .
Lectura adicional
- Gossler A, Joyner AL, Rossant J, Skarnes WC (abril de 1989). "Células madre embrionarias de ratón y construcciones de reporteros para detectar genes regulados por el desarrollo". Science . 244 (4903): 463–5. doi :10.1126/science.2497519. PMID 2497519.
- von Melchner H, Ruley HE (agosto de 1989). "Identificación de promotores celulares mediante el uso de una trampa de promotores de retrovirus". Journal of Virology . 63 (8): 3227–33. doi :10.1128/JVI.63.8.3227-3233.1989. PMC 250892 . PMID 2545900.
- Friedrich G, Soriano P (septiembre de 1991). "Trampas promotoras en células madre embrionarias: un análisis genético para identificar y mutar genes de desarrollo en ratones". Genes & Development . 5 (9): 1513–23. doi : 10.1101/gad.5.9.1513 . PMID 1653172.
- Zambrowicz BP, Friedrich GA, Buxton EC, Lilleberg SL, Person C, Sands AT (abril de 1998). "Alteración e identificación de secuencias de 2000 genes en células madre embrionarias de ratón". Nature . 392 (6676): 608–11. doi :10.1038/33423. PMID 9560157. S2CID 4329895.
- Wiles MV, Vauti F, Otte J, Füchtbauer EM, Ruiz P, Füchtbauer A, Arnold HH, Lehrach H, Metz T, von Melchner H, Wurst W (enero de 2000). "Establecimiento de una biblioteca de etiquetas de secuencias de trampas genéticas para generar ratones mutantes a partir de células madre embrionarias". Nature Genetics . 24 (1): 13–4. doi :10.1038/71622. PMID 10615117. S2CID 29505338.
- Stanford WL, Cohn JB, Cordes SP (octubre de 2001). "Mutagénesis con trampas genéticas: pasado, presente y más allá". Nature Reviews Genetics . 2 (10): 756–68. doi :10.1038/35093548. PMID 11584292. S2CID 11468334.
- Skarnes WC, von Melchner H, Wurst W, Hicks G, Nord AS, Cox T, Young SG, Ruiz P, Soriano P, Tessier-Lavigne M, Conklin BR, Stanford WL, Rossant J (junio de 2004). "Un recurso público de trampas genéticas para la genómica funcional del ratón". Nature Genetics . 36 (6): 543–4. doi :10.1038/ng0604-543. PMC 2716026 . PMID 15167922.
- Hansen J, Floss T, Van Sloun P, Füchtbauer EM, Vauti F, Arnold HH, Schnütgen F, Wurst W, von Melchner H, Ruiz P (agosto de 2003). "Un enfoque de mutagénesis a gran escala impulsada por genes para el análisis funcional del genoma del ratón". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 100 (17): 9918–22. doi : 10.1073/pnas.1633296100 . PMC 187885 . PMID 12904583.
- Zambrowicz BP, Abuin A, Ramirez-Solis R, Richter LJ, Piggott J, BeltrandelRio H, et al. (noviembre de 2003). "La deficiencia de la quinasa Wnk1 reduce la presión arterial en ratones: una prueba de detección de genes para identificar objetivos potenciales para la intervención terapéutica". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 100 (24): 14109–14. doi : 10.1073/pnas.2336103100 . PMC 283554 . PMID 14610273.
- Schnütgen F, De-Zolt S, Van Sloun P, Hollatz M, Floss T, Hansen J, Altschmied J, Seisenberger C, Ghyselinck NB, Ruiz P, Chambon P, Wurst W, von Melchner H (mayo de 2005). "Producción de alelos multipropósito en todo el genoma para el análisis funcional del genoma del ratón". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 102 (20): 7221–6. doi : 10.1073/pnas.0502273102 . PMC 1129123 . PMID 15870191.
- Springer PS (julio de 2000). "Trampas genéticas: herramientas para el desarrollo y la genómica de las plantas". The Plant Cell . 12 (7): 1007–20. doi :10.2307/3871251. JSTOR 3871251. PMC 149045 . PMID 10899970.
Enlaces externos
