Sistema de información geográfica GenGIS

GenGIS ^[1] fusiona datos geográficos, ecológicos y filogenéticos de la biodiversidad en un único entorno interactivo de visualización y análisis. Una característica clave de GenGIS es la prueba de ejes geográficos que pueden corresponder a rutas de migración o gradientes que influyen en la similitud de las comunidades. ^[2] Los datos también se pueden explorar utilizando resúmenes gráficos de datos sitio por sitio, como geofilogenias 3D o visualizaciones personalizadas desarrolladas utilizando un marco de complementos. Se proporcionan pruebas estadísticas estándar como regresión lineal y Mantel, y se puede acceder al lenguaje estadístico R directamente dentro de GenGIS. Desde su lanzamiento, GenGIS se ha utilizado para investigar la filogeografía de virus y bacteriófagos, bacterias y eucariotas.

Véase también

Referencias

^ Parks, DH; Porter M; Churcher S; Wang S; Blouin C; Whalley J; Brooks S; Beiko RG (2009). "GenGIS: Un sistema de información geoespacial para datos genómicos". Genome Research . 19 (10): 1896–1904. doi :10.1101/gr.095612.109. PMC 2765287 . PMID 19635847.
^ Parks, DH; Beiko RG (2009). "Visualizaciones cuantitativas de datos organizados jerárquicamente en un contexto geográfico". 2009 17.ª Conferencia Internacional sobre Geoinformática . pp. 1–6. doi :10.1109/GEOINFORMATICS.2009.5293552. ISBN 978-1-4244-4562-2. Número de identificación del sujeto 22986133. {{cite book}}: |journal=ignorado ( ayuda )

Enlaces externos

Página de inicio de GenGIS

[Parks2009-1] Parks, DH; Porter M; Churcher S; Wang S; Blouin C; Whalley J; Brooks S; Beiko RG (2009). "GenGIS: Un sistema de información geoespacial para datos genómicos". Genome Research . 19 (10): 1896–1904. doi :10.1101/gr.095612.109. PMC 2765287 . PMID 19635847.

[ParksBeiko2009-2] Parks, DH; Beiko RG (2009). "Visualizaciones cuantitativas de datos organizados jerárquicamente en un contexto geográfico". 2009 17.ª Conferencia Internacional sobre Geoinformática . pp. 1–6. doi :10.1109/GEOINFORMATICS.2009.5293552. ISBN 978-1-4244-4562-2. Número de identificación del sujeto 22986133. {{cite book}}: |journal=ignorado ( ayuda )