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Articulo de referencia

GIPC3

La proteína GIPC3, que contiene un dominio PDZ, está codificada en humanos por el gen GIPC3 . [ 5 ] [ 6 ] GIPC3 pertenece a la familia de genes GIPC (proteína C-terminal que int...

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La proteína GIPC3, que contiene un dominio PDZ, está codificada en humanos por el gen GIPC3 . [ 5 ] [ 6 ] GIPC3 pertenece a la familia de genes GIPC (proteína C-terminal que interactúa con GAIP), que también incluye GIPC1 y GIPC2 . [ 7 ] La proteína codificada, GIPC3, presenta un dominio PDZ central , flanqueado a cada lado por un único dominio de homología GIPC. [ 8 ]

Función

Se cree que GIPC3 es importante para la adquisición y propagación de la señal acústica en las células ciliadas de la cóclea de los mamíferos .

Gene

El gen humano GIPC3 se localiza en el brazo corto del cromosoma 19, en la posición p13.3. El locus abarca aproximadamente 8  kbp y contiene seis exones codificantes que dan lugar a un marco de lectura abierto de 639 nucleótidos que codifica la proteína GIPC3 de 312 aminoácidos . Un único dominio PDZ se encuentra en la posición 122-189. En el ratón, Gipc3 se localiza en el cromosoma 10 , en la banda citogenética qC1. La región genómica abarca 5,5  kbp. Los seis exones codificantes codifican una proteína de 297 aminoácidos. El dominio PDZ se encuentra en la posición 107-174.

Genética

En el ratón, una mutación de sentido erróneo en Gipc3 (c.343G>A) conduce a un reemplazo de aminoácido no sinónimo (p.G115R) en el bucle que conecta dos hebras beta del dominio PDZ. La glicina 115 está conservada en todas las proteínas GIPC. [ 9 ] Las mutaciones de sentido erróneo (c.785C>T; p.  L262R) y sin sentido (c.903G>A, p.W301X) en GIPC3 humano causan deficiencia auditiva neurosensorial congénita en familias que segregan pérdida auditiva no sindrómica DFNB15 y DFNB95.

Fenotipos

Los ratones de la cepa Black Swiss desarrollan una pérdida auditiva neurosensorial de inicio temprano y progresión lenta. Un estudio genético identificó dos loci de rasgos cuantitativos (QTL) que controlan la función auditiva. Un QTL, denominado pérdida auditiva relacionada con la edad 5 ( ahl5 ), se localiza en el cromosoma 10 y explica aproximadamente el 60% de la variación en los umbrales auditivos. Un segundo QTL, ahl6 , se localiza en el cromosoma 18 y tiene un tamaño de efecto menor. [ 10 ] Además de su deficiencia auditiva, los ratones Black Swiss también son hipersensibles a la estimulación acústica, reaccionando con convulsiones (convulsiones audiogénicas) al ruido blanco fuerte . [ 11 ] Se identificó un locus genético que confiere susceptibilidad (convulsiones monogénicas audiogénicas juveniles1, jams1 ) en el cromosoma 10. Un enfoque de clonación posicional destinado a descifrar la base genética tanto de la pérdida auditiva como de la susceptibilidad a las convulsiones audiogénicas identificó posteriormente la sustitución de glicina por arginina en Gipc3 como la causa subyacente.

En los seres humanos, los individuos con la mutación de cambio de sentido p.W301X (DFNB95) presentan pérdida auditiva neurosensorial bilateral con cambios en el umbral  auditivo de 70-80 dB a partir de los 11 meses de edad.

Interacciones

El dominio PDZ de las proteínas de la familia GIPC interactúa con: [ 7 ]

  • Receptor WNT de la clase Frizzled-3 ( FZD3 ),
  • receptor del factor de crecimiento similar a la insulina I ( IGF1R ),
  • receptor tirosina quinasa TrkA ,
  • Receptor tipo III de TGF-beta ( TGF-beta RIII ),
  • integrina alfa6A ( ITGA6 ),
  • glicoproteína transmembrana TPBG y
  • RGS19 /RGS-GAIP.

Véase también

  • Familia que contiene el dominio PDZ de GIPC, miembro 1, GIPC1
  • Familia que contiene el dominio PDZ de GIPC, miembro 2, GIPC2

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000179855 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000034872 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ "Gen Entrez: familia que contiene el dominio PDZ GIPC" .
  6. ↑ Saitoh T, Mine T, Katoh M (marzo de 2002). "Clonación molecular y caracterización de GIPC3 humano, un nuevo gen homólogo a GIPC1 y GIPC2 humanos". Int. J. Oncol . 20 (3): 577–82 . doi : 10.3892/ijo.20.3.577 . PMID 11836571 . 
  7. 1 2 Katoh M (junio de 2002). "Familia de genes GIPC (revisión)". Int. J. Mol. Med . 9 (6): 585– 9. doi : 10.3892/ijmm.9.6.585 . PMID 12011974 . 
  8. ↑ Katoh, M. (2002). "Familia de genes GIPC (Revisión)". International Journal of Molecular Medicine . 9 (6): 585– 589. doi : 10.3892/ijmm.9.6.585 . PMID 12011974 . 
  9. ↑ Charizopoulou N, Lelli A, Schraders M, Ray K, Hildebrand MS, Ramesh A, Srisailapathy CR, Oostrik J, Admiraal RJ, Neely HR, Latoche JR, Smith RJ, Northup JK, Kremer H, Holt JR, Noben-Trauth K (febrero de 2011). " Mutaciones de Gipc3 asociadas con convulsiones audiogénicas y pérdida auditiva neurosensorial en ratones y humanos" . Nat Commun . 2 (2) 201. Bibcode : 2011NatCo...2..201C . doi : 10.1038/ncomms1200 . PMC 3105340. PMID 21326233 .  
  10. ↑ Drayton, M.; Noben-Trauth, K. (2006). "Mapeo de loci de rasgos cuantitativos para la pérdida auditiva en ratones Black Swiss" . Hearing Research . 212 ( 1–2 ): 128–139 . doi : 10.1016/j.heares.2005.11.006 . PMID 16426780. S2CID 23928550 .  
  11. ↑ Misawa, H.; Sherr, EH; Lee, DJ; Chetkovich, DM; Tan, A.; Schreiner, CE; Bredt, DS (2002). " Identificación de un locus monogénico (jams1) que causa convulsiones audiogénicas juveniles en ratones" . Journal of Neuroscience . 22 (23): 10088– 10093. doi : 10.1523/JNEUROSCI.22-23-10088.2002 . PMC 6758732. PMID 12451109 .  

Lecturas adicionales

  • Vega A, Salas A, Milne RL, et  al. (2009). "Evaluación de nuevos SNP candidatos como factores de riesgo de baja penetrancia en cáncer de mama esporádico: un estudio de casos y controles español en dos etapas". Gynecol. Oncol . 112 (1): 210– 4. doi : 10.1016/j.ygyno.2008.09.012 . PMID 18950845 . 
  • Matsuoka S, Ballif BA, Smogorzewska A, et  al. (2007). "Análisis de sustratos de ATM y ATR revela extensas redes de proteínas que responden al daño del ADN". Science . 316 (5828): 1160– 6. Bibcode : 2007Sci...316.1160M . doi : 10.1126/science.1140321 . PMID 17525332 . S2CID 16648052 .