Articulo de referencia

FAM83H

FAM83H es una proteína codificada en humanos por el gen FAM83H . También se la conoce como proteína no caracterizada FAM83H . FAM83H se localiza en el núcleo . Se cree que desem...

FAM83H es una proteína codificada en humanos por el gen FAM83H . También se la conoce como proteína no caracterizada FAM83H . FAM83H se localiza en el núcleo . Se cree que desempeña un papel en el desarrollo estructural y la calcificación del esmalte dental .

Gene

Ubicación

Localización de FAM83H en el cromosoma 8

El gen FAM83H se localiza en el brazo largo del cromosoma 8 (8q24.3), comenzando en la posición 143723933 y terminando en la 143738030. El gen FAM83H abarca 14097 pares de bases y se encuentra orientado en la cadena -. La región codificante está compuesta por 5604 pares de bases y 5 exones. [ 5 ]

Expresión

Tejido donde se ha encontrado FAM83H, así como la concentración

FAM83H se expresa de forma ubicua en todo el cuerpo humano a niveles relativamente bajos. [ 6 ] [ 7 ]

Variantes de transcripción

En los seres humanos, solo se conoce un producto principal del gen FAM83H. [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]

Homología

Parálogos

No existen parálogos de FAM83H. [ 11 ]

Ortólogos

A continuación se muestra una tabla de ortólogos de la proteína humana FAM83H. La tabla incluye ortólogos con parentesco cercano, intermedio y lejano.

ortólogos del gen humano FAM83H

Los ortólogos de la proteína humana FAM83H se enumeran arriba en orden descendente o fecha de divergencia y luego en orden ascendente de porcentaje de identidad. FAM83H está altamente conservada en todos los ortólogos, como lo demuestra una identidad del 40 % en el ortólogo menos similar. FAM83H ha evolucionado lenta y uniformemente a lo largo del tiempo. [ 12 ] [ 13 ]

Proteína

Propiedades generales

El peso molecular de FAM83H es de 127,1 kD y contiene 1179 aminoácidos . El punto isoeléctrico es 6,52. No hay grupos de carga positiva o negativa significativos en la proteína. Hay una secuencia de 21 ceros desde 254 hasta 275 y una secuencia de 24 ceros desde 420 hasta 444,1 [ 14 ].

Composición

La proteína FAM83H es rica en prolina , con un 10,32 % de proteína, y deficiente en asparagina , con solo un 1,1 %. La composición porcentual de cada aminoácido es bastante consistente entre los ortólogos de la proteína. El ortólogo más distante muestra la mayor variabilidad en su composición de aminoácidos.

Dominios

FAM83H posee dos dominios conocidos. El dominio PLDc_FAM83H ( dominio similar a la fosfolipasa ) se extiende desde la posición 17 hasta la 281 en FAM83H. Carece de la histidina funcionalmente importante, por lo que, si bien puede compartir una estructura similar, lo más probable es que carezca de actividad PLD. El dominio de unión a microtúbulos MIP-T3 se extiende desde la posición 909 hasta la 1176. [ 15 ]

FAM83H se fosforila intensamente tras su modificación. Se predicen 11 sitios de fosforilación. Existen dos motivos con alta probabilidad de ser sitios de sumoilación por modificación postraduccional . Los sitios de sumoilación participan en diversos procesos celulares, como el transporte nucleocitosólico, la regulación transcripcional y la estabilidad proteica. FAM83H carece de péptido señal.

Sitios de fosforilación predichos

Fam83H está compuesta principalmente por hélices alfa y estructuras aleatorias. Las hélices alfa constituyen la mayor parte de la proteína. Presenta un dominio transmembrana entre las posiciones 231 y 252. [ 16 ] [ 17 ]

dominio transmembrana
Estructura parcial predicha de FAM83H

Localización subcelular

La proteína FAM83H se dirige al núcleo . [ 18 ]

Proteínas que interactúan

Proteínas que interactúan con FAM83H. Cuanto más gruesa sea la línea, más fuerte será la interacción.

Se descubrió que FAM83H interactúa con WDR72 y MMP20 . [ 19 ] MMP20 es responsable de la degradación de la matriz extracelular y desempeña un papel en la remodelación tisular en los ameloblastos . Se cree que las mutaciones en WDR72 desempeñan un papel en la amelogénesis imperfecta.

Importancia clínica

Asociación de Enfermedades

Las personas que padecen amelogénesis imperfecta han perdido la función del gen FAM83H. [ 20 ] [ 21 ]

Referencias

  1. 1 2 3 ENSG00000273889 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000180921, ENSG00000273889 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000046761 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. "Base de datos de genes del NCBI" . NCBI.
  6. "Perfiles GEO" . Perfiles geográficos del NCBI.
  7. «Perfiles EST» . Perfiles NCBI EST.
  8. "Emsembl" . Vega.
  9. "Genecards" . La base de datos genética humana.
  10. "Aceview" . NCBI.
  11. "Genecards" . La base de datos genética humana.
  12. "BLAST" . NCBI.
  13. Hedges SB. "TimeTree" . Bioinformática.
  14. "SAPS" . Análisis estadístico de secuencias de proteínas, Biology Workbench.
  15. "NCBI Structure" . La base de datos genética humana.
  16. «PELÉ» . Centro de supercomputadoras de San Diego.
  17. "CHOFAS (Predicción de la estructura secundaria de PS)" . Chou-Fasman. Archivado del original el 11 de agosto de 2003. Consultado el 9 de mayo de 2015 .
  18. "PSORT II" . Expasy.
  19. "IntAct" . EMNL-EBI.
  20. "Base de datos de genes del NCBI" . NCBI.
  21. "Genecards" . La base de datos genética humana.

Lecturas adicionales

  • Kim JW, Lee SK, Lee ZH, et  al. (2008). "Mutaciones FAM83H en familias con amelogénesis imperfecta hipocalcificada autosómica dominante" . Am . J. Hum. Genet . 82 (2): 489– 94. doi : 10.1016/j.ajhg.2007.09.020 . PMC 2427219. PMID 18252228 .  
  • Ding Y, Estrella MR, Hu YY, et  al. (2009). "Fam83h está asociado con vesículas intracelulares y ADHCAI" . J. Dent. Res . 88 (11): 991–6 . doi : 10.1177/0022034509349454 . PMC 2835506. PMID 19828885 .  
  • Hart PS, Becerik S, Cogulu D, et  al. (2009). "Nuevas mutaciones FAM83H en familias turcas con amelogénesis imperfecta hipocalcificada autosómica dominante" . Clin . Genet . 75 (4): 401–4 . doi : 10.1111/j.1399-0004.2008.01112.x . PMC 4264522. PMID 19220331 .  
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996). "Normalización y sustracción: dos enfoques para facilitar el descubrimiento de genes" . Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 . 
  • Lee SK, Hu JC, Bartlett JD, et  al. (2008). "Espectro mutacional de FAM83H: la porción C-terminal es necesaria para la calcificación del esmalte dental" . Hum . Mutat . 29 (8): E95–9. doi : 10.1002/humu.20789 . PMC 2889227. PMID 18484629 .  
  • El-Sayed W, Shore RC, Parry DA, et  al. (2010). "Análisis ultraestructurales de dientes deciduos afectados por amelogénesis imperfecta hipocalcificada de una familia con una nueva mutación sin sentido Y458X FAM83H" . Cells Tissues Organs (Impreso) . 191 (3): 235– 9. doi : 10.1159/000252801 . PMC 4432877. PMID 20160442 .  
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et  al. (2002). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .  
  • Brandenberger R, Wei H, Zhang S, et  al. (2004). "La caracterización del transcriptoma dilucida las redes de señalización que controlan el crecimiento y la diferenciación de las células ES humanas". Nat . Biotechnol . 22 (6): 707– 16. doi : 10.1038/nbt971 . PMID 15146197. S2CID 27764390 .  
  • Wright JT, Frazier-Bowers S, Simmons D, et  al. (2009). "Variación fenotípica en la amelogénesis imperfecta asociada a FAM83H" . J. Dent. Res . 88 (4): 356– 60. doi : 10.1177/0022034509333822 . PMC 2754853. PMID 19407157 .  
  • Hyun HK, Lee SK, Lee KE, et  al. (2009). "Identificación de una nueva mutación FAM83H y microdureza de un molar afectado en la amelogénesis imperfecta hipocalcificada autosómica dominante". International Endodontic Journal . 42 (11): 1039– 43. doi : 10.1111/j.1365-2591.2009.01617.x . PMID 19825039 .