Banco de medicamentos

La base de datos DrugBank es una base de datos en línea completa y de libre acceso que contiene información sobre medicamentos y objetivos farmacológicos creada y mantenida por la Universidad de Alberta y el Centro de Innovación en Metabolómica ubicado en Alberta , Canadá. ^[1] Como recurso bioinformático y quimioinformático , DrugBank combina datos detallados sobre medicamentos (es decir, químicos, farmacológicos y farmacéuticos) con información completa sobre objetivos farmacológicos (es decir, secuencia, estructura y vía). ^[1]^[2] DrugBank ha utilizado contenido de Wikipedia ; ^[3] Wikipedia también suele tener enlaces a Drugbank, lo que plantea posibles problemas de informes circulares . ^[3]

El sitio web DrugBank Online está disponible para el público como un recurso de libre acceso. Sin embargo, el uso y la redistribución del contenido de DrugBank Online o de los datos subyacentes de DrugBank, en su totalidad o en parte, y para cualquier propósito, requiere una licencia. Los usuarios académicos pueden solicitar una licencia gratuita para determinados casos de uso, mientras que todos los demás usuarios requieren una licencia paga.

La última versión de la base de datos (versión 5.0) contiene 9591 entradas de fármacos, incluidos 2037 fármacos de moléculas pequeñas aprobados por la FDA , 241 fármacos biotecnológicos ( proteínas / péptidos ) aprobados por la FDA, 96 nutracéuticos y más de 6000 fármacos experimentales . ^[4] Además, 4270 secuencias de proteínas no redundantes (es decir, diana del fármaco/ enzima /transportador/portador) están vinculadas a estas entradas de fármacos. Cada entrada de DrugCard (Fig. 1) contiene más de 200 campos de datos, con la mitad de la información dedicada a datos del fármaco/químico y la otra mitad dedicada a datos de la diana del fármaco o de la proteína. ^[4]

Cuatro bases de datos adicionales, HMDB, ^[5] T3DB, ^[6] SMPDB ^[7] y FooDB también forman parte de un conjunto general de bases de datos metabolómicas / quimioinformáticas . HMDB contiene información equivalente sobre más de 40.000 metabolitos humanos, T3DB contiene información sobre 3100 toxinas y contaminantes ambientales comunes , SMPDB contiene diagramas de vías para casi 700 vías metabólicas humanas y vías de enfermedades, mientras que FooDB contiene información equivalente sobre ~28.000 componentes alimentarios y aditivos alimentarios .

Historial de versiones

La primera versión de DrugBank se publicó en 2006. ^[1] Esta versión temprana contenía información relativamente modesta sobre 841 medicamentos de moléculas pequeñas aprobados por la FDA y 113 medicamentos biotecnológicos. También incluía información sobre 2133 dianas farmacológicas. La segunda versión de DrugBank se publicó en 2009. ^[2] Esta versión muy ampliada y mejorada de la base de datos incluía 1344 medicamentos de moléculas pequeñas aprobados y 123 medicamentos biotecnológicos, así como 3037 dianas farmacológicas únicas. La versión 2.0 también incluía, por primera vez, medicamentos retirados del mercado y drogas ilícitas , interacciones extensas entre alimentos y medicamentos y entre medicamentos, así como parámetros ADMET (absorción, distribución, metabolismo, excreción y toxicidad). La versión 3.0 se publicó en 2011. ^[8] Esta versión contenía 1424 medicamentos de moléculas pequeñas aprobados y 132 medicamentos biotecnológicos, así como >4000 dianas farmacológicas únicas. La versión 3.0 también incluía datos sobre transportadores de fármacos, rutas de fármacos, precios de fármacos, patentes y fabricación, así como datos sobre más de 5000 fármacos experimentales. La versión 4.0 se publicó en 2014. ^[4] Esta versión incluía 1558 fármacos de moléculas pequeñas aprobados por la FDA, 155 fármacos biotecnológicos y 4200 dianas farmacológicas únicas. La versión 4.0 también incorporaba información extensa sobre metabolitos de fármacos (estructuras y reacciones), taxonomía de fármacos, espectros de fármacos, constantes de unión de fármacos e información de síntesis de fármacos. La Tabla 1 proporciona un resumen estadístico más completo de la historia del desarrollo de DrugBank.

Alcance y acceso

Todos los datos de DrugBank proceden de fuentes públicas no exclusivas. Casi todos los datos son totalmente rastreables y tienen una referencia explícita a la fuente original. Los datos de DrugBank están disponibles a través de una interfaz web pública. ^[9]

Véase también

Referencias

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