Articulo de referencia

DiaGrid (red de computación distribuida)

DiaGrid es una gran red distribuida de computación para la investigación, con presencia en múltiples campus, que utiliza el sistema HTCondor y tiene su sede en la Universidad de...

DiaGrid es una gran red distribuida de computación para la investigación, con presencia en múltiples campus, que utiliza el sistema HTCondor y tiene su sede en la Universidad de Purdue en West Lafayette, Indiana . En 2012, contaba con casi 43 000 procesadores, lo que representaba 301 teraflops de potencia de cálculo. DiaGrid recibió el premio Campus Technology Innovators Award de la revista Campus Technology [ 1 ] y el premio IDG InfoWorld 100 [ 2 ] en 2009, y se empleó en la conferencia de supercomputación SC09 en Portland, Oregón, para capturar casi 150 días de tiempo de cómputo para trabajos científicos. [ 3 ]

Fogonadura

DiaGrid es una colaboración entre Purdue, la Universidad de Indiana , la Universidad Estatal de Indiana , la Universidad de Notre Dame , la Universidad de Louisville , la Universidad de Nebraska , la Universidad de Wisconsin , los campus de Calumet y North Central de Purdue, y la Universidad de Indiana-Universidad de Purdue en Fort Wayne . Está diseñada para dar cabida a los ordenadores de otros campus a medida que se incorporan nuevos miembros. La parte correspondiente a Purdue, denominada BoilerGrid, es el sistema académico más grande de su tipo.

Gestión

DiaGrid está gestionado por Information Technology at Purdue (ITaP), la organización central de tecnología de la información en el campus de Purdue en West Lafayette, y por la unidad de computación para la investigación de ITaP, el Rosen Center for Advanced Computing, que también opera los superordenadores en clúster Steele , Coates , Rossmann, Hansen y Carter.

HTCondor

Mediante HTCondor , desarrollado en la Universidad de Wisconsin, DiaGrid aprovecha y gestiona los ciclos de computación de nodos de clústeres de computación de alto rendimiento, servidores, máquinas en laboratorios informáticos del campus y otros laboratorios, así como de ordenadores de oficina, que se encuentran inactivos o infrautilizados. Cuando un usuario local o una tarea programada necesita una máquina determinada, la tarea de HTCondor se detiene y se envía automáticamente a otro nodo de HTCondor lo antes posible. Si bien este modelo "oportunista" limita la capacidad de realizar procesamiento y comunicaciones en paralelo, un pool de HTCondor puede proporcionar a tareas seriales más pequeñas una gran cantidad de ciclos en muy poco tiempo. HTCondor —y, por extensión, DiaGrid— está diseñado para la computación de alto rendimiento y es excelente para barridos de parámetros, simulación de Monte Carlo o prácticamente cualquier aplicación serial. Algunas clases de tareas paralelas (maestro-trabajador) también pueden ejecutarse eficazmente mediante HTCondor.

Redes de contactos

Para aunar los recursos computacionales dispersos por Indiana y el Medio Oeste, DiaGrid aprovecha I-Light, la red estatal de fibra óptica de alta velocidad que conecta los campus de Indiana entre sí, con Internet y con redes nacionales de investigación como Internet2 y National LambdaRail . DiaGrid proporciona recursos computacionales a investigadores tanto en Open Science Grid como en el sistema Extreme Science and Engineering Discovery Environment de la Fundación Nacional de Ciencias de EE. UU. (anteriormente TeraGrid ).

Usos

DiaGrid y BoilerGrid han sido utilizados por investigadores en Purdue y otros lugares para una variedad de propósitos, [ 1 ] tales como imágenes de la estructura de virus a resoluciones casi atómicas, [ 4 ] [ 5 ] simular las primeras etapas de la formación del Sistema Solar, proyectar la confiabilidad del suministro eléctrico de Indiana, modelar la propagación de contaminantes del agua, discernir la estructura de moléculas de proteínas e identificar millones de nuevas formas potenciales de zeolitas , minerales de silicato ampliamente utilizados para catalizar reacciones químicas a escala industrial. [ 6 ] DiaGrid también se está utilizando para desarrollar técnicas de procesamiento de datos para el Telescopio de Sondeo Sinóptico Grande . Purdue agregó un portal basado en la web para el procesamiento de BLAST con DiaGrid en 2011.

  • http://www.dia-grid.org Archivado el 17 de febrero de 2010 en Wayback Machine
  • https://www.youtube.com/watch?v=CH_YHGYQl2g
  • http://campustechnology.com/articles/2009/07/22/campus-technology-innovators-awards-2009-high-performance-computing.aspx
  • http://markets.hpcwire.com/taborcomm.hpcwire/?GUID=10770002&Page=MediaViewer&ChannelID=3198
  • http://cloudcomputing.sys-con.com/node/1185883 Archivado el 16 de julio de 2011 en Wayback Machine
  • http://news.uns.purdue.edu/x/2008b/081118McCartneyPool.html Archivado el 16 de febrero de 2009 en Wayback Machine
  • https://web.archive.org/web/20110302201542/http://www.itap.purdue.edu/newsroom/detail.cfm?newsId=2298
  • http://www.cs.wisc.edu/htcondor/
  • http://www.itap.purdue.edu/
  • http://www.rcac.purdue.edu/

Referencias

  1. 1 2 Grush, Mary; Villano, Matt (28 de julio de 2009). "Premios Campus Technology Innovators 2009: Computación de alto rendimiento - Universidad de Purdue" . Campus Technology .
  2. "Los 100 mejores proyectos de TI de 2009" . InfoWorld, 23 de noviembre de 2009.{{cite journal}}: Para citar una revista se requiere |journal=( ayuda )
  3. "Cycle Computing y la Universidad de Purdue impulsarán un grupo de condores optimizado y dinámico en SuperComputing 2009" (Comunicado de prensa). 13 de noviembre de 2009.
  4. Jiang, Wen; et al. (28 de febrero de 2008). "Estructura de la cadena principal de la cápside del virus infeccioso e15 revelada por criomicroscopía electrónica" ( PDF) . Nature . 451 (7182): 1130– 1134. Bibcode : 2008Natur.451.1130J . doi : 10.1038/nature06665 . PMID 18305544. S2CID 205212346 .   
  5. Wu, Weimin; Jiang, Wen (30 de abril de 2008). "Condor en el procesamiento de imágenes de crio-EM" . Archivado del original el 25 de julio de 2011. Recuperado el 21 de enero de 2010 .
  6. Pophale, Ramdas; Cheeseman, Phillip A.; Deem, Michael W. (2011). "Una base de datos de nuevos materiales tipo zeolita". Physical Chemistry Chemical Physics . 13 (27): 12407– 12412. Bibcode : 2011PCCP...1312407P . doi : 10.1039/C0CP02255A . PMID 21423937 .