



Un dendrograma es un diagrama que representa un grafo de árbol . Esta representación diagramática se utiliza con frecuencia en diferentes contextos:
- En el agrupamiento jerárquico , ilustra la disposición de los clústeres producidos por los análisis correspondientes. [ 4 ]
- En biología computacional , muestra la agrupación de genes o muestras, a veces en los márgenes de los mapas de calor . [ 5 ]
- En filogenética , muestra las relaciones evolutivas entre varios taxones biológicos . En este caso, el dendrograma también se denomina árbol filogenético . [ 6 ]
El nombre dendrograma deriva de dos palabras griegas antiguas : δένδρον ( déndron ), que significa "árbol", y γράμμα ( grámma ), que significa "dibujo, figura matemática". [ 7 ] [ 8 ]
Ejemplo de agrupamiento
Para un ejemplo de agrupamiento, supongamos que cinco taxones (a) se han agrupado mediante UPGMA basándose en una matriz de distancias genéticas . El dendrograma de agrupamiento jerárquico mostraría una columna de cinco nodos que representan los datos iniciales (en este caso, taxones individuales), y los nodos restantes representan los clústeres a los que pertenecen los datos, con flechas que representan la distancia (disimilitud). La distancia entre clústeres fusionados es monótona, aumentando con el nivel de fusión: la altura de cada nodo en el gráfico es proporcional al valor de la disimilitud intergrupal entre sus dos descendientes (los nodos de la derecha representan observaciones individuales, todas representadas con altura cero).
Véase también
- Cladograma
- Matrices de distancia en filogenia
- Agrupamiento jerárquico
- MEGA , un programa gratuito para dibujar dendrogramas.
- yEd , un programa gratuito para dibujar y organizar automáticamente dendrogramas.
- Taxonomía
Referencias
Citas
- ↑ Swofford DL, Olsen GJ, Waddell PJ, Hillis DM (1996). "Inferencia filogenética". En Hillis DM, Moritz C, Mable BK (eds.). Sistemática molecular, 2.ª edición . Sunderland, MA: Sinauer. pp. 407–514 . ISBN 978-0-87893-282-5.
- ^ Van Soest R, Boury-Esnault N, Vacelet J, Dohrmann M, Erpenbeck D, De Voogd N, Santodomingo N, Vanhoorne B, Kelly M, Hooper J (2012). "Diversidad global de esponjas (Porifera)" . MÁS UNO . 7 (4) e35105. Código Bib : 2012PLoSO...735105V . doi : 10.1371/journal.pone.0035105 . PMC 3338747 . PMID 22558119 .
- ↑ Woese, Carl R. ; Kandler, O ; Wheelis, M (1990). "Hacia un sistema natural de organismos: propuesta para los dominios Archaea, Bacteria y Eucarya" (PDF) . Proc Natl Acad Sci USA . 87 (12): 4576– 4579. Bibcode : 1990PNAS...87.4576W . doi : 10.1073/pnas.87.12.4576 . PMC 54159 . PMID 2112744 .
- ↑ Everitt, Brian (1998). Diccionario de estadística . Cambridge, Reino Unido: Cambridge University Press. pág . 96. ISBN 0-521-59346-8.
- ↑ Wilkinson, Leland; Friendly, Michael (mayo de 2009). "La historia del mapa de calor de clústeres". The American Statistician . 63 (2): 179– 184. CiteSeerX 10.1.1.165.7924 . doi : 10.1198/tas.2009.0033 . S2CID 122792460 .
- ↑ "Árbol filogenético (biología)" . Enciclopedia Británica . Consultado el 22 de octubre de 2018 .
- ^ Bailly, Anatole (1 de enero de 1981). Abrégé du dictionnaire grec français . París: Hachette. ISBN 2-01-003528-3OCLC 461974285
- ↑ Bailly, Anatole. «Diccionario griego-francés en línea» . www.tabularium.be . Archivado del original el 18 de marzo de 2022. Consultado el 20 de octubre de 2018 .
Fuentes
Enlaces externos
- Dendrograma de iris : ejemplo de cómo usar un dendrograma para visualizar los 3 grupos del agrupamiento jerárquico usando el método "completo" frente a la categoría de especie real (usando R ).
- Árboles (estructuras de datos)
- Gráficos y diagramas estadísticos
- Dibujo de gráficos
- Análisis de clúster