Articulo de referencia

Amplificación genética

La amplificación genética se refiere a una serie de procesos naturales y artificiales mediante los cuales se incrementa el número de copias de un gen "sin un incremento proporci...

La amplificación genética se refiere a una serie de procesos naturales y artificiales mediante los cuales se incrementa el número de copias de un gen "sin un incremento proporcional en otros genes". [ 1 ]

Un fragmento de ADN o ARN que es la fuente y/o el producto de eventos de amplificación o replicación , ya sean naturales o artificiales , se denomina amplicón . [ 2 ]

Amplificación genética natural

Amplificación regulada por el desarrollo

En 1968, Donald D. Brown e Igor B. Dawid estudiaban el ADN ribosómico amplificado, el ADN que codifica los ARN ribosómicos 28S y 18S , y describieron la “amplificación génica específica” en ovocitos . [ 3 ] En este trabajo con ovocitos de anfibios, se encontraron copias adicionales de ADN ribosómico en la vesícula germinal; estas están asociadas con nucléolos extracromosómicos . [ 3 ] Se encontró que el ADN ribosómico amplificado estaba enriquecido en relación con el ADN nuclear total y en relación con el ADN homólogo a los ARN 4S y 5S. [ 3 ] Los autores encontraron evidencia de copias adicionales de ADN ribosómico en ovocitos de varios anfibios y también en un gusano equiuroideo y una almeja de surf . [ 3 ] Este artículo proporcionó algunas de las primeras evidencias de una alteración génica reversible y específica del tipo celular durante el desarrollo. [ 3 ]

Amplificación adaptativa bajo selección

En el marco de la selección natural o artificial , existen casos documentados en los que el aumento del número de copias de un gen mediante la amplificación génica incrementa la expresión de un gen objetivo o de resistencia; entre los casos más conocidos se incluyen la resistencia a los herbicidas en las plantas, o la resistencia a los fármacos o antimicrobianos en bacterias o levaduras.

Por ejemplo, en Saccharomyces cerevisiae , la resistencia al cobre está asociada con un mayor número de copias de CUP1 , que codifica una metalotioneína. [ 4 ] El nivel de resistencia al cobre es proporcional al número de copias de CUP1 , y el locus puede aparecer en copias repetidas en tándem. [ 4 ]

También existen numerosos ejemplos en los que las bacterias aumentan su resistencia mediante la amplificación de genes que codifican dianas farmacológicas, funciones de eflujo o enzimas modificadoras de antibióticos. En esta última categoría, se han documentado casos de resistencia al betalactámico ampicilina en los que cepas bacterianas se adaptaron a altos niveles del antibiótico mediante la amplificación del gen que codifica la enzima betalactamasa AmpC . [ 5 ]

En las plantas, existen numerosos ejemplos de amplificación genética para la tolerancia a herbicidas, en respuesta a las fuerzas selectivas de herbicidas como el glifosato . En condiciones de campo, después de repetidos tratamientos agrícolas y durante varios años, se ha observado una amplificación genómica de la EPSP sintasa en malezas resistentes al glifosato como el amaranto de Palmer , la kochia , la amaranthus tuberculatus , el pasto pata de gallo , el raigrás italiano y el pasto azul anual . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] La actividad enzimática de la enzima EPSP sintasa es inhibida por igual por el glifosato tanto en plantas resistentes como susceptibles, pero el número de copias relativas del gen codificante aumenta en las plantas resistentes al glifosato entre 5 veces y >160 veces, lo que resulta en un aumento significativo de la enzima objetivo del glifosato y permite que las malezas sobrevivan. [ 7 ] La amplificación del gen de la EPSP sintasa es uno de los principales mecanismos de resistencia al glifosato en malezas como resultado del aumento del número de copias y la expresión de la EPSP sintasa. [ 8 ]

A nivel genómico, la cantidad de ADN o el número de genes también puede aumentar dentro de un organismo a través de la duplicación génica , un mecanismo principal mediante el cual se genera nuevo material genético durante la evolución molecular . Las fuentes comunes de duplicaciones génicas que conducen a la amplificación génica incluyen la recombinación ectópica , los eventos de retrotransposición y el deslizamiento de la replicación . [ 9 ] Los eventos evolutivos o cromosómicos a mayor escala pueden implicar aneuploidía o poliploidía , y no se consideran típicamente como amplificación génica que conduce a un aumento de copias de un gen o región genómica específica.

Amplificación de ácidos nucleicos en laboratorio

En investigación o diagnóstico, la amplificación del ADN se puede realizar mediante métodos como:

Referencias

  1. " Amplificación genética: últimas investigaciones y noticias - Nature" . www.nature.com
  2. Graham Dellaire, Jason N Berman, Robert J. Arceci, eds., Genómica del cáncer: del laboratorio a la medicina personalizada (2014), pág. 205.
  3. 1 2 3 4 5 Brown, Donald D.; Dawid, Igor B. (1968). "Amplificación génica específica en ovocitos. Los núcleos de los ovocitos contienen réplicas extracromosómicas de los genes del ARN ribosómico". Science . 160 (3825): 272– 280. doi : 10.1126/science.160.3825.272 . PMID 4867987 . 
  4. 1 2 Fogel, S.; Welch, JW; Cathala, G.; Karin, M. (1983). "Amplificación genética en levaduras: el número de copias de CUP1 regula la resistencia al cobre". Current Genetics . 7 (5): 347– 355. doi : 10.1007/BF00445874 . PMID 24173415 . 
  5. Gross, Rotem; Yelin, Idan; Lázár, Viktória; Sen Datta, Manoshi; Kishony, Roy (2024). "Rutas evolutivas dependientes e independientes de la betalactamasa hacia la resistencia de alto nivel a la ampicilina" . Nature Communications . 15 (1) 5383. Bibcode : 2024NatCo..15.5383G . doi : 10.1038/ s41467-024-49621-2 . PMC 11199616. PMID 38918379 .  
  6. Powles, Stephen B. (2010). "La amplificación genética produce evolución de malezas resistentes al glifosato" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 107 (3): 955– 956. doi : 10.1073/pnas.0913433107 . PMC 2824278. PMID 20080659 .  
  7. 1 2 Gaines, Todd A.; Zhang, Wenli; Wang, Dafu; Bukun, Bekir; Chisholm, Stephen T.; Shaner, Dale L.; Nissen, Scott J.; Patzoldt, William L.; Tranel, Patrick J.; Culpepper, A. Stanley; Grey, Timothy L.; Webster, Theodore M.; Vencill, William K.; Sammons, R. Douglas; Jiang, Jiming; Preston, Christopher; Leach, Jan E.; Westra, Philip (2010). "La amplificación genética confiere resistencia al glifosato en Amaranthus palmeri " . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 107 (3): 1029– 1034. doi : 10.1073/pnas.0906649107 . PMC 2824275 . PMID 20018685 .  
  8. 1 2 Sudhakar, S.; Norsworthy, JK; Avent, T.; González-Torralva, F.; McElroy, S.; Butts, TR (2025). "Confirmación de la resistencia al glifosato en el pasto azul anual ( Poa annua ) mediante la duplicación de EPSPS en una rotación de soja y arroz" . Weed Science . 73 e9. doi : 10.1017/wsc.2024.86 .
  9. Zhang J (2003). "Evolución por duplicación genética: una actualización". Trends in Ecology & Evolution . 18 (6): 292– 8. doi : 10.1016/S0169-5347(03)00033-8 .
  10. "PCR" . Centro de Aprendizaje de Ciencias Genéticas, Universidad de Utah .
  11. Wiedmann, M (febrero de 1994). "Reacción en cadena de ligasa (LCR) - Descripción general y aplicaciones" . PCR Methods and Applications . 3 (4): S51–64. doi : 10.1101/gr.3.4.s51 . PMID 8173509 .