Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

Reemplazo conservador

Una sustitución conservativa (también llamada mutación conservativa , sustitución conservativa o sustitución homóloga ) es una sustitución de aminoácidos en una proteína que cam...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

Una sustitución conservativa (también llamada mutación conservativa , sustitución conservativa o sustitución homóloga ) es una sustitución de aminoácidos en una proteína que cambia un aminoácido dado por otro diferente con propiedades bioquímicas similares (por ejemplo, carga , hidrofobicidad y tamaño ). [ 1 ] [ 2 ]

Por el contrario, una sustitución radical , o reemplazo radical , es un reemplazo de aminoácidos que intercambia un aminoácido inicial por un aminoácido final con propiedades fisicoquímicas diferentes. [ 1 ]

Descripción

Alineamiento de secuencias múltiples , producido por ClustalO , de cinco proteínas histona H1 de mamíferos. Las secuencias corresponden a los aminoácidos de los residuos 120-180 de las proteínas. Los residuos conservados en todas las secuencias se resaltan en gris. Debajo de cada sitio (es decir, posición) del alineamiento de secuencias proteicas se muestra una clave que indica los sitios conservados (*), los sitios con sustituciones conservativas (:), los sitios con sustituciones semiconservativas (.) y los sitios con sustituciones no conservativas ( ). Esta clave utiliza PAM250 como medida de similitud. [ 3 ]

Existen 20 aminoácidos naturales, aunque algunos comparten características similares. Por ejemplo, la leucina y la isoleucina son hidrófobas ramificadas y alifáticas . Del mismo modo, el ácido aspártico y el ácido glutámico son residuos pequeños con carga negativa.

Aunque existen muchas maneras de clasificar los aminoácidos, a menudo se los agrupa en seis clases principales según su estructura y las características químicas generales de sus cadenas laterales (grupos R).

Las distancias fisicoquímicas buscan cuantificar la disimilitud intra e interclase entre aminoácidos basándose en sus propiedades medibles, y se han propuesto muchas medidas de este tipo en la literatura. [ 4 ] Debido a su simplicidad, dos de las medidas más utilizadas son las de Grantham (1974) [ 5 ] y Miyata et al (1979). [ 6 ] Por lo tanto, una sustitución conservativa es un intercambio entre dos aminoácidos separados por una pequeña distancia fisicoquímica. Por el contrario, una sustitución radical es un intercambio entre dos aminoácidos separados por una gran distancia fisicoquímica. [ 4 ]

Impacto en la función

Las sustituciones conservativas en las proteínas suelen tener un efecto más beneficioso sobre la función que las no conservativas. Este efecto reducido de las sustituciones conservativas también se observa en la presencia de diferentes sustituciones en la naturaleza. Las sustituciones no conservativas entre proteínas tienen muchas más probabilidades de ser eliminadas por la selección natural debido a sus efectos perjudiciales.

Véase también

Referencias

  1. 1 2 Zhang, Jianzhi (2000-01-01). "Tasas de sustituciones de nucleótidos no sinónimos conservadores y radicales en genes nucleares de mamíferos". Journal of Molecular Evolution . 50 (1): 56– 68. Bibcode : 2000JMolE..50...56Z . CiteSeerX 10.1.1.584.896 . doi : 10.1007/s002399910007 . ISSN 0022-2844 . PMID 10654260 . S2CID 15248867 .    
  2. ↑ Dagan, Tal; Talmor, Yael; Graur, Dan (2002-07-01). "Las proporciones de reemplazo de aminoácidos radicales a conservadores se ven afectadas por factores mutacionales y composicionales y pueden no ser indicativas de selección darwiniana positiva". Biología molecular y evolución . 19 (7): 1022– 1025. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a004161 . ISSN 0737-4038 . PMID 12082122 .  
  3. ↑ "Preguntas frecuentes sobre símbolos de Clustal" . Clustal . Archivado del original el 24 de octubre de 2016. Consultado el 8 de diciembre de 2014 .
  4. 1 2 Graur, Dan (3 de agosto de 2015). "Sustituciones radicales y conservadoras de aminoácidos" . Judge Starling . Recuperado el 11 de marzo de 2018 .
  5. ↑ Grantham, R. (1974-09-06). "Fórmula de diferencia de aminoácidos para ayudar a explicar la evolución de las proteínas". Science . 185 (4154): 862– 864. Bibcode : 1974Sci...185..862G . doi : 10.1126/science.185.4154.862 . ISSN 0036-8075 . PMID 4843792 . S2CID 35388307 .   
  6. ↑ Miyata, Takashi; Miyazawa, Sanzo; Yasunaga, Teruo (1979-03-01). "Dos tipos de sustituciones de aminoácidos en la evolución de las proteínas". Journal of Molecular Evolution . 12 (3): 219– 236. Bibcode : 1979JMolE..12..219M . doi : 10.1007/BF01732340 . ISSN 1432-1432 . PMID 439147 . S2CID 20978738 .