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Genómica completa

Complete Genomics es una empresa de ciencias biológicas que ha desarrollado y comercializado una plataforma de secuenciación de ADN para la secuenciación y el análisis del genom...

Complete Genomics es una empresa de ciencias biológicas que ha desarrollado y comercializado una plataforma de secuenciación de ADN para la secuenciación y el análisis del genoma humano. La empresa es una filial de propiedad absoluta de MGI .

Historia

Complete Genomics fue fundada en junio de 2005 por Clifford Reid, Radoje (Rade) Drmanac y John Curson. Clifford Reid fue presidente del consejo de administración, presidente y director ejecutivo de Complete Genomics antes de dejar la empresa en 2015 para fundar Genos, una empresa derivada de la división de consumo de Complete Genomics. [ 1 ] [ 2 ]

En febrero de 2009, Complete Genomics anunció que había secuenciado su primer genoma humano y enviado los datos de variantes resultantes a la base de datos del Centro Nacional de Información Biotecnológica . En noviembre de 2009, Complete Genomics publicó datos de secuenciación de tres genomas humanos en la revista Science . [ 3 ]

Los datos resultantes han respaldado la investigación en diversas áreas como el cribado de embriones , [ 4 ] la detección de relaciones genéticas, [ 5 ] [ 6 ] neurología , [ 7 ] envejecimiento , [ 8 ] una nueva enfermedad mendeliana con afectación neuromuscular y cardíaca, [ 9 ] trastornos alimentarios , [ 10 ] síndrome de Prader-Willi y autismo, [ 11 ] oftalmología , [ 12 ] y oncología . [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] En 2014, una colaboración entre la Universidad de Radboud (Países Bajos), el Centro Médico de la Universidad de Maastricht (Países Bajos), la Universidad Central del Sur (China) y Complete Genomics identificó las principales causas de discapacidad intelectual mediante la secuenciación del genoma completo. [ 18 ]

En 2016, Complete Genomics aportó más de 184 genomas humanos con fases definidas al Proyecto Genoma Personal de George Church . [ 19 ] En 2019, publicaron su nueva tecnología de lectura de fragmentos largos en un solo tubo (stLFR), que permite la construcción de moléculas de ADN largas a partir de lecturas cortas mediante un proceso combinatorio de codificación de barras de ADN. Permite la determinación de fases, la detección de variantes estructurales, el andamiaje y el ensamblaje de novo de genomas diploides rentable a partir de la tecnología de secuenciación de segunda generación . [ 20 ]

En marzo de 2013, Complete Genomics fue adquirida por BGI Group , una empresa de servicios genómicos en Shenzhen , Guangdong , China. [ 21 ] Tras la adquisición, Complete Genomics se trasladó a San José y en junio de 2018 pasó a formar parte de MGI. [ 22 ] MGI era una filial de BGI Group antes de su escisión y cotización en la Bolsa de Shanghái en 2022. [ 23 ]

Referencias

  1. "La startup de genómica de consumo Genos Research planea permitir a sus clientes explorar y compartir sus datos" . GenomeWeb . 13 de junio de 2016. Archivado del original el 2 de abril de 2019. Consultado el 15 de junio de 2019 .
  2. "Complete Genomics anuncia una misión actualizada y nuevas alianzas en su 18.º aniversario" . Noticias médicas . 15 de junio de 2023. Archivado del original el 11 de julio de 2023. Consultado el 15 de junio de 2023 .
  3. Drmanac R; Sparks, AB; Callow, MJ; Halpern, AL; Burns, NL; Kermani, BG; Carnevali, P.; Nazarenko, I.; Nilsen, GB; Yeung, G.; Dahl, F.; Fernandez, A.; Staker, B.; Pant, KP; Baccash, J.; Borcherding, AP; Brownley, A.; Cedeno, R.; Chen, L.; Chernikoff, D.; Cheung, A.; Chirita, R.; Curson, B.; Ebert, JC; Hacker, CR; Hartlage, R.; Hauser, B.; Huang, S.; Jiang, Y.; et al. (noviembre de 2009). "Secuenciación del genoma humano mediante lecturas de bases no encadenadas en nanoarreglos de ADN autoensamblables" . Science . 327 (5961): 78– 81. Bibcode : 2010Sci...327...78D . doi : 10.1126/science.1181498 . PMID 19892942 . S2CID 17309571 .   
  4. Winard R; et al. (2014). " Detección in vitro de embriones mediante secuenciación del genoma completo: ¿ahora, en el futuro o nunca?" . Hum Reprod . 29 (4): 842– 851. doi : 10.1093/humrep/deu005 . PMID 24491297 .  
  5. Li H; et al. (2014). "Estimación de relaciones a partir de datos de secuenciación del genoma completo" . PLOS Genet . 10 (1) e1004144. doi : 10.1371/journal.pgen.1004144 . PMC 3907355. PMID 24497848 .   
  6. Su SY; et al. (2012). "Detección de identidad por descendencia utilizando datos de secuenciación del genoma completo de próxima generación" . BMC Bioinformatics . 13 121. doi : 10.1186/1471-2105-13-121 . PMC 3403908. PMID 22672699 .   
  7. Bundo M (2014). "Aumento de la retrotransposición L1 en el genoma neuronal en la esquizofrenia" . Neuron . 81 (2): 306– 313. doi : 10.1016/j.neuron.2013.10.053 . PMID 24389010 . 
  8. Kai Y; et al. (2013). "El envejecimiento como acumulación acelerada de variantes somáticas: secuenciación del genoma completo de pares de gemelos monocigóticos centenarios y de mediana edad" . Twin Research and Human Genetics . 16 (6): 1026– 1032. doi : 10.1017/thg.2013.73 . hdl : 11370/15c5129b-16bd-4dd0-a72b-4ac667584928 . PMID 24182360 .  
  9. Wang K; et al. (2013). "La secuenciación de ADN/ARN del genoma completo identifica mutaciones truncadoras en RBCK1 en una nueva enfermedad mendeliana con afectación neuromuscular y cardíaca" . Genome Medicine . 5 (7) 67. doi : 10.1186/gm471 . PMC 3971341. PMID 23889995 .   
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  19. Peters, Brock A.; Drmanac, Radoje; Church, George M.; Estep, Preston W.; Zaranek, Alexander Wait; Vandewege, Ward; Connelly, Abram; Clegg, Tom; Agarwal, Misha R. (2016-12-01). "Las secuencias del genoma completo y los haplotipos experimentalmente faseados de más de 100 genomas personales" . GigaScience . 5 (1): 42. doi : 10.1186/s13742-016-0148-z . PMC 5057367. PMID 27724973 .  
  20. Peters, Brock A.; Drmanac, Radoje; Xu, Xun; Kristiansen, Karsten; Wang, Jian; Yang, Huanming; Alexeev, Andrei; Zhang, Wenwei; Dong, Yuliang (2019-05-01). "Cocodificación de barras eficiente y única de lecturas de secuenciación de segunda generación de moléculas de ADN largas que permite una secuenciación, haplotipado y ensamblaje de novo rentables y precisos" . Genome Research . 29 (5): 798– 808. doi : 10.1101/gr.245126.118 . ISSN 1088-9051 . PMC 6499310. PMID 30940689 .   
  21. Specter, Michael (6 de enero de 2014) The Gene Factory Archivado el 28 de octubre de 2014 en Wayback Machine The New Yorker, consultado el 28 de octubre de 2014
  22. brandonvd. "Sobre nosotros" . Complete Genomics . Consultado el 15 de junio de 2019 .
  23. Smyth, Jamie; Sevastopulo, Demetri (18 de abril de 2023). "Empresa china de genética apunta a EE. UU. a pesar de las tensiones políticas" . Financial Times . Archivado del original el 18 de abril de 2023. Consultado el 18 de abril de 2023 .
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